リコとリムがクラスメートのケンとタマオと公園でバスケの勝負する約束をして家に帰ると、ハルカ母さんが獣医のフーコさんからあずかったかわいい子ネコがいました。 家の中を走り回る子ネコのライラを追いかけて、暗い屋根裏部屋に入ったリコとリムは古めかしいソファの上にとても不思議なかわいいものが置いてあるのをみつけました。

リコとリムのクラスにヴラドニアから転校生のカノンがやってきました。 キラキラした金髪がとてもきれいな女の子です。図書館で本を探していたナギサ姉は留学生パルスに話しかけられました。おばあちゃんが書いた本を探しているそうです。家の屋根裏部屋でパルスが探していた本をみつけたナギサはリコとリムからキルミンの秘密をうちあけられましたが･･････。

ケンやカノンと遊んでいたリコは、へんな雄猫ブサネコになつかれてこまってしまいます。 ブサネコが教室までついて来たのでルミコ先生に注意されてしまいました。 外国から帰ってきたハルカ母さんには３人がキルミンをつかったことを見つかってしまいます。でも「パパにはないしょ！」です。

森の洋館で母親のミサにタマオと仲良くするように言われますがケンが気になっているカノンはケンの家に行ってみます。でもお店にはケンのお父さんしかいませんでした。 なんだかあやしいリコとリムの秘密をさぐりに、ケンとタマオはリコ達の家に忍びこみます。 お庭の小さな入口から屋根裏部屋にたどり着いたケンとタマオは･･････。

迷子になったクラスメートのユカリの子ネコを捜すためリコ達はきぐるみモードに変身して、子ネコのまろのあとをたどり始めます。川岸で環境調査をしているミサ達と市長達からケンとタマオは川をきれいにするためにどうしたらいいか尋ねられたりしていましたが、リコとリムに会って一緒にまろを捜し始めます。

学園からの帰り道、パルスと再会したナギサは彼が探している本を書いたのはおばあちゃんだとうちあけました。一方アニマリアンたちはもみじフェスティバルを計画の舞台に選びます。リコたちとフェスティバルにやってきたナギサがパルスと輪投げや金魚すくいをしてドキドキしていると･･････。

リコたちが暮らす神浜市の郊外に広がる神浜樹海を横切るフリーウェイで、チーターがスピード違反をしたとか、神浜市は野生動物のうわさで持ちきりです。リコたちは神浜樹海のハイキングコースにどうぶつたちの調査に向かいますが･･････。

学校新聞のスクープを捜しているリムに、タマオがカトレア学園の学園七不思議と呼ばれる伝説があることを教えてくれます。リムたちはこっそりと夜の学園に伝説の秘密の取材に向かいます。ところが誰もいないはずの学園には怪しい人影が･･････。

いつものように言い合いをしてルミコ先生にしかられたリコとケン。ケンは店のお肉を届けた中華料理店から最近ネズミがいなくなったと聞いて、とても気になります。 中華料理店の屋根裏に忍びこんだケンは･･････。

５年２組のみんなと西森山へ写生遠足に出かけたリコたち。ミサからタマオをアニマリアンにするように言われたカノンですが、タマオはケイコにまかせて、ケンのハートを射止める作戦をたてはじめます。みんなが絵を描いていると子ザルが現れて･･････。

冬休みが始まり、今日はリコたちの家にみんなが集まってパーティーをひらくことになりました。ケンに誘われてやってきたカノンはヴラドニア風のお菓子を持ってきてくれました。御子神家の中でリコたちのヒミツを探し始めたカノンは･･････。

神浜港のカウントダウンイベントに来たリコたちは、ケガをした迷子の犬をみつけ、フーコ先生にみてもらいます。にぎやかな港で犬の飼い主を捜し始めたリコたちはディナークルーザー・喜代志丸で開かれるパーティーに「探偵ラッキー」を一目見ようとやってきたケンたちと一緒に･･････。

ようやくフナコツさんをみつけたリコたちは港のネコたちの助けをかりたりして、フナコツさん救おうと頑張りますが、なかなかうまくいきません。変身したリムは助けを呼びに走りますが･･････。

屋根裏部屋に集まって探偵団をつくろうと話しているリコたちに、ハルカ母さんは宿題を出しました。 近所の老犬のゴンが最近食欲がなくなったわけをキルミンを使わずに調べられたら探偵団を認めてあげるというのです。ゴンの飼い主のヒデアキくんからゴンが元気がなくなったのは散歩から帰ってからだと聞いたリコたちは･･････。

