特命係・杉下右京(水谷豊)と甲斐享(成宮寛貴)は、警視庁特命係の狭い部屋で、ある重要な殺人事件の調書を読んでいた。2012年6月 湾岸地区の廃船寸前の貨物船から2つの死体が見つかる。それは、脱出不可能な密室で起こった殺人事件であった。2つの死体は、他殺体と自殺体。場所は密室。どちらかが犯人でどちらかが被害者なのか。なぜ、犯人は、殺人を犯したのだろうか?そしてなぜ、自殺を図ったのか?捜査一課の伊丹憲一(川原和久)らは、この事件の真相を探っていく。 彼らが辿り着く真実は、あまりにも切なく哀しいものだった。