都立お台場湾岸医療センターに、新米ドクター・田上湖音波（橋本環奈）がやってきた。清楚なかわいらしい服装で、すれ違う人々も思わず「アイドル？」「今の子、見た？」と漏らすほど容姿端麗。病院内をザワつかせながらさっそうと歩き、脳神経外科のスタッフルームに辿り着く。 ルーム内では脳神経外科医・大友と循環器内科医・村井が、緊急搬送されてきた救急患者をどちらの科で対応するかもめていた。緊急にも関わらず押しつけ合う２人に「ええ加減にしやあ！たぁけかっ（愚か者）！」と、ドスのきいた岐阜弁でタンカを切る湖音波。驚く大友と村井から不審者扱いされる中、かつて湖音波の命を救った中田啓介がやってくる。 自身が医者になるきっかけにもなった中田との久々の再会に「…うす」と照れる湖音波。そして、中田指示のもと、救急患者の手術を湖音波が執刀することになるが、見事な手さばきでカテーテル手術を成功させる。 手術後、「自分、変わったっしょ？」と再会を喜ぶ湖音波に対し、中田は「何も変わってなく見えるが？」と素っ気ない。さらには、病院幹部にこびへつらい、合理的な組織の犬のようになってしまった中田の姿に「なんか中田先生、ダサいすわ」と湖音波はうんざり。そんな彼女に中田は「１３年も経てば、人は変わる」と返すのだった。その後もガチガチなルールだらけの勤務環境や事なかれ主義のヌルい同僚たちの姿にあきれるも、ヤンキー上がりのポジティブマインドで突っ走りながら患者と向き合っていく湖音波だが…。

元ヤンキーの新米ドクター・田上湖音波（橋本環奈）が都立お台場湾岸医療センターに来て数週間。事務局長の鷹山（大谷亮平）たちは院内のルールを全く守らない湖音波を咎めるが、本人は「さーせん」と言うだけで全く反省していない様子。 そんな中、２年前に脳腫瘍の摘出手術を受けた篠原和子（舟木 幸）が腫瘍の再発で入院してくる。しかし、付き添っていた和子の娘・美咲（入山杏奈）は１ヶ月後に結婚式を予定しており、母に式へ出席してほしいと熱望していた。 事情を聞いた看護師の颯良（宮世琉弥）は担当医の大友（音尾琢真）に相談するが、病状の進行具合から「（出席は）無理だ」と突っぱねられてしまう。美咲の想いを汲み取った湖音波と颯良が式に同行すると申し出たことで、和子の外出許可が下りる。喜び合う和子と美咲だが、お見舞いを終えた帰り際、美咲は院内で倒れてしまう…。緊急MRIを撮ると、脳の奥に上衣腫という腫瘍ができていた。母に心配をかけないため黙っていてほしいと、美咲は湖音波と颯良にお願いする。さらに、美咲は結婚式を控えているため髪の毛は絶対に切りたくないという。ヘアモデルをしている美咲は、子供の頃から和子が手入れをしてくれた美しい髪を何より大切にしていた。しかし治療のためには、なるべく早く開頭手術をする必要がある。それは、髪の毛を剃ることを意味していた。湖音波は美咲の髪を剃らずに手術ができないかと考え、院内のルールに立ち向かうが…。

