超伝導技術が収録されたディスクフロッピーが、謎の組織バイオロンに奪われた。ジバンの活躍によってフロッピーが敵の手に渡ることは防げたが、カメレノイドには逃げられてしまう。戦闘で受けた傷を修理するジバン。そこに東京中のコンピュータがウィルスに襲われ、同時に子供たちが行方不明になる事件発生の報告が！

無敵の機動刑事ジバンに対して、バイオロンが罠を張った。警視庁爆破の不適な作戦。計算されつくした陽動作戦に、正面から立ち向かうジバン。急げ！警視庁を救え!!

謎の霧が町を覆いつくした。そして起こる異常な事件。パニックに陥った町に急行した直人たちも、次々とその犠牲になっていく。恐るべき東京占領作戦を阻止せよ、ジバン！

殺された父親が残した研究を完成させ、次々と復讐を遂げていく娘。直人たちの必死の説得も関わらず、ユキは一人、悪の組織に立ち向かっていく。渦の中に巻き込まれたユキをガードせよ、ジバン！

ノーベル物理学者・板倉博士と未来型コンピュータ・ハリー。二つの頭脳をめぐる、正義と悪の攻防戦。レゾン、バイカンが、そしてスパイラスがうなりをあげて突進する！　戦え、ジバン！　スーパーコンピュータを守れ!!

世紀の大発見！　世界でただひとつの恐竜の卵に、バイオロンの魔の手が伸びてきた。必死に守る直人たち。激しい争奪戦の中で、恐竜の卵は一億年の眠りから今覚めようとする。

正体不明の風邪が大流行。不思議な男が撒き散らす強烈なウィルスに、次第に犯されていく子供たち。残された時間はわずか24時間。急げ、ジバン！　悪魔のウィルスを追い詰めろ!!

土地の買占めが続く町に怪事件が発生した。あちこちに掘られた穴から出る異常な物体。避難する人々の陰に潜む謎の人物の正体を追って、ジバンは敵の地下基地に潜入した。そこでジバンを待っていたものは…？

な、なんと！　小鳥が鶏に、ウサギが犬に、猫がライオンになってしまった！　バイオロンのウィルスを注入され、凶暴化する動物たち。ジバンは果たして動物たちを救うことができるのか?!

眠りの中に広がるメルヘン。大流行の「天才バンダナ」が作り出す楽しい夢が、ある夜、突然悪夢に変わった！　バンダナの秘密を追って、悪夢の中に飛び込んでいったジバンの目に映ったものは…果たして本物か?!

直人、危うし！　バイオノイドの攻撃を受けて、命を落としてしまうのか？　運命の大手術が始まった。直人の下に集まった、人物の正体は？　ジバン誕生の秘密が、今明らかにされる…。

洋子が罠に落ちた！誘拐され、秘密基地へと連れ込まれた洋子に、たった一人の孤独な戦いが待っていた。刻一刻と迫る危機！ジバンの新兵器、高機動システム･ウェポンダイダロスは果たして間に合うのか？！

狙われた直人。ふとしたきっかけで、傷ついた直人を救った親子に、恐るべき災いが降りかかった。罪のない親子は、もはや死を待つだけなのか？！怒りに燃えたジバンは、自分の命を駆けてその救出に向かった！

バイオロンがついにジバンの弱点を発見。人質救出に向かったジバンを待っていた、暗殺計画の罠。恐るべき電磁シャワーの攻撃を受け、次々とコンピュータを破壊されていくジバンに、最後の力は残っているのか？！真由美の必死の祈りが続く…。

静寂の中に浮かぶ、怪しい影。天才ピアニストにいったい何が起こったのか？不気味なピアノの調べを追ったジバンの前に、悪魔の賛美歌に操られた狼男が立ちふさがった。その正体は？！ジバンは、狼男の秘密を暴くことができるのか？

街の科学者がある薬を発明した。…はっ！体が消えた！透明人間が巻き起こす事件と、盗まれた透明薬を追うジバンの前に、今度は透明となったバイオノイドが現れた。姿の見えない敵をどう打ち倒すのか？

まゆみの母、静江が誘拐された。バイオロンは何を企んでいるのか？母の姿を追ったまゆみもまた、魔の手に落ちていった。バイオロンとの激しい戦いに望むジバン！人質の救出に成功したかに見えたとき、ジバンの前に何かが起こった！！

新司令官マッド・ガルボ。かつて見たことのないパワーに圧倒されるジバン。捕らえられたまゆみもまた、恐るべき拷問の末、地獄の底へと落ちていった…。どうすることもできないジバンに、バイオロン最大の攻撃が待っていた！

