木下スグリは、小学3年生の女の子。元気な性格と運動神経の良さは男の子も顔負け!また、実はアクセサリー作りが大好きという女の子らしい一面も合わせ持つ。 ある日、スグリはアクセサリーの材料を買いに出かけると、道端でとても綺麗な石を拾う。ブレスレットにすると可愛い、と喜んでいると、行き倒れている動物らしきものを見つける……。 恐る恐る近づいてみると、それは、スグリの住む世界とは別のところにある、カピメシアの国から迷い込んだ王子様・カッピだった!!!
カピメシアへの帰り方を忘れてしまったカッピは、動物病院を営むスグリの家に居候することになる。 スグリは、動物病院から逃げ出した小鳥を偶然見つけて、カッピと協力してどうにか小鳥を捕まえる。しかし、そこにスグリのお父さんとお母さんが現れて…。
スグリのお母さんは、カッピにドーナッツをご馳走する。その御礼にと、カッピは家事のお手伝いをするのだが、失敗してばかり。それならば、魔法でお手伝いをしようとするが、魔法が暴走してしまい…。
スグリの親友の持田あんが、家を訪ねてくる。カッピ、スグリ、あんの三人で外出することに。スグリは、カッピの正体を隠すために、カッピに喋らないように言う。スグリがあんとの遊びに夢中になっている隙に、カッピは一人で公園に行ってしまう…。
スグリとカッピは、スグリの親友・持田あんの家に遊びにいくことに。あんの家は和菓子屋を営んでおり、カッピは和菓子を御馳走になる。その美味しさに、思わすスグリの母親が作ったドーナッツの事を忘れてしまうカッピ。それを聞いて、母親のドーナッツが一番美味しいと思っているスグリは…。
カッピのもとに、ある日手紙が届く。カピメシアの言葉で書かれたその手紙は、カッピの友人・ドクロッピからだった。ドクロッピは、カッピを公園に呼び出して決闘するつもりだ!公園にやってきたカッピは、ドクロッピと魔法で勝負をすることになるが…。
カッピとスグリで庭の手入れをしていると、そこに1通の手紙が届く。なんと、それはドクロッピから再び届いた果たし状だった!勝負を終えてドクロッピはカピメシアに帰ったが、そこでスグリはあることを思いつく…。
ご飯を家族みんなで食べたり、家のお手伝いをしたりと、木下家にすっかり馴染んだカッピ。そんなカッピに、スグリは得意の裁縫でプレゼントを作ってあげることにする。
ある朝、カッピはカピメシアの女の子に起こされる。まるでお嫁さんのようにカッピのことを世話しだす女の子。その子は、カッピを追いかけて人間界にやってきたホイッピだった!ホイッピは、カッピと仲の良いスグリのことが気になって…。
スグリは、将来どんな仕事に就きたいのか悩んでしまう。どんな仕事も面白そうで決められない、と迷っていると、それを聞いたカッピがスグリにある魔法を掛けてくれるのだが…。
ある日、カッピとスグリのもとに、カッピの妹・コバラがやってきた!コバラは、カピメシアで大人気のアニメ『怪盗カピバーラ』のまねっこをして、目に付くものをどれでも盗んでしまう。何でもかんでも盗んでしまうコバラだったけれども…。
用事があって一人でカピメシアに帰ったカッピ。人間界にもどってくると、雨が降っていたので公園で雨やどりをすることに。すると、そこに子猫がやってきて…。
ホイッピが、カッピに会いにやって来た。そこに、またまたカッピに勝負を挑みきたドクロッピも現れ、その上、コバラも鉢合わせしてしまう。みんなそれぞれ勝手なことをやりだして…。
スグリは、持田あんの兄・かしわに手作りの誕生日プレゼントを用意する。約束の時刻ギリギリでプレゼントが出来上がったので、スグリは大慌て。カッピを連れて、かしわの家に急いで向かうが、邪魔が入ってしまって…。
ホイッピは、シュシュブレスのせいでカッピがスグリのことを好いていると勘違い。カッピの気を引くために、スグリからシュシュブレスを奪おうとする。しかし、ひょんな事からシュシュブレスを野良猫に持ち去られてしまって…。
スグリは、お父さん、お母さん、カッピと一緒に、お父さんとお母さんの思い出の海に遊びに行くことに。しかし、ケガをした子犬が突然クリニックに運び込まれ、海に行くのが中止になってしまう。そこでスグリは・・・。
夏休み、家族でキャンプにやってきたスグリ。そこにはなぜかドクロッピもいて、一緒にカレーを食べることに。辛いカレーを食べたカッピは、突然暴走し始めた!どうやってカッピを捕まえるか、考えたスグリは・・・。
夏休みのキャンプ。スグリがカッピ、ドクロッピと森を散策していると、そこにはホイッピとコバラが。ホイッピとコバラがもっていた古い地図を見ながら、カピメシアに伝わる宝物を皆で宝探しを始めると・・・。
あんちゃんが店番をする和菓子屋さんにやってきた、スグリとカッピ。たくさんカキ氷を食べるため、カッピの魔法で小さくなった3人。カキ氷でお腹はいっぱいになったけど・・・。
いつものように、スグリの部屋でお腹をすかせているカッピ。スグリが持ってきたドーナツを食べて、2人の出会いや友達のこと、これまでの出来事を思い出していくけれど…。
郵便屋さんの愛犬ボナパルトを預かったスグリ。なかなか言うことを聞かないボナパルトを、カッピが魔法で人間に!人間になったボナパルトは、自分の気持ちを話し始めたけれど…。
みんなでお菓子コンテストに応募することになった、スグリとカッピ。だけどホイッピ、ドクロッピ、コバラはそれぞれケーキに魔法をかけてしまい、完成したケーキからは怪しい煙が上がって…。
ホイッピは、心に浮かべた思い出の中に入れるという「思い出玉」を持って、カッピに会いに来た。楽しいことを思い出そうとするカッピだけど、「思い出玉」に異変が起きて…。
大切なネックレスを持っていたスグリと、大好きなドーナツを持っていたカッピがぶつかって、ネックレスもドーナツも粉々に!2人はケンカをして、スグリは1人で遊びに行ってしまったけれど…。
風で飛ばされたTシャツを取るために、魔法を使おうとしたスグリとカッピ。だけど、シュシュブレスの石が黒く濁って、光らない!そこにホイッピ、ドクロッピ、コバラがやってきて…。
魔法が使えなくなったカッピは、カピメシアに帰ってしまった。カッピがいない生活に慣れず、寂しいスグリ。カッピにプレゼントしたかったマスコットをスグリが持っていると…。