斉木楠雄は超能力者である。父・國春、母・久留美の間に生まれた彼は、赤ん坊の頃から非凡な能力を発揮していた。しかし両親の性格がかなりゆるかったおかげで、大事件になること無くすくすくと成長した。そして高校生になり数々の超能力を身につけて何の不自由もない夢の様な人生を送っていた・・・と思ったら大間違いで！？

体育の授業でドッジボールをやることに。子供じゃないんだから･･･と不満を漏らす生徒たちだったが、本気でやろうと、熱く鼓舞する学級委員の灰呂杵志。彼の暑苦しいプレイに盛り上がる一同をよそに、超能力がバレないよう早々に球に当たりに行く楠雄。しかし、なかなかアウトになれず気付けば灰呂と二人だけ。果たして、自称『ドッジの燃ちゃん』こと燃堂との勝負の行方は！？

楠雄がとある公園の人だかりの前を歩いていると、マジシャン姿の男・蝶野雨緑に声をかけられる。奇跡のイリュージョニストと名乗る彼のマジックを見ることになったのだが、楠雄は透視能力のおかげでことごとくマジックの種が見えてしまい楽しめない。一方盛り上がる観客を前に蝶野はメインイベントとして大掛かりなマジックに挑戦しようとするのだが！？

霊能力者を名乗る男・鳥束零太が楠雄の家にやってきた。彼は楠雄が超能力者であることを知り合いの幽霊に聞いて、弟子になるためにやってきたのだ。鳥束が持つ能力は、霊を視ることと話すことだけ。子供の頃から生きている人間と見分けがつかないくらいリアルに霊が視えるため、色々と苦労をしてきたのだという。そんな彼が超能力を身につけたい理由とは！？

放課後の学校。5時から始まるアニメの最終回を見逃さないように楠雄は一人下校していた。すると海藤が完成したばかりの秘密基地（アジト）を楠雄に見せようと校内を探しまわっていたため、道を変えることに。しかしその先には楠雄を探している灰呂の姿が。おまけに照橋や燃堂も楠雄を探しているようで、誰にも見つからず下校するのは難しい。果たしてこの包囲網から脱出し、無事アニメを見ることはできるのか！？

スーパーマーケットへコーヒーゼリーを買いに来た楠雄。普段食べている『1個138円のゼリー』と、破格な値段の『3個183円のゼリー』のどちらを買うべきか様々な思考を巡らせる。質より量か、量より質か。限られた小遣いの中で満足度が高い最適な答えは何か考える楠雄。頭の中で大量のコーヒーゼリーに囲まれた光景を思い浮かべ、いざ決断を下そうとした時、楠雄の目に飛び込んできたのは超高級ゼリーだった！！

「犬派か猫派か？」というよくある質問は、楠雄にとっては「どうでもいい」ものだった。なぜならば愛らしい容姿の犬や猫も、『透視』によって骨にしか見えない。また「犬は賢そう」「猫は甘えてくる」というようなイメージも、『テレパシー』で動物の心の中が分かるため、それが人間の勝手な思い込みであることを知っているからだ。そんな楠雄が、建物と建物の間に挟まって身動きの取れなくなった猫に遭遇して！？

体育の担当であり、生活指導も兼任する松崎先生。その厳しさから、大半の生徒に恐れられ、嫌われていた。そんな松崎先生に、校則違反だとストラップを没収された高橋。それは6時間も並んで買った貴重なものであり、しかも奪われた拍子に壊れてしまいショックを受ける。何とか仕返ししてやろうと、仲間と結託して、松崎をぎゃふんと言わせるある計画を立てる。しかし、それを楠雄が近くで聞いていて！？

トップアイドルの六神通と一緒にいるところを楠雄に見られてしまった照橋は、恋人同士だと楠雄に誤解されていたらどうしようと思い悩んでいた。一方、斉木家の居間ではテレビに登場した六神通を見て久留美が最近ファンになったとはしゃいでいた。するとドアのチャイムが鳴り訪問者が。久留美が出て行くと、なんとさっきまでテレビで見ていた六神本人が楠雄を訪ねてやってきて！？

今日の体育はスポーツテスト。普段はやり過ぎても誤魔化せるが、今回は結果が記録として残ってしまうため、楠雄にとっては1年で最も気を使う日であった。一方、いつにも増して燃えている灰呂。どうやら全力をぶつけられる相手、最強のライバルが見つかったらしい。その相手とは体力バカの燃堂。一方的に勝負を挑む灰呂は、燃堂に勝つことができるのか！？

楠雄は学校帰り、一人きりで泣いている子供・入達遊太を見つける。持っていた風船が木に引っかかってしまったらしい。風に煽られ風船が木から外れて空へ飛んで行こうとした瞬間、超能力で風船をキャッチ。遊太に渡し黙ってその場を去ろうとする・・・が、遊太は楠雄を自分の大好きなヒーロー『改造人間サイダーマン２号』だと思い込み、キラキラした目で楠雄の後をずっとついてくるようになってしまい！？

高校生活のメインイベントである修学旅行を来週に控え、浮足立つ楠雄のクラスメイト達。しかし瞬間移動ができる楠雄には旅行の楽しさは全く理解できなかった。灰呂から男女三人ずつ、六人の班を作るように言われていたものの、男子で決まっていないのは楠雄、燃堂、海藤だけ。おのずと一緒の班になるが、それを見越していた照橋と夢原はどうにか同じ班になるべく画策するのだが！？

