美琴（福本莉子）は、信州安曇野の梓川病院の内科病棟で働く３年目の看護師。ある朝、寝ぐせ頭のまま花瓶を持ってさまよう研修医・桂正太郎（菅生新樹）に水場を尋ねられる。そこで、花瓶に活けられている花の名前を間違えた美琴は、正太郎から小ばかにされ、少しムッとする。一方、正太郎は新たに転入した内科研修で指導医の三島（吹越満）からスタッフに紹介されたのも束の間、上級医の谷崎（内藤剛志）から毒舌の洗礼を浴びる。

若手看護師の美琴（福本莉子）は、新人研修医の正太郎（菅生新樹）とともに末期のすい臓がんで闘病する長坂（長野博）の急変に追われる。そして同じ内科病棟では誤えん性肺炎で入院するも食事を一切拒絶する高齢の患者・新村（白石加代子）への対応で苦悩していた。そんな中、内視鏡処置によって再び抗がん剤治療が再開できていた長坂の容体が再び悪化。美琴はさらにＶＩＰ患者の扱いをめぐり窮地に立たされる。

美琴（福本莉子）は内科病棟の主任代行に任命され、業務の重さに直面する。研修医の正太郎（菅生新樹）は循環器内科で“死神”こと谷崎（内藤剛志）の手厳しい現実主義と、患者が家族と過ごす時間を尊重したい自らの理想主義の狭間で揺れる。病棟では生花の扱いをめぐる会議が紛糾。看取りの現場では、命の選択が現実味を帯びる。美琴と正太郎はそれぞれの立場で葛藤を抱え、院内での小さな反発が大きな波紋へと広がっていく。

梓川病院に９２歳の救急患者・福富フミ（阪上和子）が搬送され、モニターの警告音が鳴り響く。相変わらず冷徹な診療方針を貫く谷崎（内藤剛志）と、そこに納得できない正太郎（菅生新樹）の治療方針がついに真っ向から対立する。そして、谷崎からの叱責を受けた正太郎は、谷崎の言葉の中に、隠されたある真実の存在を垣間見る。

ひとりの認知症患者の「食事」が巻き起こす、訴訟という大きな波紋。美琴（福本莉子）は、高齢の患者の誤嚥による急変と死を経験し、日常の忙殺と現場判断の困難に胸を締めつけられる。正太郎（菅生新樹）とのささやかな交流が慰めとなる中、病院側は訴訟回避を優先して検討会を開き、強引な幕引きの仕方を巡ってスタッフの間に亀裂が生まれる。専門職としての責任と病院経営の論理がせめぎ合うなか、美琴と正太郎が立ち上がる。

誤嚥による山口（平泉成）の死を巡り、謝罪と見舞金で決着を図ろうとする病院経営陣の姿勢に、美琴（福本莉子）は違和感を募らせる。正太郎（菅生新樹）もまた現場の倫理に疑問を抱き、二人は遺族と向き合う決意を固める。一方、新人の半崎（白河れい）は山口の死因をめぐる自らの責任に苦しみ、立ち直れずにいる。医療の現実と経営のあり方の間で病院が揺れる中、下された判断とは――。

急性胆管炎で搬送された内島やゑ（大方斐紗子）は治療を拒み、“穏やかな最期”を望む。一方、寝たきりの田々井富次は誤嚥（ごえん）性肺炎を繰り返し、孫の昭（三浦貴大）は延命を求めるばかり。正太郎（菅生新樹）は「胃瘻（いろう）をするかしないか＝生かすか死なせるか」という現実を前に葛藤し、美琴（福本莉子）と共に患者と家族の思いの狭間で揺れる。やゑの症状の再発と田々井の急変を前に、正太郎が導き出す決断とは。

再び容体が悪化するやゑ(大方斐紗子)と、衰弱が進む田々井を前に、正太郎(菅生新樹)は草花の生態からの学びを例えに、ある言葉を投げかける。その言葉を受けたやゑや田々井の孫は、命のあり方についての決断をする。正太郎との1年を通して美琴(福本莉子)もまた一人の医療者として大きな成長を遂げていく。そして、ついに別れと新たな出発の春が訪れ――それぞれが「命と向き合う自らの使命」にたどり着こうとしていた。