史上最高にハゲしくアツかりしカードバトル、デュエル・マスターズ！デュエマ！ 八尾町に突如オープンした超巨大テーマパーク！それが『デュエマーランド』っ！！ 勝太たちは、全てが無料のデュエマーランドを満喫っ！ パレードの最中、デュエマーランドのマスコット・デュエマウスと戦うことになった勝太は、デュエマウスの恐ろしい本性を知ることになる……っ！？ 新章突入っ！！新たなるデュエマが今、始まる！！

デュエマウスとの勝負に勝ち、ゴキゲンの勝太！しかし、みんなでデュエマーランドに行った日以降、ぶっちゃけの姿が見えない……っ！？心配したりしなかったりの勝太たちは、ぶっちゃけ捜索のヒントを得るため、夜のデュエマーランドへの潜入を試みる。 そこで勝太たちを待ち受けていたのは飢えた獣のようなアイツだったっ！？ 深まるぶっちゃけ失踪の謎っ！不気味な夜のデュエマーランドで、アツいデュエマが今はじまるっ！！

消えたぶっちゃけを探すうちに、妙な噂を耳にしたるる。夜な夜な、閉園後のデュマーランド内を疾走する赤い光っ！その光を見たものは消えてしまうという……！「闇を駆ける紅蓮の彗星」と呼ばれるその噂を信じていない勝太だが、放課後に出会ったバイクの男によって、紅蓮の彗星の恐怖を目の当たりにするっ！！ 謎の男・赤城山バサラの実力とはっ！？そして目的とはっ！？謎が謎呼ぶ超高速デュエマが繰り広げられるっ！！

バサラの操る新能力「侵略」により、たったの３ターンで敗北してしまった勝太っ！ 負けた勝太が落とされたのは、デュエマーランドの地下に広がる巨大空間、通称「地下帝国」っ！！ 地下帝国では、デュエマに負けた人々が言葉巧みに騙され「侵略」カードを手に入れるため謎の特訓に取り組んでいた。勝太も見事に騙され「侵略」カードを追いかける中、藁で巻かれた謎の男と、憎きライバルに遭遇し……っ！？地下帝国編、ドロドロとスタートっ！

ぶっちゃけに続き勝太も消え、デュエマーランドを疑い出するる。るるの行動に気づいたデュエマーランドの幹部・御茶ノ水博士は、恐ろしき刺客を送り込むっ！！ るるのもとに送り込まれたロボ勝太は、見た目はどう見てもロボだが紳士的な振る舞いでるるの乙女心をがっちりキャッチっ！！「これが本物のかっちゃんだ！」と記憶を書き換えようとするるるを、ホカベンとべんちゃんは止めることができるのかっ！？

地下帝国を脱出するために、過酷な環境を生き抜く勝太っ！……のはすが、温泉でリラックスしまくりの勝太たち。地下帝国に詳しいおっさん・ワラマキさんによれば、地下帝国のデュエマー健康ランドに「革命」カードが眠っているらしいのだが……っ！？ 一見温厚な管理人・ウルトラブッダーラに見張られつつも、「革命」カードを探す勝太たち。ふと放たれたワラマキさんの一言により、衝撃の展開にっ！？ 湯けむりの先に見えたものは何だっ！？決死のデュエマスタートっ！！

消えた勝太とぶっちゃけを探すべく、デュエマーランドに忍び込んだるる・ホカベン・ベンちゃん。地下が怪しいと睨んだるるは、文字通り力づくで地下帝国へ！そこで見たのは、地下帝国に広がるアイドルオタクの聖地！アキハバラ・・・ではなくチカハバラだった。ライブハウスでオタ芸をする怪しい人影の正体は・・・地下生活に慣れ、変貌を遂げたぶっちゃけ！果たしてみんなで地下から脱出できるのかっ！？そして、古来より伝わるデュエマの決闘方とは・・・！？激辛注意のデュエマ・スタート！

