月に移住した人々が作った王国（スフィア王国）と地球の間におこった戦争の傷が癒えず、両国が緊張状態にある近未来。月との唯一の窓口である「満弦ヶ崎中央連絡港市」に住む朝霧達哉は平凡だが充実した毎日をすごしていた。そんな彼の生活が、ある日突然一変する。月の王女が朝霧家にホームステイすることになったのだ。戸惑いの中、月の王女フィーナと対面する達哉。その瞬間、初めて会ったはずの月の王女に対して、達哉の胸に懐かしさがこみ上げてくるのだった。

フィーナのカテリナ学院への登校初日。気が気でないミアと麻衣を横目に達哉とさやかは落ちついた様子。 心配のあまりフィーナに付き添うことを願い出るミアであったが、フィーナに制せられしぶしぶ留守番をすることに。 月の王女ということでクラスメイト達から気兼ねされるフィーナであったが、徐々にクラスに溶け込んでゆく。そんな中、学院内をメイドが徘徊しているという噂が流れ――。

仁の勧めによりフィーナがトラットリア左門でウェイトレスをすることになった。 テキパキと仕事をこなすフィーナだが、仁にはそれが面白くない。フィーナが失敗して自分を頼ってくることを期待していたのだ。 目論見が外れた仁は、料理対決を提案、その対戦相手に菜月を指名する。初めは嫌がっていた菜月だが、仁の挑発に乗り、結局フィーナと料理対決をすることに。 月と地球のプライドを賭けた料理対決の幕が切って落とされるのだった。

夏が近いことを感じさせるある日のこと。川辺で思い出話をしていたフィーナ達は、溺れている子犬を発見する。 突然のことに戸惑う達哉と菜月。フィーナは躊躇せず子犬を助けようと川に飛び込むが、逆に溺れてしまう。 達哉の活躍により、無事フィーナと子犬は助けられるが、フィーナは意識を失ってしまう。このままではフィーナの命が危ない。フィーナを救うため達哉が人工呼吸をすることになる。

季節は夏真っ盛り。学院は夏休み、さやかも休暇をもらえたことから、朝霧家と鷹見沢家はカレンを加えて、海水浴へと繰り出すことに。 海がはじめてというミアは特に大はしゃぎ。フィーナも泳ぎの練習やスイカ割りなど海を満喫していたが、楽しい時間は突然終わりを告げる。 高野が用意したクルーザーが故障してしまい一行は無人島に漂着するのだった……。

夏休みも終わり学院もニ学期に突入。前にも増してお互いを意識するようになるフィーナと達哉。 その様子を朝霧家や鷹見沢家の面々は暖かく見守るのだったが、さやかだけは複雑な心境だった。 そしてもう一人、この事態を危惧する少女がいた。彼女は幾度となくフィーナ達と接触していた謎の少女リース。 彼女の中でもう一人の少女の声が響く。これ以上、二人の接近許すな、と……。

ギクシャクした関係になったフィーナと達哉。そんな中、フィーナが公務のため一時的に朝霧家を離れ大使館で生活することになった。 離ればなれになったことで互いの存在を再確認する二人。一週間後、久しぶりに朝霧家に戻ってきたフィーナは思いがけず達哉と対面する。 二人の間には新しい感情が芽生えようとするのだが、そのときすでに朝霧家の中には新しい困難が待ち構えているのだった。

お互い気持ちを確かめあったフィーナと達哉だったが、二人の前に立ちはだかる障害は多い。まずはカレンに二人の関係を認めてもらうべくその元を訪れる。 国王の信頼が厚いカレンに認められれば、国王を説得できると考えたからだ。はじめは二人の関係を認めることは出来ないと頑なな態度をとるカレンであったが、二人の熱意に押されある試練を課すことに。それに合格することができたなら、二人の仲を認めるというのだが…。

カレンからの試験に合格した二人は、周囲が恥かしくなるほどのあつあつぶり。 その二人を監視していたリースは、月と地球が接近する原因となる二人の関係を裂くべく直接行動することを決意する。 その頃、月ではカレンがフィーナと達哉の仲を認めてもらうべく国王に謁見するが、国王をはじめとする群臣の反対にあい、説得は失敗に終わる。 いったんその場を引くことになるカレンであったが……。

フィアッカからカレンが拘束されたことを知らされたフィーナは、自分のことでこれ以上達哉たちを傷つけないため、 全ての問題に決着をつけるべく月に戻ることを決意する。 フィーナが月へ発った後、昏睡状態だった達哉は目を覚ますが、フィーナが自分を置いて月に戻ったことを知り愕然とするのだった……。

月へ向かった達哉とカレンは、ユルゲンの讒言により、月王国から迎撃されることになってしまうが、内部からの協力を得てなんとか王国内への潜入に成功する。 一方、思惑通り計画が進まないことに業を煮やしたユルゲンは、フィーナにある取引を持ちかける。フィーナは達哉たちの身を案じ、取引に応じようするが……。

再会を果たすことができたフィーナと達哉。だが二人には、再会を喜び合う時間すらなかった。 一触即発の状態にある月と地球の危機をを回避すべく、ライオネス国王をはじめ月王国の重臣たちを説得しなければならないのだ。 はじめは二人の話を聞こうともしなかった国王たちだったが、二人の懸命な説得により、徐々に心を開いてゆく。 ついに、国王は地球との和解を決意するが、その瞬間、ユルゲンの嘲笑が広間に響きわたる…。