探偵の依頼が来るのを待ちあぐねていたケンとタマオは「ネコ探してます」という張り紙を見つけて勝手に捜査を開始しました。不思議な絵を描く前衛画家のサユリのネコ、グレースが行方不明になっていたのです。キグルミモードに変身したリコとリムも一緒にグレースの残した跡を探しますが･･････。

カトレア学園の幼稚園では発表会でつかう「ブレーメンの音楽隊」の衣装が無くなって大騒ぎです。 しょんぼりしているさくら組のラン先生をはげますようにリコたちは衣装探しを始めます。タマオはニワトリの役をやるはずだった園児のシューイチ君と一緒に衣装探しを始めましたが･･････。

汚水を垂れ流しているという噂の有賀ケミカルの金庫に『金は必ず頂戴する！怪盗レディ・パンサー』という黒ヒョウマークのカードが突き刺さった！たまたま有賀ケミカルの社長の邸宅に配達にやってきたケンは届けた大きな肉がペットのえさだと聞き、最近この付近で続いているペットの行方不明事件との関係を調べ始めましたが･･････。

ルミコ先生が出した「想像上の生き物をつくる」という図工の宿題に悩んだリコはショッピングセンターにいこうとします。 一方、怪盗ルックに身を包んだカノンはケイコを従え、そのショッピングセンターにあるカラクリ時計の妖精の人形を盗みに忍び込みましたが･･････。

お赤飯の急な注文が来たためにお父さんと海洋博物館に行けなかったトシキは、シーラカンスを見るために、大雨の中、愛犬のトトと２人だけで家を抜け出してしまいました。クラスメートのアカネから弟のトシキがいなくなったことを聞いたリコたちは匂いをたよりにトシキを探し始めましたが･･････。

「桜屋敷」に吸血鬼が現れたという噂を聞いたリコとリムが旧市街の古い屋敷に行ってみると、アキトという不思議で神秘的な雰囲気の少年が住んでいました。アキトがアニマリアンではないかとカノンもコウモリに変身して向かいますが･･････。

家族そろって猫又温泉にやってきたリコたちは、楽しみにしていた鍋の材料が盗まれてしまったと聞いて、犯人捜しを始めました。旅館の稲葉さんは巨大ネコ妖怪「猫又」のしわざだと言いますが･･････。

ミサのお仕置きから逃げ出した牙組の新井くんは、アライグマの姿で御子神家に潜り込み、 「ラクちゃん」と呼ばれてかわいがられています。神浜自然公園でアライグマが目撃されたという話を聞いたリコたちは、ラクちゃんの飼い主を探しに向かいましたが･･････。

なかなか変身できないタマオはナギサに動物と仲良くなることから始めるように言われて、ふれあい広場のニワトリに近づこうとしてみますがうまくいきません。しょんぼり家に帰ったタマオの部屋の窓から、突然、鳥が飛び込んで来ました！

もうすぐ課題曲のテストがあるので、リコーダーの練習をしているリコとリム。リムは上手ですが、リコは変な音を出してしまいます。ミサがパルスに探させている「棺」を探偵団に調べさせようと、怪盗ビューティーバットからは、またもや挑戦状が届きましたが･･････。

リコが見た不思議な光の謎を解明しようと神浜自然公園にくりだしたキルミンズのメンバー。 そこで見たのは、動物たちをつぎつぎと捕まえていくＵＦＯの姿だった！なんとか動物を助けようと奮闘するリコ・リム・ケン。そして、３人がピンチに陥ったそのとき、ついにタマオが･･･！？

キルミンズと動物たちをつかまえたＵＦＯがついに宇宙に飛び立った？！ もし宇宙人の星に行ったら大変！なんとか地球に戻ろうと操縦室を探し始めたリコたちですが、中はまるで遊園地のアトラクションのような施設ばかりで･･･。はたして！リコたちは無事に地球に帰れるの？

春休みの課題レポートのため、神浜博物館にやってきたリコたち。 博物館では、開催されている古代エジプト秘宝展のネコの石像が夜な夜な動きだすという化け猫騒ぎでもちきり。捜査している警察官の大関・小結から話を聞いたリコたちは、化け猫騒ぎの真相を解明しようと夜の博物館に潜入するのですが・・・・・・。