ついに伝説の革命カードが眠る洞窟へとたどり着いた勝太たち。しかし、巨大な封印岩は押しても引いてもびくともしない。悩む勝太たちの前に現れたのは、巨大なロボットに改造されたウルトラブッダーラだった！ワラマキの指導のもと、ウルトラブッダーラ改め「DXデュエマーロボ」を倒すべく特訓を開始した勝太とギョウ！その弱点は昔の特撮番組「デュエマーファイブ」に隠されていたっ！？革命カードを手に入れるため、勝太の心が燃え盛るっ！！

ついに「燃える革命 ドギラゴン」を手に入れた勝太っ！！囚われたるる達を救い出し地下帝国から脱出すべく、地下帝国のボス・ガチロボの元へと向かう！！ ガチロボの力は圧倒的で、そのガチっぷりで幾多の脱走者を返り討ちにしているという。果たして勝太は無事に地下帝国から脱出することができるのかっ！？ そして、「燃える革命 ドギラゴン」に秘められた革命の力がついに明かされる！！今こそ革命の時！地下帝国を揺るがす一大デュエマの火蓋が切られる！！

地下帝国を脱出した勝太たち！しかし、地上ではなぜかお祝いムード！デュエマウスいわく、地下帝国はただのアトラクションの一つだという。納得のいかない勝太たちに、デュエマウスは新たなイベントへの参加を促す。その名も「デュエルマ・スターカップ」だ！勝敗によって星をとりあい、星の数に応じて願い事が叶えられるという夢あふれる企画に、まんまと乗せられる勝太。さっそく渡されたデュエマホンを片手に、意気揚々とデュエマを始めるが！？怪しき陰謀が動き出すっ！！

ガチロボを倒され、勝太に復讐を誓うデュエマーランド幹部の一人、ハカセ！勝太たちをおびき寄せるべく、デュエマーランドに新アトラクションを完成させる！ カジノ風に遊べるゲームセンターに、さっそく夢中な勝太たち。ゲーム用のコインがなくなり、デュエルマ・スターカップの星を賭けようとした時に現れたのは、ディーラーに変装したハカセだった！！ハカセのハイリスク・ハイリターンのギャンブルデュエマを前に、勝太は勝率０％っ！？熱いドローが運命を切り開くっ！！

カードショップ滝川に押しかけた黒づくめの男たち！その目的は、デュエマーランドが「カードショップ滝川」の土地を買い取ることだった！！かつて店の持ち主だった寿司屋の大将との約束を守るべく、るるは買収を断固拒否！しかし次の日の朝、るるが見た衝撃の光景はっ！？ ついに侵略の魔の手が日常生活に忍び寄る！襲い来る紅蓮の彗星、そして新アトラクション「デュエマーシー」！！星と店とプライドをかけて、るるのおでこがキラリと光る！

デュエルマ・スターカップが始まり、星を集めるのに夢中のデュエリストたち。しかし、中にはデュエマしないで星を集める者も・・・。ぶっちゃけが大ファンのハラグロXは、熱狂的ファン、通称「カモ」から星を巻き上げていたっ！そんな彼女たちのもとに現れたのは、分厚いコートを着てマスクで顔を隠し、アブない凶器を全身に持ったデュエマーランドの怪人だった！？過剰に星を取り締まる怪人を止めるべく、デュエマの貴公子ルシファーがついに復活！薔薇と凶器が飛び交う白熱デュエマ、スタート！！

デュエルマ・スターカップの裏に、デュエマーランドの陰謀があると感じたるる。学校では、何故かデュエマウスが勝太たちを盗撮していたり、星を全てなくしたデュエリストは「デュエマ不能」になるという噂があったり、何やら怪しすぎる雰囲気！？そんな中、「デュエマーランドはデュエリストを洗脳している」という新たな情報を持ってきたベンちゃん。しかし、その額には侵略マークが・・・！？果たして勝太はベンちゃんの洗脳を解くことができるのか！？空前絶後の大ピンチに新たな革命の力が解放される！！

