昭和30年7月、土砂降りの雨のなかを走る路線バスの中に、ロープで繋がれたびしょ濡れの男たちがぞろぞろと乗ってきた。全部で6人、16、17歳の少年たちは、異様な不気味さで立っていた――。

横須賀丈（通称：ジョー）にはメグという妹がいた。施設の園長から妹の里親が決まったと聞き、「早くここを出て、妹に会いたい…」と話すジョー。それを聞いたスッポンは「俺が会わせてやる」という―。

看守の石原は、唯一ほかの少年らと距離を置く野本（通称：バレモト）を呼び出し、桜木（通称：アンチャン）の罪状を告げた。バレモトは、少年らの前でアンチャンを「人殺し」と呼び、一同は困惑する。その時、図書館から火があがり、非常ベルが鳴り響いた―。

二舎が火で包まれるなか、二舎六房内にいた水上真理雄（通称：マリオ）、松浦万作（通称：キャベツ）、遠山忠義（通称：ヘイタイ）、ジョー、スッポンの5人は房内に閉じ込められていた。絶望的な思いでドアを見つめていた先に、アンチャンが5人を助けにやってきた。一方、バレモトは裏庭で六房の鍵を見つけ…。

丘の上の楠の巨木に将来の夢を書いて、再来年の夏、また7人で集まろう――。最後に文字を彫ることになったマリオは「みんなの夢がかなえばいい」と文字を彫った。一方で、火事の一件で担当を外された後に復帰した石原は、担当医の佐々木と共にある計画を企てていた。

石原の仕打ちに耐え続けたアンチャンだったが、次なる試練は仲間たちへの暴力による挑発であった。暴力を阻止したアンチャンを独房に連れて行った石原は、ニタリと笑いながら呟く。「…てめぇをシャバに出すわけにゃ、いかねぇんだよ」。

独房内ですっかり衰弱した桜木。一方で、桜木を救おうとした看守の熊谷は、佐々木と石原の陰謀により命を落としてしまう。そんななか、退院することになったマリオは熊谷の死を知る。「アンチャンを石原なんかに殺されてたまるもんか。絶対にアンチャンを助け出す――。」少年院に戻る朝焼けのなか、マリオは誓った。

バレモトの立てた計画により、ジョーが医務室に潜み、深夜に戻ってきて六房の鍵を開けることに。ジョーが医務室に行くということは、佐々木に弄ばれることを意味していた――。無事に鍵を持って六房へ向かったジョー。脱出作戦のはじまりだった。

脱出した4人は節子の元を頼っていた。一方で残ったバレモトたち3人は、脱走に逆上した石原と佐々木に始末されようとしていた。その時、ジョーが少年院に戻ってくる。残った3人を心配したアンチャンが一計を講じていたのだ。スッポンは街で会ったリリィから、米軍の賭けボクシングの開催を知らされ、マリオに出場を促す―。

賭けボクシングの敗戦から数日、マリオは次回の試合に向けトレーニングを開始。スッポンは洋モクを街で捌いて金を稼いでいた。戦争で家族を亡くしていたスッポンのため、節子の提案で4人で記念撮影をすることに。しかし、その幸せそうなマリオたちを遠くから見つめている男がいた―。

アンチャンは石原との因縁にケリをつけるべく腹を括っていた。対峙する二人。隠し持っていた拳銃を構え、狙いを定める石原にアンチャンのパンチが炸裂する。その頃、リングではマリオの左拳が相手を捉えていた。マットに沈むが、再び起き上がりファイティングポーズを取る相手。覚悟を決めていたマリオは封印していた右拳をついに繰り出す！ アンチャンとマリオそれぞれの戦いが決しようとしていた。

バレモトの調べで、スッポンたちは佐々木が市長選に出馬することを知り、脅迫を開始する。一方、マリオは沼津の灯台の先の突堤にいた。「どうしててめェみてェなポン中のために……アンチャンが死ななきゃならなかったんだよ」。石原の胸ぐらを掴むマリオ。バレモトが描いた復讐劇の始まりである―。

昭和30年。罪を犯し「湘南特別少年院」・二舎六房に堕ちた水上真理雄（通称マリオ）たち6人の少年。ケンカ、リンチが繰り返される毎日のなか、彼らは同房にいた年上の桜木六郎太（通称アンチャン）の教えを胸に、不条理と向き合い、強く生きていく―。

ジョーとヘイタイは、佐々木の愛人を利用し、彼を誘拐する。海岸へ連れ出された佐々木、そこに待っていたのはスッポン、バレモト、キャベツ、そしてキャベツが掘ったと言う大きな穴だった…。その頃、石原と決着をつけようとするマリオ。アンチャンの想いを知ったマリオは、石原が殺すに値しないことを悟るのだった。6人はアンチャンの復讐を遂げ、それぞれ前に進もうと決心する―。

マリオは想いを寄せる節子を映画に誘う。しかし節子は親の工場を救うため、お見合いを決断したことをマリオに話せずにいた―。ジョーからその事実を聞いたマリオは、仕事場であるバーで、酔って飲み代を踏み倒そうとした客に暴力を振るってしまう。翌日客は事件を警察に通報、マリオは暴行・傷害の容疑で逮捕されてしまう―。

