米不足で江戸でも米問屋への打ち壊しが起った。米に代わるものとして、青木昆陽(高橋和也)が進めるさつま芋の栽培を忠相(高橋克典)は推挙する。一方、善人かつおせっかいで知られる吉兵衛(高橋克実)と女房・お春(有森也実)が営む豆腐屋で、3件の食あたり事件が起った。貧しい人に吉兵衛がタダで渡してあげた豆腐が原因とのことであった。榊原(勝村政信)の処置で患者の症状が和らいだが、忠相は早速調査を命じる。

忠相(高橋克典)の母・妙(松原智恵子)は懐かしい友・綾乃(多岐川裕美)と再会した。しかし、綾乃が仕える旗本朽木家では騒動が起こっていた。長男・宗之助(辻本祐樹)と綾乃は濱田屋(正名僕蔵)の雇った浪人者に襲われ、重傷の綾乃は養生所に運び込まれる。一方、朽木家当主・宗一郎(堀内正美)は酒毒に溺れていた。すべては後添いの類(清水美砂)が実子の宗次郎(山口大地)を次期当主にするための企みであった。

南町奉行所の同心・綾田(松澤弘晶)が殺された。傍らには『しんでしまえ』の六文字が書かれた紙があった。忠相(高橋克典)はやくざ者に襲われたお秋(アオイヤマダ)を役宅でかくまったが、お秋は襲われた理由を言わない。忠相は自ら市中の見廻りを行った際、赤ん坊の身代わりとして、長屋に立てこもった浪人たちの人質となる。忠相の前に現れた浪人たちの頭・お蔦(高橋かおり)は、お秋の身柄を引き渡すよう要求する。

左門(嶋田久作)が行きつけの煙草屋の喜八(尾上寛之)と千代(大後寿々花)の夫婦は稲葉屋の若旦那・大三郎(森永悠希)と吉原を足抜けしてきた遊女・雛鶴(宮部のぞみ)をかくまうことになる。雛鶴の治療費を背負い込んだ喜八は、質屋・伊勢源の蔵で盗人・伊兵衛(中村梅雀)と鉢合わせする。伊兵衛から百両を渡された喜八は町方にすぐに捕まる。喜八の犯行を否定する左門に、忠相(高橋克典)は捜査を命じる。

普請場の事故を機に、伊織(勝村政信)と雨宮信次郎(中山優馬)は、忠相(高橋克典)も驚くほどに親しくなる。信次郎は直参御家人の弟で部屋住みの身。元女中のおそで(井上小百合)と恋仲だが、彼女は母の薬代に困っていた。夜道で信次郎とすれ違った伊織は、彼の袖に血がついているのに気づく。同じ夜、金貸し・桂香庵(要冷蔵)が殺され、信次郎がおそでのために十両を用立てたと知った伊織は疑念を深めていく。

大店の娘が誘拐され身代金を払ったにもかかわらず殺された事件を受け、忠相(高橋克典)は市中の警戒を強める。そんな折、同心・駿介(財木琢磨)は世間ずれしていない姫・おすず(山本千尋)と出会う。おすずは家出してきたらしく、かたくなに身元を言わなかったが、駿介は大店・美濃屋の娘だと聞きだす。しかしそれは嘘で、なんと本当の美濃屋の娘・お久は誘拐されていた。さらには誘拐犯の魔手がおすずにも迫っていた。

(高橋克典)の妻・雪絵(美村里江)は、義母・妙(松原智恵子)が布団に粗相をしたと思い、忠相に同居を提案する。一方、裏通りに小店を構える与平(芦田昌太郎)と妻・おとき(柊瑠美)は、おときの父・松造(渡辺哲)のことで悩んでいた。かつて火消しとして活躍した父だが、家を出たまま帰れなくなることが増えていた。ある日、松造が誘拐され、夫婦は表店へ移るための大事な資金と、父の命との選択を迫られる。

抜け荷を単独捜査していた左門(嶋田久作)が、短筒で撃たれ重傷を負う。左門は懐に南蛮渡りの花を持っていた。忠相(高橋克典)は、左門が最近出入りしていた料理茶屋にたどり着くが、美人女将のお葉(野波麻帆)はしらを切る。左門が書き置いた文から、お葉を愛人として囲っている松葉屋(成瀬正孝)の犯罪が浮かび上がり、松葉屋に捜査が及ぶ頃、お葉は謎の船頭・伊助(中本賢)と共に姿を消し、伊豆下田へ向かっていた。