ＦＢＩニューヨーク（ＮＹ）支局では、夫を失ったマギー、中東系の“ＯＡ”ことジダンら精鋭捜査官たちが連携し、巨大都市ニューヨークならではの多種多様な凶悪犯罪を捜査。新シーズン第１話はトリプルクロスオーバーの第１部。元モデルの若い女性が頭を２発撃たれて殺される。彼女はある船上パーティーに参加していたと分かるが、そのパーティーが１０代の少女たちの売春に関係していた疑いが浮上し……。
その後もＦＢＩのチームは、国立公園の森でアフリカ系少年が首を刺されて殺されたことで発覚する連続殺人事件、女性の美術収集家がある夜の帰宅後に何者かに拉致された事件、ＮＹ市警のある分署の警官が射殺された事件などに挑むほか、捜査官たちのプライベートに関わる事件や、マギーの身に危険が迫る事件など盛りだくさん。
