大学へ進学する青年アンディは、進学に伴う引越しによって荷物の仕分けをする事になった。
仕分けする荷物の中には、幼い頃から遊んでいたおもちゃが沢山あり、一部のおもちゃを実家の屋根裏に置いておくことにした。
しかし、ちょっとした手違いにより、屋根裏に置くおもちゃをゴミ捨て場に持っていってしまわれる。捨てられたと感じたおもちゃ達はアンディの元を離れ、保育園へ運ばれる。一方、真実を知るウッディは誤解を解いてみんなでアンディの元に帰る為に他のおもちゃの救出に向かう。
どんなに他のおもちゃに蔑まれても、絶対に見捨てることのないウッディの姿、アンディとおもちゃ達の決別のシーンは感動的。3を見る前に前作の1,2を見てほしい映画