スパイキッズの気をそらす方法はないものかと考えるゴールデンブレイン。そんな時、IT担当者がワームに変身! アカデミーのメインフレームにしのびこむ。

お金がないゴールデンブレインはヘビメタミュージシャンのデスメタルに銀行ごうとうをさせる。そのかん高い声の破壊力(はかいりょく)は絶大だった!

迷信深いカルメンは自分にのろいがかかってしまったと思いこむ。計画を実行したいゴールデンブレインは燃料を作るための情報を手に入れようとしていた。

スパイ雑誌の表紙に選ばれ、完ぺきな顔になりたいと考えたエースは、医師のジェリコ先生を訪ねる。でも先生はゴールデンブレインとつながっていた。

アカデミー内からゴールデンブレインに情報を流しているスパイの"モグラ"がいる事を知ったスパイキッズ。カルメンとスコーピオンはおたがいを疑う。

気になる人からメッセージをもらったと思いこんだカルメンは、呼び出されたさばくへと向かう。しかしそこで待ち受けていたのはスワンプのわなだった。

ミッション・クリティカルがハイテクうそ発見器を使ってアカデミーの先生達を調べる。そのころジュニは昔のOSS本部で秘密のファイルを探していた。

あやしい行動をしていたフループにつめ寄るミッション・クリティカル。ジュニとスコーピオンはフループはモグラではないと証明しようとするが...。

ベストスパイ家族コンテストに出るためアカデミーにコルテス一家がそろう。でもジュニはパパがピノキノックスの発明者だとバレることを心配し...。

ついにピノキノックスが敵の手にわたってしまう。スワンプ本部に乗りこむミッション・クリティカル。果たしてゴールデンブレインを止められるのか!?