誕生日を迎えたぶっちゃけ！サプライズパーティーの気配を感じ、妄想全開でカードショップ滝川に向かう！しかし、そこでぶっちゃけが見たものとは！？一方、デュエマーランド３幹部のひとり、江戸川ランボーは、バサラに代わって勝太たちを付け狙う。自称「デュエマーランドで一番平和を愛する男」のランボーが用意したのは、新アトラクションの完成記念パーティだった！！恐るべき新種族、ゲリラ・コマンドの脅威の能力が明かされる！！そしてランボーのデュエマの実力とはっ！？勝太たちに魔の手が迫る！！

デュエルマ・スターカップがスタートしてから数日が経ち、デュエマーランド３幹部のひとり、ハカセはスター獲得状況を調査する。ずば抜けて星の数が多いのは、CM出演のため闘志を燃やすコジロー！・・・かと思いきや、さらにその上をいくデュエリストがいた！その名は・・・滝川るる！？それぞれの胸に秘めた願いを叶えるため、るるとコジローは超大量のスターをかけて大勝負に出る。果たして、スターはどちらの手に渡るのか！？そして、本当に願いは叶うのか！？

デュエマーランドのスペシャルイベント開催決定！その名も『寒がってはいけない！フローズンファイト』だ！ルールは簡単。どんなに寒くても「寒い」と言ってはいけないのだ。優勝賞品のフローズンカレーパン目当てに参加を決める勝太。同じく参加者として現れたのは、なんと聖エンジェル中のヘレンだった！！ルシファーのために優勝し、カレーパンをゲットしようと奮闘するヘレン！一方の勝太も、カレーパンがかかっていては負けられない！意地と意地がぶつかりあう、究極のガマン比べが始まる！！

夏真っ盛り！プールに遊びに来たホカベンたちだが、プールそっちのけでデュエマホンに夢中。その理由は、デュエマ動画投稿サービス「デュエチューブ」だ！！その中でも、一番の再生数を誇るのはNOZOKIN（ノゾキン）というデュエリスト。NOZOKINは、リアクションが抜群の「神ボーイ」にドッキリをしかけて盗撮し、再生数を稼いでいた。その行為に憤るホカベンは、NOZOKINを懲らしめようとするが・・・！？「神ボーイ」の正体とは！？そしてホカベンの隠れた本性が明らかに！プールサイドの大乱闘、開幕っ！！

夏休みの自由研究のため、カレーパン模様のチョウを探す勝太。しかし大草原で出くわしたのは、チョウではなく宇宙人だった！？はじめはビビりまくる勝太であったが、宇宙人がカレーパンにそっくりなことに気がつくと、態度が一変。「カツカレー」と名付けられた宇宙人は、勝太と一緒に暮らすことになる。カレーパンを食べるたびに大きくなるカツカレー。そしてカツカレーを付け狙う謎の黒服集団の魔の手が迫る！地球を飛び越え、宇宙規模のデュエマが今、始まるっ！！

周りを海に囲まれて以来、さっぱりお客さんが来なくなってしまったカードショップ滝川。なんとかお客さんを呼ぼうと必死なるるのおじいちゃんは、るるの写真を使ってチラシを作ることにしたのだが、そのチラシが思わぬ珍客を呼ぶことに！？その頃、地下帝国に置き去りにされたまますっかり忘れられていたワラマキさんは、いつの間にか子分を作って地下生活を快適に過ごしていた。しかし、そんなワラマキさんが地下帝国脱出を決意！ついにワラマキさんはワラを脱ぐのか！？地下帝国に革命が起こるっ！！

ランボーとのデュエマに勝利し、地下帝国脱出に成功したワラマキさん！真っ先に向かった先はカードショップ滝川だった。勝太との感動の再会もそこそこに、ワラマキさんは地下帝国脱出の理由を語りだす。それは・・・女子プロレスカフェ！？ワラマキさんのワラの中に眠る、光り輝く謎の物体とは！？そして、るるたちは初めて、地下帝国での出来事やデュエマーランドの陰謀を聞くことになる。革命と侵略の秘密が明らかに・・・！？

