三国屋徳右衛門（竜雷太）が老中・甘利（松本幸四郎）の命で甲州の立て直しのため旅立つ中、その留守を預かる為、卯之吉（中村隼人）の叔母・おカネ（若村麻由美）がやってくる。おカネの一番の仕事は、美鈴（新川優愛）を卯之吉の嫁候補として見極めることであった。その頃、江戸では頻繁に大火事が起こる。一方、卯之吉は、濱島（古川雄輝）と出会い「火除け地」の構想に意気投合するが、火事が悪党による火付けと気づく…。

八巻家では、美鈴（新川優愛）がおカネ（若村麻由美）に家事でしごかれ自信を無くしていた。そんな時、大奥の秋月ノ局（前田美波里）から頼母子講の運営を任されていた講元（運営者）が世直し衆に襲われ殺害される。全ては尾張家老・坂田（新藤栄作）の陰謀。秋月ノ局から内々に相談された老中・甘利（松本幸四郎）は内密に捜査を進めるが、逆に秋月ノ局の怒りを買いピンチに立つ。甘利を助けるため卯之吉（中村隼人）たちが動く。

荒海一家の厄介になりたいと訳ありの子供・昇太郎（三上来輝）がやって来る。三右衛門（渡辺いっけい）は昇太郎の様子を見て、ヤクザの盃は交わさず見習いとして受け入れる。江戸の街では世直し衆が夜な夜な押し込み強盗として暴れていた。その中に、猪五郎（比留間由哲）というやくざ者が居た。猪五郎は昇太郎の親の仇でもあった。そんな中、卯之吉（中村隼人）の前に三右衛門の元親分・権平（花王おさむ）が現れる。

江戸が長雨の影響で不景気が長引く中、尾張藩家老・坂田（新藤栄作）は将軍に景気対策の目玉として「日光社参」を勧めつつ、濱島（古川雄輝）たち世直し衆に接近する。一方、おカネ（若村麻由美）のシゴキに悩む美鈴（新川優愛）は濱島の過去を知り同情。そんな中、世直し衆の大越（青山草太）は、三国屋の用心棒・水谷（村田雄浩）が仇討の相手と勘違い。死を覚悟する水谷を止めるため、卯之吉（中村隼人）たちが駆けつける…。

銀八（石井正則）の故郷・下総は、長雨による増水で利根川が決壊の危機に晒されていた。そんな中、下総でバケモノが暴れ堤が壊れたとの知らせが届く。老中・甘利（松本幸四郎）の命を受け、南町奉行所の沢田（小沢仁志）は壊れた堤を視察に、卯之吉（中村隼人）は、バケモノの正体を暴くため下総に向かう。現地には、下総の危機を聞き付けた濱島（古川雄輝）も来ていた。果たして、卯之吉たちは銀八の故郷を守ることができるのか。

濱島（古川雄輝）率いる「世直し衆」は夜な夜な暗躍していた。必死に捜査を続ける南の同心・村田（池内博之）たちは、世直し衆を何度も追い詰めるが、ここ一番の所で逃がしてしまい窮地に至る。一方、卯之吉（中村隼人）は、ひょんなことから病で苦しむお登勢（橋本マナミ）を助け、診察し投薬もしてやる。卯之吉のやさしさに励まされ、お登勢は気色を取り戻す。そんな中、南町奉行所に「世直し衆」の正体を告げる密書が届く。

卯之吉（中村隼人）は「世直し衆」の中に美鈴（新川優愛）が居たことを源之丞（石黒英雄）から知らされる。一方、尾張の家老・坂田（新藤栄作）は、尾張の商人・香住屋（山崎銀之丞）を使い江戸の商人から投資の金を集めていた。姿を消していた濱島（古川雄輝）が突然、卯之吉の前に現れ、美鈴が亡くなったと伝えるが、信じない卯之吉。卯之吉の仲間たちは必死に美鈴を探すが、江戸のはずれに悪党たちが集まっていると聞きつける。

尾張の家老・坂田（新藤栄作）は、濱島（古川雄輝）率いる世直し衆を陰で操り、香住屋（山崎銀之丞）を使い、江戸の商人たちに江戸ではなく尾張に投資させる企てを進めていた。そんな中、卯之吉（中村隼人）は、将軍を講元にする公金貸付を思いつき、江戸からの金の流出を食い止めようと画策。江戸中の商人たちの金を三国屋に集めて、江戸城の御金蔵に運び込もうとするが、そこに世直し衆と美鈴（新川優愛）の刃が襲いかかる。