バイオノイドの秘密がこめられた小瓶。ふとしたきっかけで手にしたジバンに、バイオロンからの脅迫状が舞い込んだ。人質との交換を迫られるジバン。バイオロンの機密か、人質の命か？！苦悩するジバンに突きつけられた、対バイオロン法第3条とは？！

突如、空からお金が降ってきた。いったい誰が、何のために？！一転して大混乱に陥った街を捜索するジバン。と、その目の前にまゆみの姿が。まゆみと一緒にいた若者は誰か？まゆみの身に、何かの変化がおきていた…。

ある少女が飼っていた一匹の鈴虫に、恐るべき異変が起きた！強烈な毒素を持つゲリラ虫となって、人々を襲い始めたのだった。街に放たれた毒虫の、大量発生を阻止すべく、ジバンは毒虫の巣の中へ自ら飛び込んでいった！

まゆみを発見！急行した直人を迎える一人の少年。悲しみを秘めた少年とともにまゆみを探し始めた直人に、バイオロン最高のスナイパーが忍び寄っていた。まゆみの姿に後一歩と迫ったとき、悪魔の銃弾が、直人の体を打ち抜いた！

漫画家・星山リュウタロウをさらったヤギノイドバイオロンは、この世界から一冊残らず本を消そうとしていた。ジバンはリュウタロウの描くヤギノイドに打ち勝つことができるのか？

ジバンの正体が清志郎？！バイオロンのジバン追跡の魔の手は、なぜか清志郎に向かっていった。ジサツノイドが操る大霊界を強い心で打ち破れ！

セントラルシティ署に送られた爆破予告。厳戒体制の裏をかいて、予告どおり爆破されていく美術品。そこには一体どんな計画が隠されているというのか？次第にあせりの色を濃くするジバンに、最後の爆破予告が…。モナリザを守れ！！

浜名湖に美女が大集合！ピチピチギャルの水着コンテストが開かれた。しかし、そこにもバイオロンの魔の手が！若い女性のエキスを吸って、ついに目覚めるのかリュウノイド？すさまじい攻撃から脱出なるか？！

子供たちの様子が急におかしくなった。原因不明の病に犯され、親たちを、そしてジバンまでをも襲い始めたのだ。事件の裏にバイオロンの匂いをかぎつけたジバンは、そこに子供たちの恐ろしい秘密を見た。子供たちを救え！

ギバのそっくりさん現る！本物はどっちだ？！ふとした間違いが引き起こす大騒動。混乱に陥った撮影所に、ギバの姿を追い詰めたジバンと、バイオロンの激しい戦いが展開される。しかし、そこにもう一人…。果たしてバイオロンか、それとも？

日本中の若きエリート・お嬢様が大集合！バイオロンが仕組んだ集団お見合い作戦。次々と堕落していく若者たちに未来はあるのか？潜入した直人の怒りの鉄拳が飛ぶ。戦え、ジバン！若者たちを救え！！

踊りに賭ける父と子。その父がある日突然失踪した。一体何が起こったのか？懸命の捜索を続ける直人たち、罠を張って待ち構えるバイオロン。失踪の秘密を知ったジバンに、不気味な怪物の猛攻が！

怪事件発生！忽然と現れた忍者たち。忍法をマスターしたシノビノイドを相手に苦戦するジバン。だがそこに意外な強い味方が。…戸隠流正統・山地学！機動刑事と戸隠忍者が力をあわせて立ち向かう！

バイオロンに異変が！娘は一体何者か？どんな秘密が隠されているのか？娘の命を狙ったバイオロンの執拗な追撃をかわし、直人は悪の組織に咲いた一輪の花を、残り少ない命を、果たして守りきることができるのか？

バイオロンの大事件！マットガルボの中に秘められていた良心が蘇ってしまった。ギバの命令に背きジバンに味方するガルボに、ついに抹殺指令が下った！マッドガルボ対バイオロン…だが、そこには何かが、得体の知れない何かが隠されていた…。

直人たちを打ち破り、バイオロンは宇宙生命体を手に入れた。恐るべき力を得て、ジバンの攻撃を跳ね返すマッド･ガルボ！そしてバイオロンと手を組んだクイーンコスモの、かつて見たことのない攻撃を受けたジバンは、ついに……!!

バイオロンの全面攻撃が始まった。このまま地球は魔の手に落ちてしまうのか?!　ジバン復活の極秘マニュアルとは?　鍵を握るまゆみをさがせ！　恐怖と破壊の限りを尽くされ、未来の希望を失いかけた、そのとき……!!

