3部作の2部。1作目で誘い込んだ視聴者に、この世界の構造や救世主の役割、マトリックスの仕組みや歴史など、前作に続きアクションも含めて、説明不足感を敢えて残したまま、少しずつ開示していくという、壮大なブリッジ。
公開直後劇場で鑑賞するも理解に苦しんだ。3部目も鑑賞後、DVDでも繰り返し鑑賞して把握。
救世主として覚醒したネオ。マトリックスのプログラムに異変が起こり、エージェントスミスはエグザイルに堕ちる。スミスは自らのプログラムをコピペし増殖。ネオは救世主としての役割を果たすべく、マトリックスのマスタールームへ向かう。しかし、そこで知る救世主の役割、待っていた究極の選択。ネオは全人類と世界の行く末と、愛を天秤にかけなければならなかった。
