未知の宇宙生物ガウナの襲撃を受けた地球は壊滅し、生き残った人類は巨大宇宙船シドニアで放浪の旅に出た。しかし、ガウナの執拗な攻撃は続き、人類は衛士という巨大兵器を開発し対抗した。シドニアの地下深くで生まれ育った谷風は、育ての親の死を期に地上に上がり衛士隊に入隊する。幼少期から厳しい訓練を重ねてきた谷風は、衛士の操縦には抜きん出た力を持っていた…というお話。
人物から背景まで全てCGで描かれているので、最初は冷たい感じで違和感があるが、独創的なストーリー展開の面白さに、それを忘れてしまう。ガウナの設定から光合成をする人類など、奇抜な発想が無理なく物語に紡がれている。また、衛士隊の戦闘シーンのスピード感はCGならではのものである。