ママにキルミンを没収されてしまったキルミンズ。キルミンが気になるリコとタマオに、なくても普通に過ごすリムたち。我慢できなくなったリコは学校の作文もそっちのけで家の中を探しはじめます。一方、変身できるようになったタマオもどうしても練習したくて、キルミンを返してもらおうと御子神家に向かいますが―

桜が満開の水平線が見える草原で、着ぐるみモードでお花見気分のリコとリム。キルミンに出会ってから、楽しいことも不思議なこともいっぱい！二人はお団子を食べながら、キルミンを見つけてからの思い出をのんびりはなしはじめます。

モップに似た姿をしているネコに出会ったケンは、そのネコにさわったら、黄色い悪魔みたいなものが見えたと話します。同じネコにあったリコたちも、ハルカママから似た話を聞いて、キルミンズで正体を暴こうと捜索を始めます。 そんな頃、カノンと一緒に行動しているアニマリアンの桐野が行方不明になってしまい―

白黒山には踊るガイコツが現れる・希少動物を出すレストランがあるなどおかしなウワサがいっぱい。気になるリコたちは白黒山に向かいます。そこでちょうど弓道部の練習をしていたナギサも加わって、ナゾの解明に乗り出したキルミンズは、山奥に住む鬼婆の話を聞きます。そして、カノンもアニマリアンの半田を探して、白黒山にやってきて―。

タマオは悩んでいた･･･「どうして僕だけがちゃんと変身できないのか」。リムに気持ちをちゃんと伝えられれば、自分の意思で変身できるかもしれないと思い立ったタマオは、１人考え始めます。はたしてタマオの想いはリムに伝わるの？ 一方、神浜動物園ではオスライオン・アーサーのたてがみがなくなるという事件が起こって―

クラスメイトのミツルとペットのユキが川で大きくて真っ黒い何かと遭遇した！？ スクープに目を光らせたリムは真っ黒い何かの正体を突き止めようと川へ調査に向かいます。そしてその川をゆくゴンドラ船では、ケンとタマオの２人を品定めしようとしているミサが乗っていて、心配になったカノンも向かいますが―

お家の玄関先に突然現れた傷ついたオオカミ。そのオオカミからパルスのニオイを感じたナギサは不安になって彼を探しますが、どこにもいない？！落ち込むナギサを心配したリコたちはパルスの行方を探そうと調査開始！しかし、そのオオカミこそが変身したパルスだった。図らずも御子神家に入ったパルスは、ある人物に出会って―

動物たちと触れ合う「神浜ハグハグウィーク」がやってきた！ クラスで鳥の巣箱作りをすることになったリコたち。リーダーになったリコとカノンは、途中で巣から落ちてしまった親ツバメに出会って、その巣を探すことに―。急ぐリコは変身したいのですが、カノンにばれてしまうかも！？ツバメの巣は見つかるの？？

ケンのお父さんが毎年、どこかへ宝探しに出かけている！？ 後をつけて行ったリコとケンは、突然現れたゾウのせいで、向かった先の洞窟に閉じ込められることに―。キルミンで変身しても、洞窟の岩はびくともしない。はたして、リコとケンは無事に洞窟から脱出できるの！？

家庭訪問の季節、キルミンズの面々も先生がお家にやってくるとあってドキドキワクワク。 だけど、リコたちが先生と一緒に家にやってくると聞いたカノンは、「スパイにくるのでは！？」と気が気じゃない。アニマリアン・牙組に指示をして、なんとかして先生だけを連れてこられるように策を巡らせますが―。

神浜市で話題のヒョウ仮面に遭遇したフーコ先生は、ヒョウ仮面の顔が本物の動物のそれだったとやってきます。 ハルカの許可を得たキルミンズは謎の解明に乗り出すけれど、リコとケンの様子がいつもとは違っていて―。 一方、羽鳥家では牙組の新しいリーダーになった地井が行方不明になっていた！ キルミンズはヒョウ仮面の正体を暴けるの？？

「ヒョウ仮面はいままで一体どこにいたんだろう？」と考えるキルミンズに、神浜森林公園近くの祠の水を飲むと妖怪になるというニュースが舞い込んできた。その真実を確かめようと祠に向かったキルミンズの前に立ちはだかったのは、祠を守る妖怪たちだった？！ピンチを切り抜けようとキルミンでねずみになろうとしたケンでしたが、なんと･･･