バイオロンに誕生した、一風変わった怪物。チャンバラ映画の主人公になりきって、珍騒動を巻き起こす。怪物に立ち向かった洋子の姿を見たとき、事件は意外な方向へ。洋子の愛をかけて、壮烈な一騎打ちが始まった！

クイーンコスモのアジトにうごめく怪しい影。一体何が起ころうとしているのか?　得体の知れない恐怖を感じたジバンは、生命エネルギーを吸い取られ、ついにクイーンコスモの恐るべき分身を誕生させてしまった。どう戦うのか、ジバン!?

シティボーイの清志郎が田舎に引きこもってしまった。謎の胞子に体を蝕まれてしまった清志郎を追って、ジバンもまた、恐ろしい病原菌の餌食となっていく。バイオロンの計画に巻き込まれてしまった清志郎たちの運命は?　そして制御不能となってしまったジバンは果たして?!

ジバンの運命を握るまゆみがついに発見された。追い込まれたまゆみ。ジバン抹殺のため追跡に全力を挙げるバイオロン！　ジバンの必死の救出作戦もむなしく、良を失い、バイオロンの手中に落ちたまゆみは、ついに……！

清志郎の妹が上京してきた。だが彼女を迎えたのは、すべての時計が壊れてしまった、異常な町の光景だった。クイーンコスモの魔力に包み込まれ、混乱に陥った東京の真っ只中で、清志郎は妹に出会うことができるのか?!

恐ろしい威力を秘めた猛毒ウィルスが輸送中に消えた。事件を目撃した新米婦警にバイオロンの魔の手が……。ウィルスの悪用を防ぐべく、一人バイオロンに挑んだ彼女に刻一刻と死の時が迫る！

電気が盗まれた！　東京中の電気を集め、新しい怪物を誕生させようとするバイオロン。電気を奪われ音楽を失った若きロッカーたちが、決死の覚悟で怪物に立ち向かってた。若者たちの勇気は、果たして怪物に通じるのか?!

ジバン、暗殺！　意のままに操られた洋子の手で、恐るべき宇宙ウィルスがジバンに打ち込まれてしまった。次第にエネルギーを吸い取られていくジバンに、復活の道はあるのか?!　原因不明の熱に犯された洋子の命も、もはや……。

宇宙バイオが生み出した「眠り病」を撲滅すべく、世界最高の科学者がやってきた。ジバンの必死の護衛もむなしく、魔の手に落ちてしまった博士に異変が。博士の記憶がその体を抜け出してしまった。博士の頭脳は一体どこへ……？

黒煙を巻き上げて疾走する変な男。追跡するジバンを煙に巻き、奴は一体何のために事件を起こすのか?　仲間を失ったバイオノイドの恨みと、教え子を襲われた先生の怒りが、激しい執念で激突する！　二人の戦いは果たして……？

月から飛来した謎の物体。時を同じくしてクイーンコスモの大攻勢が始まった。ついに正体を現したクイーンコスモによって、地球は侵略されてしまうのか？　かつてないピンチに陥ったジバンの目に、捉えられたまゆみの姿が……！　そして、早川良もまた……！

バイオロンが怪物のデザインを大募集?!　子供たちの想像力が生み出した、史上最強のバイオノイドが誕生した。ジバンのパワーを上回る強力な武器で武装された、恐るべきバイオノイド。クリスマス最大のプレゼントが、今、ジバンの前に送りつけられた！

バイオロンの最前線基地を発見！　ここはギバのアジトへの入り口なのだろうか?　バイオロン打倒の糸口をつかむべく、敢然と潜入を図ったジバンの前に、耳を劈く超音波の攻撃が。恐るべきバイオノイドが立ちふさがった！

ジバンの秘密基地を突き止めるために、まゆみが自白装置にかけられた。ブビやムクたちと一緒にアジトを抜け出したまゆみの前に、突然現れるまゆみの母。ジバンに知らせようと記憶をたどるまゆみ。そのとき、母にバイオロンの反応が。

ジバンには本当に妹がいた！　果たしてそれはまゆみなのだろうか？　そんな時、警視庁から「ジバン計画」のファイルが盗まれた。今明らかにされるジバンの秘密……。まゆみを救い出すために、マッド・ガルボの挑戦を受けたジバンの前に出現する、もう一人のジバン！

バイオロンの総攻撃が始まった。奪われたファイルによってすべての行動パターンを読まれているジバン。捨て身の作戦に出る、柳田とハリー・ボーイ。ジバンの弱点は人間の心。その優しさにつけこむマッド･ガルボの攻撃に、果たしてジバンは打ち勝つことができるのであろうか?!

ついに、ドクター・ギバが正体を現した！　その圧倒的な強さの前に、ジバンはまゆみを救い出すことができるのか?!　ジバン必死の攻撃に、飛行船で脱出したドクター･ギバ。ミサイルボタンひとつで人類を抹殺するという。……ジバン、君しかいない！　ドクター･ギバを倒し、地球に平和を取り戻してくれ!!