デュエマーランドの社長と３幹部は、何者かがデュエマーランドの秘密を探っていることに気づく。ネットワーク上に残された薔薇のマーク・・・そう、ルシファーはデュエマーランドを調査しつつ、宣戦布告していたのだ！そんな中、明らかになるバサラの過去。果たしてバサラがスピードを追い求める理由は何なのか！？そしてついにルシファーとバサラがデュエマで激突！圧倒的なバサラの速攻にルシファーはどう立ち向かうのか！？最強vs最速、開戦っ！！

デュエマーランド社長の介入により、大切なものを懸けて闘うとこになったルシファーとバサラ。圧倒的なスピードで攻めまくるバサラ！一方、ルシファーは病気の完治と引き換えにカードの音が聴こえなくなっていたが、新たに「時を止める」デュエマを完成させたと言う。最強vs最速、ついに決着！！そして明かされる、革命と侵略を超えた、封印されし禁断のカードの存在。デュエマーランド激震の新展開、スタートっ！！

「野球キャラ」といいつつまったく野球をやっていなかったホカベンだが、V中野球部は大会決勝にコマを進めていた！デュエマそっちのけで練習するホカベン！強敵を打ち破るため、野球場でナイター練習させてほしいと土瓶先生に交渉する。一方、デュエマーランドは地下帝国でストライキが起き、電力停止の危機に。大量の電気を必要とするデュエマーランド社長は、電気を求めて八尾町を飛び回る！デュエマーランド社長の正体、そしてデュエマの実力は！？ホカベンのバットが唸るスポ根デュエマ、プレイボールっ！！

飢えた野獣・コジローが、なんとデュエマ引退宣言！？腹をすかせた３人の弟たちのために、デュエマのカードをすべて売り払おうとしたのだ。必死でコジローを止める弟たち。そんな折、謎の手紙がコジローの元に届く・・・！昨年のデュエマ甲子園決勝戦の雪辱を晴らすべく、飢えに飢えまくった本気のコジローが勝太の前に立ちはだかるっ！果たして勝太とドギラゴンは、飢えた野獣の猛攻を、しのぎきることができるのか！？男のプライドを懸けたデュエマが始まるっ！

アニメ「何度も再生　日本の昔ばなし」に夢中の勝太は、デュエマーランド社長自慢のアンテナを、つい気づかず物かけ代わりに使ってしまう。傷ついたデュエマーランド社長を見たデュエマウスは、勝太への制裁を誓う！「中の人」などいないはずのデュエマウスの「中身」がついに判明！？そして明らかになるデュエマウスとデュエマーランド社長の過去とは！？本気のデュエマを見せるデュエマウスに、勝太はどう立ち向かうのか！？着ぐるみ業界騒然の衝撃デュエマを見逃すなっ！

デュエマーランドのファンシーキャラランキング１位を独占してきたデュエマウス。しかし、その座を脅かす新キャラが現れた。その名も「デュエにゃんこ」だ！着ぐるみを超越したリアルすぎる猫の演技でデュエマーランド中の人気をさらったデュエにゃんこ。ショックを受けたデュエマウスは、家出を決意するが・・・！？失意のデュエマウスは果たしてデュエマーランドに帰ってくるのか！？愛と哀しみのファンシーデュエマ、開幕っ！！

禁断のカードを手に入れたバサラ！カードの謎の文字はいっさい読めないものの、カードの発する光に導かれ訪れたのは、極寒の地・南極だった。謎の遺跡を探るバサラの前に現れたのは、かつてデュエリストを抹殺し、世界を我が物にせんとしたあの男…！？禁断のレジェンドカードのもつ最強の力を巡って、最速の男・バサラと、かつて神をも従えた男が激突する！禁断のレジェンドカードの力を手に入れるのは果たしてどちらなのか！？野望うず巻くデュエマが始まる！！