湖音波（橋本環奈）が後輩の竜司（小林虎之介）たちを一喝している隠し撮り動画がSNS上で拡散。さらに事務局長の鷹山（大谷亮平）ら病院上層部は湖音波の過去を調べ上げ、ヤンキーぶりは徐々に病院中に知れ渡っていた…。 脳神経外科に入院している杉浦優斗（森永悠希）はびまん性星細胞腫を患い、記憶や言語能力に影響が出始めていた。病状が進行してきたため湖音波は優斗と両親に手術が必要だと説明。弁護士を目指している優斗は手術に前向きな意思を見せるが、これまでに積み上げてきた知識がなくならないようにしてほしいと懇願する。 そこで湖音波は、優斗の手術を「覚醒下手術」で行うことを提案。手術中に脳を開けた状態で患者を起こし、言語等の反応を見ながら腫瘍を取るという難しい手術だが、中田（向井理）はそれを承認する。しかし、手術の執刀は湖音波ではなく大友（音尾琢真）に任せるという。湖音波の過去を知った優斗の父が、そんなドクターに任せられないと申し入れをしてきたのだ。自分に執刀させてほしいと食い下がる湖音波に対し、中田はにべもない。 一方、急遽難易度の高い手術をすることになった大友は必死で準備を始める。見るからに焦る大友の姿に、湖音波は力になろうと声をかけるが、プライドの高い大友は「医大に入れたのは裏口入学かパパ活で教授の弱みを握ったからだろう」などと暴言を吐いてしまう。すると湖音波は「このクソたぁけ！」とブチ切れ、大友の首を絞め上げる…。

湖音波（橋本環奈）が後輩の竜司（小林虎之介）にブチ切れている動画がSNS上でバズってしまい、お台場湾岸医療センターのイメージはガタ落ちに。病院側は湖音波の広報動画を撮影してイメージ改善を図る…。 そんな中、湖音波は回診中の心臓外科医・神崎（森崎ウィン）と遭遇する。院内に名が轟くほどのイケメンで天才カリスマ医師としてもてはやされる神崎だったが、ウィスパーボイスで声が聞き取りづらく、対峙した湖音波は「声ちっちゃ！」と苛立ちを隠せない。そこに、竜司と勤め先の社長・光男（林和義）が病院にやって来る。バイク店を営む光男は、バイク好きの湖音波に店に遊びに来て欲しいとのことだった。 その日の仕事帰り、湖音波と颯良（宮世琉弥）がバイク店へ行くと、光男の娘・亜希（土井玲奈）と孫の尚人（湯田幸希）の姿が。「免許を取ったらおじいちゃんとツーリングに行く」とねだる尚人に「まだまだ長生きしないとな」と嬉しそうな光男。竜司は尚人と兄弟のようにはしゃいでいる。湖音波と颯良はそんな竜司や光男たちの姿を、ほほ笑ましく見つめていた…。 その数日後、光男が胸痛を訴え搬送されてくる。狭心症が疑われ心臓血管外科に入院することになり、湖音波は担当医の神崎に「どうかお願いします！」と頭を下げる。さらに光男のカルテを見ていた湖音波は、MRI画像の頸動脈に狭窄のようなものを発見する。もし狭窄がある状態で心臓手術をすると、脳梗塞を引き起こし、最悪昏睡状態に陥る恐れがある。しかし湖音波の懸念は神崎と中田（向井理）に一蹴され、手術は予定通り行われることに。諦め切れず、独断で光男の症状を詳しく調べ始める湖音波だったが…。

湖音波（橋本環奈）は、岐阜の病院に勤務していた頃に診察した患者・宮村亜里沙（湯山新菜）のことを思い出す。亜里沙は家族で岐阜旅行中に頭蓋咽頭腫を発症し来院。長い治療期間を見据え、湖音波は亜里沙の自宅近くで通院に便利なお台場湾岸医療センターの中田（向井理）に紹介状を書いたのだった。湖音波が調べたところ、亜里沙は中田が手術した後に別の病院へ転院し、半年前に亡くなっていた。そのことを中田に尋ねると、手術に問題はなく、亡くなったことも知らないという。湖音波が去ると、表情を変えた中田は鷹山（大谷亮平）に電話をかけ…。 そんな中、常に病床が埋まっている整形外科に特別室を設置することが決まり、工事期間中、整形外科のスタッフも脳神経外科のスタッフルームを使用することに。観葉植物や間接照明など荷物が運び込まれる中、整形外科の医師・岩崎沙羅（宇垣美里）と看護師・佐々木花音（鈴木ゆうか）がやってくる。SNSにセレブ生活を投稿する沙羅は12 万のフォロワーを抱え、彼女に憧れて受診する患者も多いという。そんないかにも“パリピ”な沙羅の振る舞いにイラつく湖音波。 頚椎症により沙羅の診察を受けていた大橋真由（工藤美桜）は、リハビリ中に水を飲んで激しくむせてしまう。その姿を見た湖音波はMRI画像を確認し、別の病気の可能性を指摘。「脳外には関係ない」と突っぱねる沙羅だが、湖音波はもう一度MRIを撮るよう訴える。すると、真由の脊髄の周りには異常な血管の影が。脊髄動静脈奇形ではないかと言う湖音波に、沙羅はあっさりと「脳外案件じゃん。そっちに任せた」と言い放つ。湖音波は、真由に脳神経外科への転科について説明するが、沙羅に憧れている真由は不満をあらわにする…。

