「ゴジラ]によって支配された地球を取り戻すため、地球へと帰還し、ゴジラに立ち向かう人類を描いた、アニメーション作第3弾。前作での武装要塞都市｢メカゴジラシティ｣と、怪獣映画の一新を図った内容とは異なり、今作では超次元の虚空の神｢ギドラ｣が登場。ギドラのキャラ設定がSF感満載で、神となる存在なのも良い。人智を超えた極上のバトル感、絶望感はあるが、VS怪獣作品としては、究極の生命体VS高次元怪獣の盛り上がりは一時で、主に人間ドラマが強く、加えて宗教観も強く、説明が多い内容にはなってます。総じて、ゴジラ映画でも稀な物語でもあるが、往年から描かれた人間の傲慢さや汚さ、貪欲さなど負の面を描いた内容でもある三部作。SF感は余分さを感じるが、アニメーションとしての迫力はある。結末の物足りなさは大きい。