時はハロウィン。デュエマーランドでもハロウィンイベントが開催され、誰もが仮装で大盛り上がりの中、ぶっちゃけはハロウィンを阻止しようと画策する。「チャロウィン革命軍」としてデュエマーランドに乱入したぶっちゃけ。ただのモテない男のやっかみかと思いきや、ぶっちゃけには意外な協力者がいた！？ハロウィンイベントを続行するため立ちはだかったデュエにゃんこの前に、熱い魂を持ったあの男が現れる！ハロウィンVSチャロウィン、結果はいかにっ！？

禁断のレジェンドカードの力が開放された時、その強大な力でデュエマが崩壊する！？禁断のカードを再び封印すべく、デュエマーランドに忍び込むルシファー。待ち構えていたバサラは、ルシファーにリベンジを果たそうと闘志を燃やしていた。デュエマーランド社長の企みにより、ルシファーは己の命をかけてデュエマに挑むことになる。禁断のレジェンドカードは、時を止めるルシファーのデュエマさえも打ち破るのか！？最速改め、最凶vs最強！勝つのはどっちだっ！！

一昔前の人気アニメ「超時空戦士ダンボールフォーマーZ」のハリウッド映画化が决定！そしてその主役に選ばれたのは、なんと飢えた野獣・コジロー！？ハリウッドからの高額オファーを前に、デュエマのことなどすっかり忘れ、ハリウッドスターを目指そうとするコジロー。弟たちは、だまされているんじゃないかと不安がるが、とにかくハリウッドまで来てみると・・・！？おかしな撮影現場！叫ぶコジロー！うさんくさい映画監督！そして突如として現れたハカセ！それぞれの思惑が交錯するデュエマinハリウッド、いざスタートっ！！

デュエマーランドへ行ったまま、連絡がつかないルシファー。勝太たちはルシファーの行方をつかむべく、デュエマウスから情報を聞き出そうとするが、デュエマーランド内にデュエマウスが大量発生！本物のデュエマウスを探すため、勝太とるるは奔走する。そしてついに本物のデュエマウスを突き止めたるる！一方、勝太はデュエマーランド幹部の一人・ランボーと対決することに！？同時多発のダブルデュエマを見逃すなっ！！

ルシファーからの連絡がないことを不審に思う勝太とるる。突如現れたデュエマーランドの社長は、ルシファーがバサラとの死闘の末、死んだことを勝太に告げる。真相を確かめられぬまま、勝太はバサラを倒すべくジェットコースターの頂上へ！ついに激突する勝太とバサラ。そして明かされる「禁断」のレジェンドの恐るべき能力。果たして勝太とドギラゴンは、革命の力で禁断のカードを食い止めることができるのか！？そしてルシファーの仇（かたき）をとることはできるのか！？激闘が始まる！！

バサラに敗北し、腕もペッキリ折れてしまった勝太。ルシファーの仇（かたき）を取れずふさぎこんでいた勝太だったが、ふと夜空を見上げて驚く。なんと月面に勝太の顔が描かれていたのだ。こんなことができるのは一人しかいない！そう、伝説の最強デュエリストにして勝太の兄、切札勝舞だ。勝太の元に届いた勝舞の手紙「月面で待つ」というメッセージに、月へ行く方法を模索する勝太。そこに現れたのは、かつて勝太が助けた宇宙人・カツカレーだった。勝利への熱い気持ちと、カレーパンへの食欲がせめぎあう！果たして勝太たちは宇宙へ旅立てるのかっ！？

宇宙人・カツカレーの助けもあり、月へと旅立った勝太たち！しかし、食欲を抑えきれず、勝太はカレーパン型UFOを食べ始める。墜落しつつもなんとか月面にたどり着いた勝太たちだったが、落ちた先にはなんとジャングルが！？巨大動物や宇宙人がひしめく月の王国を治めていたのは、やはりあのアニキだった。ついに月面の王者となった兄・勝舞と再会した勝太。新たなる革命カード「ボルシャック・ドギラゴン」を受け取った勝太だが、それと引き換えに勝舞が要求したものとは！？

