天満にフラれたと勝手に思い込んで日本を逃げ出していた播磨は入魂の漫画を完成させ、再び彼女に告白するため学校に戻ってくる。が、天満は播磨と八雲がラブラブと勘違いしていて…。勘違いが勘違いを呼び、スクラン二学期は大パニックの予感？！

もうすぐ文化祭。文化祭の出し物を何にするかでクラスは紛糾、ついにサバイバルゲームで決着をつける事に。喫茶店軍と演劇軍に分かれ、夜の学校は戦場と化す。そこへ予期せぬ敵も現われて、事態は風雲急を告げる！

戦いの中で次第に明らかになってゆくもつれた人間関係。己のプライドと存在を賭けて戦士たちは戦う。そしてサバイバルゲームはクライマックスの瞬間を迎える。天満ＶＳ烏丸、播磨ＶＳ花井…果たして最後に生き残るのは？！

すべての決着がつき、文化祭の準備に忙しい一同。学校に泊り込みで作業を進める。みんなで銭湯に行ったり夜食を食べたりと青春を謳歌する一同。それぞれの夢と希望と恋心と勘違いを乗せ、いよいよ文化祭が始まる！

文化祭一日目。2Cの喫茶店は女子の奮闘で大盛況。が、思わぬ新規店が現われて、矢神祭売り上げナンバー1を競って喫茶店戦争勃発！さらに今日はなんと烏丸の誕生日！手作りケーキを用意して烏丸に渡そうと張り切る天満だが…。

文化祭二日目。高野晶脚本監督による2Cの演劇『眠りの森の美女』が上演される。王子役は愛理、姫役は美琴、のはずが蓋を開けてみれば、なんとベッドで眠っていたのは播磨！急遽アドリブで進む演劇の思いがけない結末とは…？！

文化祭も無事終了。ピクニックに出かける天満、八雲、愛理、美琴、晶、播磨、花井、今鳥。男のアウトドア料理対決が始まる！他、スクランキャラたちのバイト風景のオリジナル・バラエティー編！

女子バスケ部が新設され、入部する天満、美琴、嵯峨野、一条、ララ、麻生を好きな新キャラ・さつき。麻生ら男子バスケ部員の協力を得て、地区大会に向け練習する一同。しかし天満は試合のメンバーから外されてしまい…。

試合のメンバーから外され、失意の天満の前に現れる謎の男たち。彼らにバスケの猛特訓を受け、生まれ変わった天満はかつてのチームメイトたちの前に敵として戻って来る。かくして壮絶なバスケの試合が始まった！

最近すっかり2Dに入り浸っている天満。天満を取り返そうと、東郷たちとトランプで賭けをする播磨と花井。だが、あっさり負けてしまい、頭に血が上った二人は次々にクラスの人間を賭けてゆくが…？！

周防工務店と花井道場の合同芋煮会に参加するスクランキャラたちのスケッチ、地震をきっかけに彷徨う西本の秘蔵DVDコレクションの行方、恋の懺悔に戸惑うサラの新米シスター生活など、バラエティー三本立て。

天満の誕生日がやって来た。あいにく美琴や愛理や八雲は忙しくて、誕生日を一緒に過ごせない。ガッカリしている天満を喜ばそうと、最高のシチュエーションを用意して天満を外に連れ出す播磨だが…？！

いよいよ期末テスト。矢神高校七不思議のひとつ・留年先生が出る季節だ。彼は普段は見えないが、進級が危うい生徒がいると傍に現われて警告する。留年先生を見てしまう播磨と天満。大ピンチの二人の運命や如何に？！

メルカドで天満の誕生パーティーが盛大に行われる。だが、そこには肝心の烏丸の姿はなかった。寂しい天満。一方、談講社から漫画のアシスタントに呼び出される播磨。なんと播磨を待ち受けていた漫画家とは…？！

漫画家の代わりに描いた播磨の漫画が雑誌に掲載される。播磨を気に入った編集長はクリスマスまでに120Pの漫画を描けと言う。ところが絃子はスノボー旅行中で家に入れず、播磨は塚本家に居候して漫画を描く事に…。

天満の逆鱗に触れ、塚本家を叩き出される播磨。路頭に迷う播磨を見かけた美琴は、自宅に播磨を連れてゆく。驚いた事に周防家には愛理も居候していた。愛理は親から見合いを勧められ、家出をしていたのだった。

愛理を探しにナカムラが周防家にやって来る。密かに愛理を外に連れ出す播磨。見合いを断りたい愛理の心情を察し、播磨は話をぶち壊す事を約束する。ところが見合い現場には愛理の代わりに天満がいて…！

クリスマスが近づいて来た。クリスマス・ツリーの飾り付けのバイトをする播磨と愛理の話、クリスマスに一旗上げようとする西本、吉田山、奈良の話、異空間に飲み込まれるサラ、八雲、晶、天満の話など、クリスマス序盤編。

クリスマス・イブの日。烏丸への手作りプレゼントを完成させる天満。一方、播磨もついに漫画を完成させる。天満に原稿を見せ、褒められた勢いで談講社に原稿を届けに向かう播磨。が、その行動が思わぬ事態を引き起こす！

主役たちのクリスマス・イブのドラマが進行する裏側で、イブを一緒に過ごす特定の人がいないサブキャラたちのささやかな一日のスケッチ。恋をしている人、いない人、それぞれの想いを包んでイブの夜は静かに更けてゆく―。

私、塚本天満。華の高校二年生！クリスマスも終わって冬休み真っ只中！！・・・・・のはずなんだけど、あれ？あれれれ？播磨君、どうしたのその服。ってあたしもなんでこんな格好してるの～！？よく見たらみんな変な格好してるし。あっ、でも烏丸君はいつもの学生服だ、やっぱりカッコイイなぁ～♡

いよいよお正月。初詣に出かけた天満は神社で偶然烏丸と出会う。一方、播磨は美琴から獅子舞の手伝いを頼まれるが、ペアの相手はなんと・・・！他、凧揚げ、百人一首、羽つきなどお正月気分満載の一本。

お正月太りを解消する為、スキー旅行に出かける天満、愛理、美琴、晶。ララ、東郷、ハリー、一条、今鳥、さつきはスケート大会に出場する。その頃、播磨は週刊『ジンガマ』春の増刊号の漫画の執筆に勤しんでいた・・・。

愛理の家の豪華クルーザーで優雅にクルージングを楽しむスクランキャラたち。ところが思いがけぬアクシデントで漂流してしまうが！！！一方、花井は見知らぬ土地で愛しい人（？）と出会うのであった。

漫画の締め切りが迫り、家で必死に原稿を描いている播磨。そこへ天満がアシスタントをしに現われる。突然の天満の出現にパニクる播磨。実は天満を播磨のところへ向かわせたのは八雲だった。果たして八雲の真意とは？

漫画の原稿を描き進めるうち、ひょんな事から初めて播磨と出会った時の記憶を蘇らせてしまう天満。窮地に立たされた播磨は天満にすべてを告白しようとする。しかし、そんな二人にさらなる衝撃が待ち受けていて・・・！