ストーリーはルルーシュがギアスの力を与えられ、黒の騎士団の指揮官となり、成田山でブリタニア帝国軍を撃退するまで。
ルルーシュはブリタニア人でありながら日本人のレジスタンスを率いて、ブリタニアを滅ぼし、妹ナナリーが安全に暮らせる世界を作る目的を達成しようとする。極めて私的な怨恨と欲望が行動原理。
かつての親友スザクは日本人でありながらブリタニアの騎士へと成り上がり、ブリタニアを内側から変えようとする。
この二人の思想的対立、ねじれ構造的な立場の違いが、図式的だが非常に良い設定として物語の中核を成す。
世界観や設定のディテールによる雰囲気の良さだけでなく、ストーリーがちゃんと面白いのがコードギアスの良いところ。