月面での兄弟対決。新カードを手に入れ調子づく勝太に対し、勝舞は語り継がれる伝説の名「ボルシャック」を持つドラゴンで迎え撃つ！激しいデュエマが続く一方で、何故か月のバリアに穴が空き、空気がどんどん抜けていく事件が発生！！月の影響でかしこくなったハムカツとベンちゃんは、原因究明に奔走するが・・・！？宇宙規模の兄弟バトル、ついに決着！２体の「ボルシャック」が激突する激アツデュエマの行方は？そして勝太たちは、無事に月から脱出できるのか！？

ボルシャック・ドギラゴンを手に入れ、月から戻ってきた勝太たち。旅の疲れをいやすため立ち寄ったカードショップ滝川で勝太たちを待ち受けていたのは、新たなファンシーキャラだった！紳士的な態度に優雅な振る舞い、顔はわんこのデュエわんこっ！？謎多きファンシーキャラ・デュエわんこは、どうやらバサラと因縁があるらしく、勝太をバサラに引き合わせる。新たな革命の力を手に入れた勝太は、バサラの禁断カードにリベンジを果たすことができるのか！？

勝太とバサラのデュエマはますますヒートアップ！ボルシャック・ドギラゴンとドキンダムＸが激突しようとしたその時、バサラを青い炎が襲う。禁断のカードが、ついに使用者であるバサラを蝕もうとしたのを察知し、デュエマーランド社長は奥の手を使うことを決める。一方、デュエマーランドは「デュエルマ・スターカップ」終了のお知らせで大パニック！戸惑う勝太たちの前に現れたのはデュエマウスだった。ついに明らかになるデュエマーランドの企み。デュエルマ・スターカップ最終戦開幕だ！！

デュエマーランド社長からの命令を受け、勝太をデュエマで追い詰めるデュエマウス。あと一歩でデュエマウスの勝利というところで、デュエマウスの記憶に異変が起きる。デュエマーランド社長によって、記憶を操られていたのだ。勝太たちはデュエマウスとのこれまでの日々を思い出させようとするが！？ついに明らかになる、デュエマウスの中の人・忠次郎の本当の正体！デュエマーランドに嵐が吹き荒れる！！

デュエマウスは爆破され、バサラたちデュエマーランド三幹部はリストラに。ギョウと共に怪しげな動きを見せるデュエマーランド社長は、「デュエマーランド大反省会」の開催を宣言する。大ホールに集められたデュエマーランド社員たち。ステージに現れた社長は、デュエマーランド三幹部がリストラされた理由を語りだす。明かされるデュエマーランド社長の企みの全貌。そして新たなデュエマーランド幹部が着任！？一体どうなるデュエマーランド！？

仲間となったデュエマウスと共に、打倒デュエマーランドに立ち上がった勝太たち。しかしデュエマーランドのアトラクションのひとつ、「デュエマ城」は悪魔の城へと変貌していた。その名も「デュエ悪マ城」だ。城内で待ち受けるデュエマーランド新幹部・ゲンちゃん！原始人ながら礼儀正しいエリートビジネスマンのゲンちゃんだが、ある数字をきっかけにヤバい本性が明らかに！？そして侵略の上をいく新能力「Ｓ級侵略」とは！？

デュエマーランド社長への復讐を誓い、デュエ悪マ城に潜入したバサラ・ハカセ・ランボー！最上階へと向かう途中、ハカセとランボーをゾンビ化させた新幹部の一人・ゾンさんの居場所を突き止める。ハカセとランボーはバサラを先に行かせ、ゾンさんへのリベンジを果たそうとアトラクションに突入するが・・・！？死亡フラグを立てまくりながらもゾンさんとのリベンジマッチに挑むハカセとランボー。２人同時に相手してやると豪語するゾンさんの実力は！？ゾンビだらけのデュエマが始まる！！