鳥束の呼びかけで楠雄が浜辺で目を覚ます。すると、目の前にあったはずの、宿泊先のホテルがまるごと消えていた。取り乱す鳥束をよそに、なぜこんなことになったのか、そしてホテルを元に戻す方法を考える楠雄。すると突然大きな音を立てて古い沈没船が目の前に現れる。果たしてホテルはどこに行ってしまったのか！？その中にいるクラスメイト達の行方は！？

転校生が来るという話で盛り上がる楠雄のクラス。やって来たのは窪谷須亜蓮という名の地味な眼鏡男子だった。期待を裏切られ静かになるクラス。しかし、彼は本性を隠していた。その正体は、小さな頃から喧嘩にあけくれていたゴリゴリのヤンキーだったのだ。この転校を機に、ヤンキーを卒業してパンピーになり、勉強もして真面目に生きると心に誓った窪谷須だったが…！？

楠雄のクラスでは、一ヶ月後に迫った文化祭の出し物を決めるための話し合いが行われていた。一度は『校庭にあった面白い石』の展示に決まりかかったのだが、灰呂が猛抗議をする。その熱血ぶりに当てられ、内容を再考することになったのだが、灰呂からは5万羽の折鶴を折って展示しようという、拷問に近い提案が。流石についていけないクラスメイトたちは他の提案を次々に繰り出すのだが！？

照橋の兄・信が、妹のつれない態度を話しに、わざわざ楠雄の自宅までやってきた。と思いきや、本題は明日近所で撮影があるため、妹がロケ現場に近づかないようにと伝えてくれという依頼。面倒だが、照橋が業界人に目をつけられ芸能人になってしまえば、学校が毎日大騒ぎになってしまうと、しぶしぶ引き受ける楠雄。翌日学校で照橋に伝言を伝えると、お詫びと称したデートに誘われることに！？

海藤は学校へ向かう途中、路地に突っ立っている窪谷須を見つける。声をかけようとするが、強面の不良学生にぶつかった腹いせに絡まれており、その様子に思わず怯む。だが見てしまった以上助けなければならないと踵を返す海藤。だが、そこで見たものは、涼しい顔をして不良をボコボコにしている窪谷須の姿で…！？

久留美に料理を教わるため(という名目で)、斉木家を訪れる照橋。しかし緊張のために間違えて隣家のチャイムを押してしまう。警戒した様子で出てきた子供・遊太は照橋を見ると「怪しい人が来た」とすぐに奥に引っ込んで大人を呼びに行く。そこに現れたのは楠雄。照橋が来ることを察して、わざわざ隣家に避難していたのだ。楠雄と照橋と遊太。奇妙な3人の1日はどうなる！？

自宅から6時間以上かけて、母方の祖父母の家まで遊びに来た斉木一家。玄関で3人を出迎えたのは祖母・斉木久美だった。家にあがり居間の戸を開けると、そこには険しい表情で新聞を読む祖父・斉木熊五郎の姿が。明るい久美とは反対に、寡黙で無愛想な熊五郎。しかし実際は人前では絶対にデレない、ツン率99%のツンデレおじいちゃんだった！？

楠雄が学校の窓から外を眺めていると、背後から先輩に告白をしようか相談している女子の声が聞こえてきた。その告白相手はなんと鳥束！さらにヤツが女子たちに取り囲まれている姿も目撃する。全く考えられない光景だが、鳥束本人が言うには、文化祭でのライブの大成功をきっかけにモテるようになったのだという。あの楽器の弾けないバンドが大成功した理由とは！？

楠雄が野球場の近くを歩いていると、ボールが飛んできた。野球少年にスムーズに投げ返してやり、昔は超能力のコントロールが難しく、ボールを投げるだけでも苦労していたことを思い出す。その時、もう一度ボールが飛んできて楠雄の頭に直撃する。やれやれとまた投げ返す楠雄だが、今度はボールが空の彼方まで飛んでいってしまう。動揺する楠雄は、頭についている制御装置の片側の球体が無いことに気づくのだが！？

もうすぐ夏休みがやってくる。煩わしい奴らに邪魔される事のない一か月が間近に迫っていることが楽しみな楠雄。そんな彼を海藤と窪谷須がバイクの免許合宿に誘いにやって来る。しかし大切な休みを邪魔されたくない楠雄はその誘いを断る。すると今度は目良が怪しいバイトに誘いにやってくる。さらに灰呂、鳥束、照橋までやってきて！？

楠雄のクラスに転校生がやって来る。超巨大財閥『才虎グループ』の御曹司である才虎芽斗吏だ。初対面からあからさま過ぎるくらいの金持ちぶりを見せつける才虎。さらに態度も尊大でクラスメイトを見下し、逆らうヤツは金で買収、もしくは自身のＳＰの力で黙らせる。そんな彼がPK学園にやってきた目的は、なんと照橋を手に入れることだった！？

國春に「アメージンｇｏｏ!!」と変なポーズを見せられる楠雄。それは最近流行している人気のマジシャンが使っているポーズらしい。その人気ぶりを知らない楠雄に國春が見せた写真、そこに写っていたのは、あの蝶野雨緑とマイケルだった。その出世ぶりに感心していると、当人から単独マジックショーへの招待の手紙が届く。彼らの成長のほどはいかに！？