海上自衛隊のイージス艦で一般人の見学ツアーが行われたが、実は他国のスパイが当ツアーに紛れ込むだろうと踏んだ自衛隊がその裏でスパイを捕らえようとしているのだった。未確認の船体が近付くも訓練だから〜と一般人に言い聞かせる隊員たち、いやツアー続行すな。スパイはイージス艦のデータを盗むが、コナンも同じデータを船長室から盗みアガサ博士に解析してもらう始末。最後には、蘭が犯人との戦闘によりライフジャケットなしで海に放り出されるのだが、多分1時間くらい誰もそのことに気付かず、蘭は流されに流されたのだがなんか見つかった。