ハカセたちがゾンさんと戦っているスキに、次のアトラクションへとたどり着いた勝太たち。扉を開けると広がっていたのは大宇宙・・・かと思いきや、手作り感満載のショボい部屋だった。勝太たちが呆れていると、異様な迫力の黒服２人組が現れる。そして、どうみても宇宙人の新幹部・チューやん登場！チューやんの無重力デュエマに立ち向かったのは、勝太たちの危機を察知して駆けつけたデュエわんこだった。

デュエ悪マ城に隠されたドキンダムＸのカードを取り戻し、デュエマーランド社長の元へたどり着いたバサラ。ハカセとランボーの仇（かたき）、そして自分のデュエマを邪魔した社長に復讐すべく、デュエマを申し込む。山札やシールドにカードを仕込み、イカサマでデュエマを有利に進める社長と、それに構わず突き進むバサラ。勝太たちが社長とバサラの元へたどり着こうというその瞬間、デュエ悪マ城に大異変が・・・！？

今年もやってきたバレンタインデー。勝太にイイ感じにチョコを渡したいるるは、ひとり脳内会議を開始する。ヒロインとしてのパワー、いわゆるヒロイン力の低下をなんとかしようと、るるは「ヒロイン道場」の扉をたたく。アイドルから魔法少女まで、幾多のヒロインを生み出してきたといわれるヒロイン道場の実態とは！？勝太にコジロー、さらには熱血ナレ太郎まで巻き込んで、乙女の想いが大暴走！！るるのチョコの行方は！？

デュエマーランド社長こと伝説の卑怯者・牛次郎。その真の目的は切札兄弟への復讐だった！世の中からデュエマを無くし、切札兄弟がみじめな負け犬になることを夢見る牛次郎だったが、そんな遠回りはやめて勝太たちを直接ぶっつぶすことを決意する！そんな牛次郎の行方を捜す勝太達のもとに突如ギョウが姿を現した。ギョウは牛次郎のスパイだったことをあっさり告白するが・・・！？

ギョウとの戦いでボロボロになった勝太をかばったのはデュエわんこ・・・！と思いきや中身はやっぱりルシファーだった！！なんとルシファーはファンシーキャラを装いつつデュエマーランドをひそかに調べていたのだ。完全復活した最強デュエリスト・ルシファーと最凶デュエリスト・ギョウがなつかしの舞台、デュエマ甲子園のフィールドでついに激突！再び時間は止まるのか・・・！？

デュエマーランド新幹部の1人、ゾンさんの力で、街は映画さながらのゾンビタウンに変貌をとげてしまった。ゾンビを撃退しつつも次々と死亡フラグを立てまくる勝太達。ぶっちゃけ・ホカベン・るるまでもがゾンビになってしまった時、ついに勝太がゾンさんと直接対決へ！？しかし勝太が取った行動は何だか予想外。友を見捨てる主人公と友を大事にするゾンビ！それぞれの未来をかけた戦いの結末は！？

新幹部が敗北し、ついに一人ぼっちになってしまった牛次郎。一方、デュエマウスは牛次郎と過ごした過去を思い出し、ある場所へ駆け出した・・・！牛次郎を発見したデュエマウスはデュエマの楽しさを思い出してもらうため、直接対決を申し込む。復讐の塊となってしまった牛次郎に、デュエマウスの思いは果たして伝わるのか！？

自らを犠牲にしてデュエマーハカイツリーの野望を阻止したデュエマウス。バラバラになったデュエマウスの部品を手にした勝太は、デュエマウスを再び作るためロボットについて学び始めるのだった。そんなある日、学校に突如デュエマウスが転入生としてやって来た。このデュエマウスは果たして本物なのか・・・！？

転入生デュエマウスになりすました牛次郎は、勝太を倒すべく、るる、ハムカツ、ホカベン、ぶっちゃけを人質にデュエマを挑んできた。絶体絶命に追い詰められた勝太。その時ふいに勝太のオデコが光り、デュエマウスの声が聞こえてくる。勝太に起死回生の一手はあるのか？そして牛次郎の野望を阻止できるのか・・・！？