新市長に就任するジュリエットだが、外での出来事も過去も思い出すことができない。

行方不明者を捜索するビリングス。ダニエル･キーンは記者と遭遇する。

ジュリエットは回復すべく、ある行動に出る。自ら調査を進めたへレンは、その報いを受ける。

カミーユの追跡をまこうとするジュリエットは衝撃的な事実を知る。ダニエルは友人に助けを求める。

ジュリエットの帰還後の様子が次第に明らかになり、意外な者同士が手を組むことに。

ビリングスとハンクは新たな謎に直面する。一方、ダニエルとヘレンは驚くべき提案を受ける。

ジュリエットはルーカスとケネディに任務を与えて送り出し、追い込まれたカミーユはシムズに真実を話すように迫る。

ノックスの父親ガスが秘密を打ち明ける。シャーロットは人生を大きく変える決断を下す。

カミーユの発表にサイロ中が驚がくする。ダニエルとヘレンはある特別なイベントに出席する。

シーズン３最終話。リーダーが新しい世界で目を覚ます。