お台場湾岸医療センターに北岡孝典（杉本哲太）が転院してくる。記憶を司る海馬近くに海綿状血管腫を患い記憶障害が進んでいた孝典は、転院初日、家族が目を離した隙に病室を抜け出し院内食堂を訪れる。食堂で開店準備をしていた潮五郎（吉田鋼太郎）は、突然現れた孝典の姿を見て驚きの声を上げる。 孝典を探しにやって来た湖音波（橋本環奈）に「こいつは俺の宿命のライバルや！」と興奮気味に紹介する潮五郎。しかし孝典は潮五郎のことをまったく覚えていなかった。孝典の妻・真理子（櫻井淳子）いわく、半年前から物覚えが悪くなり、ここ１ヶ月は昔の記憶も忘れるようになったという。 手術すれば命は助かるが、記憶がなくなるかもしれないと聞いた潮五郎は、孝典の病室を訪れ、高校時代の思い出を語り始める。それぞれが通う高校で番長として君臨していた２人は、地元一のマドンナを取り合って何度もタイマンを張っていたという。 なんとか当時のことを思い出そうとする孝典だが記憶は戻らない。歯がゆい思いで発破をかける潮五郎を、湖音波はそっと制すのだった。 諦め切れない潮五郎は革ジャンリーゼント姿の番長スタイルで孝典の元へ。しかし、何も思い出せない孝典は驚くばかり。湖音波と颯良（宮世琉弥）は慌てて潮五郎を病室の外へ連れ出そうとするが、孝典が颯良に突然「昌也？」と声をかける。 10年前に亡くなった息子と、同世代の颯良を勘違いしたのだ。どうしても孝典の記憶をよみがえらせたい潮五郎は、颯良に「息子のフリしてやってくれんか」と頼み込むが、颯良はなぜかその申し出を冷たく断る。患者に嘘をつきたくないという颯良の言葉には、過去のある出来事が関係していた…。

お台場湾岸医療センターで、外国人観光客が人間ドックなどを受けられる“メディカルツーリズム”が試験導入されることに。各科から選ばれた人員がアテンドとして動員されることになり、脳神経外科からは語学ができる高野（馬場徹）とソン（許豊凡）が選ばれる。 湖音波（橋本環奈）らは急な決定に対して不満を口にするが、中田（向井理）に説得されしぶしぶ了承。1週間後、メディカルツーリズムが始まると、院内はスーツケースを引く外国人の団体で溢れ、まるで観光地のようになり…。 そんな最中、状態が安定してきたため、大友（音尾琢真）からソンが術後のケアを任されていた患者・塩沢菜摘（濱田マリ）が急に退院したいと訴え、湖音波はツーリズム対応で忙しくなったソンに代わり菜摘と話をする。菜摘は右頸動脈狭窄症でカテーテル手術を行っており、湖音波はもう少し経過観察が必要だと判断。明るく振る舞う菜摘だが、担当していたソンによると、夫の昭一（清水伸）は海外出張が多く、一人で寂しい思いをしているようだった。 数日後、菜摘の病室に昭一が訪れる。菜摘のことが心配で、出張を早く切り上げてきたという。昭一と会話する菜摘の様子を見て、湖音波はあることが気になっていた。 一方、脳神経外科はメディカルツーリズムに人員を取られ、ER（救急外来）のような忙しさに。スタッフたちに疲れが見える中、メディカルツーリズムで再検査となった外国人患者が「今、処置してほしい」と要望。 緊急性が低いと判断した湖音波は処置を断るが、報告を受けた中田は「なぜ勝手に判断した？」と湖音波を問い詰める。すると湖音波は「このままだと人員不足で判断ミスが起きて、取り返しがつかない事故が起きる」と返し…。