検事が起訴するかしないか、残されたマリオの拘留期間は10日しかなかった。バレモトの計画では、被害者の上申書がどうしても必要だった。一人はバーの被害者のもの。もう一人は数年前、マリオが担当教師に重傷を負わせた際に現場にいた吉田淳子のものだった。ジョーとキャベツが淳子に話を聞くなかで、マリオが少年院に入った理由が判明する―。

久々に節子と会い、改めて結婚することを告げられたマリオ。しかし、若いマリオは湧き上がる気持ちを抑える事ができなかった―。二舎六房の少年たちはそれぞれの道を進み始めようとしていた。歌手になるため、ファイブレモンスのボーヤとして働くジョーに、ある日、一大チャンスが訪れる。偶然見に来ていたライブで、ボーカルの代役として急遽ステージに立つことになったのだ。「このチャンスを絶対ものにする…」ステージに照明が灯され、ジョーのステージが始まった！

芸能事務所のマネージャーの山内に見初められたジョーはボーヤを辞め、彼女について行く事を決意する。少年院の仲間との縁を切るよう言われたジョーは、声をかけて来たスッポンに冷たく当たる。それでも変わらぬ仲間の優しさに、ジョーは涙を抑える事ができなかった…。やがて、人気の出始めたジョーは、「ウェスタン・フェスティバル」へ出演することとなる。だが、ジョーを引き抜かれたことをよく思わないファイブレモンズのマネージャー坪内が、脅しまがいの要求をしてくる。

フェスティバル当日、準備をするジョーたちのところへ突如乗り込んできた坪内とファイブレモンス。ジョーをフェスティバルに出演させまいとする坪内たちは、ジョーに暴行を加え始める。見かねたピアニストの川又が彼らを諭すが、坪内は話しを遮り発砲する。その銃口がジョーに向けられた時、川又の息子シゲオに案内されたマリオたちが駆けつける！ その頃メグは、フェスティバルに出演する「横須賀ジョー」が兄であることを期待し、一人開演を待っていた。

ジョーとメグの再会を祝して乾杯するマリオたち。山内に捨てられたジョーは、夢を諦めずに歌手を続けると語る。彼を始め、それぞれが夢に向かって努力していた…。そんななかキャベツは、ジョーの一件で福本組と関わったことをきっかけに、密かにヤクザの世界に憧れを抱いていた。スッポンとバレモトは、キャベツがヤクザになるのを阻止するものの、結局福本組へ入ることに。しばらくして、マリオたちのところに、福本組が襲撃されたという情報が入る。救急車が駆け付け、組の若い衆が病院に運び込まれたらしい。マリオたちは急いで病院へと向かった！

マリオの店を後にする六人。スッポンはバレモトから家に来ないかと誘いを受ける。バレモトは、そっくりの双子の弟たちと母とぼろぼろの平屋に暮らしていた。その夜、スッポンは法律の参考書を買うために金を借りたいとバレモトに相談される。しかし、バレモトは女郎屋で出会ったエリに入れ込み、家族や仲間たちさえも裏切ろうとしていたのだった―。

エリを連れ、共に生きていく決意を固めたバレモト。待ち合わせの約束をした銀杏の大木の下でエリを待つ。しかし、結局そこにエリが現れることはなかった―。雨の中待ち続けたバレモトは倒れてしまい、マリオの家に運び込まれることになる。そして、意識が戻ったバレモトは偶然見た新聞記事に目が釘付けになる。そこにはエリが他の男と心中したと書かれていた！

スッポンはリリィから仕入れたヨウモクを売って生計を立てていた。そんなある日、一分屋の杉老人に声をかけられ、金貸しの商売を手伝うことに。一方でリリィは、米将校に騙され、住んでいた家から追い出されてしまう。貯め込んでいたお金まで持ち去られたリリィ。それを知ったスッポンは、「リリィの暮らしが立つよう自分が何とかする」と決意する―。

リリィとマリオがスッポンの家を訪ねると、高熱で倒れているスッポンがいた。ただの風邪という医者の診断を疑うマリオ。スッポンを大きな病院で診察をさせるため、リリィらは米軍基地へと向かった。そのなか、スッポンは病院を抜け出し、「家族」のために大きな賭けに出るのだった―。

リリィは、スッポンが自分のために危険な取り立てに向かった事を知り涙を流す。自分のせいでスッポンが危険な目に遭うと思ったリリィは、彼の前から姿を消そうと考える。だが杉老人の言葉を聞き、リリィは考えを変える。彼女は生まれて初めて家族の大切さを知り、これからの生き方を決めるのだった。

マリオはジェフリーに呼び出され、米軍ボクシングジムでジミーという男に出会う。「もう一度リングに上がりたい」そう願い、トレーニングを日々続けていたマリオ。それは二舎六房の生き残り皆の胸の中で生き続けるアンチャンの夢を叶えることでもあった―。マリオの手は無事に完治し、試合に勝つことができるのか!?