将軍・吉宗（椎名桔平）の弟だと名乗る中川正軒（和泉元彌）という怪しい人物が現れ、ご落胤騒動が起きる。そんな中、忠相（東山紀之）は将軍家の祝儀能を取り仕切ることになるが、江戸城内に町人たちが招かれた機に乗じて盗賊が入り込み、幕府の蔵から三万両が盗まれてしまう。責任を問われた忠相は、三万両を取り戻せなければ切腹という窮地に……。一方、蔵を破った盗賊一味と正軒の間には、あるつながりがあった。
新米同心・大介（室龍太）が十手を盗まれた。忠相（東山紀之）が謹慎を申し渡すが、市中では十手を悪用した金品の詐取が多発。作左ヱ門（寺田農）が十手を持った若者・磯次（大八木凱斗）を偶然見とがめるも、逃げられてしまう。一方、お忍びで町に出ていた吉宗（椎名桔平）は、口の利けない若い娘・おくに（藤川心優）に遭遇する。磯次は妹のおくにを女衒（ぜげん）・巳之助（古舘佑太郎）の手から守ろうとしていた。
旅籠（はたご）で隠居が殺され、忠相（東山紀之）らの探索の結果、小間物屋の彦兵ヱ（秋野太作）が浮上。善良だと評判の男で、本人もはじめは否定をするが、なぜか一転、罪を認めて牢に入る。そんな中、その息子・彦六（伊嵜充則）が、下手人は他にいるはずだと忠相に直訴。下手人を見つけたら忠相の首をもらうと宣言し、忠相も同意して周囲を驚かせる。一方、北町奉行の伊生（高橋光臣）は度重なる辻斬りに頭を悩ませていた。
現代の詐欺師に当たる騙り（かたり）屋の一味が江戸を騒がせる中、忠相（東山紀之）の息子・求次郎（石田星空）は市之助（南岐佐）という少年と出会う。その母・多喜（高橋由美子）は「将軍様ご推奨」という触れ込みの学問所に息子を入れるため、浪人である夫・簑島（筧利夫）に刀を金に換えるよう迫り口論に。そんなある日、忠相は刺客に命を狙われ、通りがかった簑島の助太刀で撃退する。何者かが忠相に深い恨みを抱いていた。
ある日、お忍びで町に出た吉宗（椎名桔平）が裸馬に乗って遠出をしてしまい、忠相（東山紀之）たちは探索に追われる。吉宗は、将軍の鷹狩りの場となっている目黒にたどりつき、かつての恋人によく似た女性・おまさ（剛力彩芽）と出会う。その父・常右衛門（大地康雄）は名主で、村が鷹狩りのために役人たちから様々な苦役を課されるため苦労していた。役人の一人・荒木（出合正幸）がおまさに横恋慕していると知った吉宗は…。
強欲な金貸し・金兵衛（でんでん）を「守銭奴」と中傷する落書が江戸中に出回る。養生所の伊織（勝村政信）がその「強突く張りの病」を治そうとする中、忠相（東山紀之）の発案で新三郎（寺脇康文）が用心棒に扮し金兵衛に近づくことに。中傷の嵐は店が襲撃を受けるほどの騒ぎになり、息子の清助（深澤嵐）は心を痛めるが、金兵衛は全く懲りる様子がない。そんなある夜、店に賊が入り、金を守ろうとした金兵衛が斬られてしまう。
残忍な手口の盗賊一味が大店を次々に襲い、忠相（東山紀之）と伊生（高橋光臣）の両町奉行は探索に追われる。一味を率いているのは十年前、義賊として知られた「村雨の吉兵衛」一派の若頭だった男・升蔵（宮川一朗太）とわかるが、かつての手口と余りにも違い過ぎた。そんな中、母一人で娘・おさよ（住田萌乃）を育てている真面目な行商人・おるい（宮本真希）の前に升蔵が現れる。二人の間にはただならぬ因縁があった。
新三郎（寺脇康文）が幕府の鎖国政策について将軍・吉宗（椎名桔平）を批判する文書を目安箱に投じようとし、忠相（東山紀之）と伊織（勝村政信）が懸命になだめる中、おたけ（小林綾子）らの長屋で住人が次々と発熱。当時は命取りにもなった「はしか」であることがわかり、あっという間に江戸中で流行してしまう。奉行所の面々も感染抑止に奔走し、新三郎と伊織は養生所で感染者の治療に当たるが、薬不足で犠牲者が増え続け…。
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