湖音波（橋本環奈）は、緊急性があったとはいえ独断で塩沢菜摘（濱田マリ）の手術を行ったうえ、その件をとがめた鷹山（大谷亮平）に暴言を吐いたことで、中田（向井理）から無期限の謹慎を言い渡される。 謹慎中にもかかわらずゲームセンターやスナックで時間を潰す湖音波のもとに、麗奈（内田理央）から翌日の定期検診についての電話が。「マブダチのためなら謹慎なんてクソくらえ」と、検診は自分が担当すると言い張る湖音波。 翌日、何食わぬ顔で病院を訪れた湖音波だったが院内からつまみ出され、大友（音尾琢真）が麗奈を診ることに。検診の結果、２年前に患っていた頭蓋咽頭腫の再発は見られずホッとする麗奈。と、そこに看護師に変装した湖音波が忍び込んで来るが、すぐに見つかり中田から呼び出されてしまう…。 検診を終えた麗奈と湖音波は、今は亡き親友・真理愛（平祐奈）の誕生日を祝う恒例行事を行っていた。高校１年生当時、ひょんなことから意気投合しマブダチになったことを思い出しながら、真理愛が生きていたらどんな仕事をしていたのか想像して盛り上がる2人。その帰り道、麗奈が突然頭の痛みを訴える。 緊急検査の結果、麗奈の脳には頭蓋咽頭腫とは別に、動脈瘤が見つかった。しかし麗奈は息子の丈太郎（原川昊大）との約束のため、開頭手術ではなく、入院期間が短く回復が早いカテーテル手術にして欲しいと申し出る。真理愛のように亡くなる子を出さないために決意して医師になったのに、肝心のマブダチが倒れた時に謹慎中だなんて…悔しさを噛みしめる湖音波は、麗奈の手術を行うため、改めて謹慎を解いてほしいと中田に頭を下げるが、中田は首を縦に振らず。

お台場湾岸医療センターで、大規模災害の訓練についてミーティングが開かれていた。誰もが面倒な役割から逃れようとする中、湖音波（橋本環奈）はリーダーに立候補すると、参加していたそれぞれの科に役割を振り分ける。そんな中、どこからともなくいびきが。 寝ていたのは産婦人科医・飯塚涼（葉山奨之）。湖音波は飯塚にも役割を依頼するが「俺、パス。しんどいから」と言うと再び寝てしまう。ナメた態度に「こいつ、殴っていい？」とイラつく湖音波。 ある日、湖音波は院内のロビーで座り込んでしまっていた妊婦・内村瑠花（紺野彩夏）に駆け寄る。元ヤンの瑠花とその夫・大祐（内藤秀一郎）は動画で話題の「ヤンキー先生」の湖音波に会えたことを喜び、大祐は湖音波に瑠花の担当医である飯塚が頼りないと相談する。 湖音波は飯塚に大祐の気持ちを伝えるが、飯塚は担当でもないのに一生懸命な湖音波に対し「しんどくない？」とつぶやいて去っていく。 そんな中、湖音波は院長の大河原（大塚寧々）に呼び出される。大河原は、以前湖音波が中田（向井理）宛に紹介状を書いた亜里沙（湯山新菜）の執刀を最後に、中田が手術をしなくなったこと、そして元研修医・小田桐（八木勇征）の退職について何か知らないかと湖音波に尋ねる。 中田から「これ以上、宮村亜里沙さんの件を調べるな」と言われたと明かす湖音波に、大河原は「辞めた小田桐蒼先生に会ってきて」と依頼。小田桐の元を訪ねた湖音波は、最初に亜里沙を診たのは自分だと伝え、彼女が亡くなった理由が知りたいと訴える。小田桐はそんな湖音波を突っぱねるが…。