リコたちのようにキルバラ変身もできず、とうとうネズミにも変身できなくなったケン。 みんなの励ましも逆効果で、ついにリコにキルミンを返して･･･「キルミンズをやめる」と宣言！ショックを受けるリコたちはそれでも妖怪の謎を解明しようと再び祠に向かいます。一方、ケンはカノンに誘われるまま、カノンの家に迎えられます。２人っきりになったそのとき、カノンはついに―！

太陽が照りつけるビーチで、着ぐるみモードのリコとリム。 ナギサがバナナボートを探している間、ビーチにパラソルを立てた２人は、キンキンに冷えたかき氷を食べながら、これまでに出会った人たちの思い出をのんびり話しはじめます。

キルミンズのミーティング中、屋根裏部屋の壁が突然動き出した！新たな空間で見つけたユウキ博士のビデオを見ていると、誰もいないハズのお家から誰かの声が聞こえてきます。もしかして泥棒？！リコたちは早速、ナゾの侵入者をつかまえようとしますが―果たして、リコたちはお家を守りきれるの？！

市役所では、白ヤギと黒ヤギが突然出てきては書類を食べてしまうという事件が発生！ 世界遺産計画の書類もそのヤギに食べられてしまったミサはあることに気づいて、桐野と大造に命令をしますが、２人はカノンに助けを求めて―。一方、リコたちキルミンズもハルカから事件の調査を依頼され、市役所に向かいます。さて、事件の真相は？

リコたちがアニマリアンだった！というおどろきの事実にもいつもと変わらないキルミンズの面々。じゃあ、今まで出会ったアニマリアンはどこからやってきたんだろうと考えていたその時、目の前で男の子がペンギンになった！追いかけるリコたちはペンギンのアニマリアンをつかまえられるでしょうか。 一方、カノンはミサから海外からやってくる純血アニマリアンとのお見合いを言い渡されて―

夏の課外授業でやってきた海で、リコたちはルミコ先生の彼氏に遭遇！ルミコ先生の彼氏にアヤシイにおいを感じたキルミンズは、ちょうど居合わせたカノンと一緒に正体を暴こうとするけれど、実はなんと―！ 一方、その海には二ツ木から「実験」に招待をされたミサにアニマリアン牙組もいあわせていたのだった！

神浜市がジャングルになった！？ある朝、神浜市のいたるところに熱帯植物が群生していて、街はパニック！しかも、中央公園では人間が突然動物になったとアニマル課の2人から連絡が入ったキルミンズは事態の解決に向かうのだけれど―。 リコたちキルミンズは、動物になった人たちを元の姿にもどせるの？

ペット行方不明事件で居場所がわからなくなっていたペットたちが突然戻ってきた！？今までどこにいたのか動物たちから話を聞いてほしいとアニマル課から依頼をうけるリコたちキルミンズ。 そんなキルミンズのもとに怪盗ビューティ・バットから予告状が届く。 ビューティ・バットが狙うのはキルミンだと考えたリコたちは、キルミンを守ろうと手段を考えますが･･･。

怪盗ビューティ・バットの正体はカノンだった！驚くキルミンズの前から逃げるカノンの前にあらわれた二ツ木は「おじいさまにあわせてあげる」と言い出して、導かれるままついていくことに･･･。 それを見たリコたちは、カノンを二ツ木から助けようと追いかけるものの、逆につかまってしまって―果たしてリコたちは無事にカノンを二ツ木から助けることができるの？！

キノコ男こと二ツ木に連れ去られてしまったカノンを助けようと、地下のＵＦＯ施設を縦横無尽に駆け回るリコとケン。２人を追ってきた、リム・ナギサ・タマオは同じＵＦＯ施設の中で、かつて遭遇した学校七不思議の怪人さんに遭遇してしまって、絶体絶命の危機？！ そして、カノンは二ツ木におじいさんが眠っている棺の元へ案内されるのですが―。

神浜市で起こっていた一連の動物にかかわる不思議な事件も今日で決着！？ついに地下のＵＦＯ施設で一堂に会したキルミンズにカノンたちだったけれど、突然起きてきたルーファスに大混乱！必死に話しかけても声が届かなくて途方に暮れるカノンのために、キルミンズが立ち上がる！ どうする？どうなる？神浜キルミンズはみんなを助けることができるのか？！