バチカン市国の美術館で凶悪な強盗事件が発生し、世間に動揺が走る。そんな中、デビルハンターのダンテは知らぬ間に、2つの世界を結ぶ次元の裂け目を開こうと企む邪悪な陰謀に巻き込まれていく。

ワシントンDCでは、ダークコムが傭兵(ようへい)たちを集め、ダンテ自身とその首に下げている形見を確保するために懸賞金をかける。

明らかになるメアリの過去。時は変わって現在、貴重な積荷を運ぶ護送車が行く手を阻まれ、ホワイト・ラビットが獲物に忍び寄る。

ダークコムは、アミュレットの信号をたどって廃マンションにたどり着く。そこは本当にウサギの隠れ家なのか? それともワナなのか? 一方、ダンテは自身の出自の秘密を知ることになる。

おぞましい現実を知ったメアリの任務は思わぬ展開に。一方、ダンテは、空から勢いよく落下したことで大変身を遂げ、自身の悪魔の側面と向き合うことに。

ウサギの巣穴を探り出す道中、ある2人の子供時代にまつわる悲劇が明かされる。それは並行して存在し、後に絡み合う運命となる2人の物語だった。

最終決戦の舞台が整った。ウサギ率いる軍団がダンテの到着を待ち構える中、戦いへの覚悟を決めたヒーローがもう1人いた。

ダンテとメアリは苦渋の決断を迫られ、史上最強の敵と対峙(たいじ)することに。その余波の中、ベインズが大胆な計画を実行に移そうとしていた。