ベザリウス家の次期当主・オズ＝ベザリウスは15歳の成人の儀を行なうため、“成人の儀の屋敷”に滞在していた。 従者のギルバートや妹のエイダとともに屋敷内を探検していたオズは、どこからか聴こえてきたオルゴールの音に導かれ、中庭の地下空間を発見する。 そこには墓標の様な石碑とオルゴールつきの古い懐中時計が置かれていた。 その懐中時計を手にした瞬間、オズの意識は奇怪な異空間へと飛ばされてしまう――

オズは成人の儀の開始前、叔父のオスカーにレインズワース女公爵の孫娘シャロンを紹介され、一目ぼれする。 そして参列者達が見守る中、成人の儀に臨むオズ。 “静寂の時計台”の前でオズが誓いの言葉を述べ、儀式が終わろうとしたまさにその時――百年前に動きを止めて以来、静寂を守っていた時計台の針が突然動き出した。 鳴り響く鐘に騒然とする参列者達。そこに突如として何者かが侵入し――!?

成人の儀の最中、突然襲来した謎の集団によって異空間アヴィスへと落とされたオズ。 異様な光景に戸惑いつつも、出口を探して彷徨うオズに、奇怪な人形が次々と襲い掛かってくる。 巨大な人形に体を締め上げられ、オズは絶体絶命のピンチを迎える。 「ビーラビット」「アリス」「契約」「チェイン」様々な謎を抱えながらも、オズはこのピンチを脱出できるのか――。

アヴィスより帰還したオズが目を覚ますと、そこはレインズワース家の屋敷だった。 シャロンをはじめ、ブレイク、レイヴンといった面々に迎えられるオズ。 彼らは四大公爵家による組織、パンドラのメンバーで、オズは彼らに追われる立場だということを知る。 逮捕の危険を察知したアリスはオズの体を操り、シャロンを人質にとって逃亡を図るのだが――。

ブレイク達に協力することになったオズとアリスは、レイヴンとともにノーザンブリアの町へと向かう。 その町ではチェインによる殺人事件が多発していた。捜査を開始するレイヴン。 違法契約者でもある犯人は、特別なチェインであるアリスを取り込むことでさらに力を得られると考え、 アリスに襲いかかってきた。

アリスの記憶の手掛かりを求めて“成人の儀の屋敷”へとやってきたオズ達。 屋敷はオズがアヴィスにおとされた事件以降、パンドラによって管理されていた。 子供時代の思い出を思い起こしつつ、屋敷の中を捜索するオズとアリス。 一方、静寂の時計台の前ではレイヴンがパンドラの役人達に襲われ――。

成人の儀の屋敷で、オズから離れ孤独を感じていたアリスの前にうさぎのぬいぐるみが現れた。 うさぎのぬいぐるみはアリスを嘲笑い、翻弄して消えていく。 その後、自分の記憶の一部がこの屋敷に残されていることに気付くアリスだが――。

オズが目を覚ますと、そこは首都レベイユにあるギルバートの自宅だった。 オズはそこに訪ねてきたブレイクから、これまでの出来事についての疑問の答えを得る。 だがブレイクもアヴィスについて全てを知っている訳ではなかった。 ブレイクが去った直後、オズは突然胸の痛みに襲われ…。

ギルバートはオズの父親についての話をアリスに聞かせる。 オズには父親との間につらい過去があったのだ。 一方、オズは町で知り合った少年フィリップと意気投合するが、 そこにエコーと名乗る少女が現れてフィリップを連行しようとする。 逃げるフィリップを追うエコー、そしてそれを追うオズだったが――。

違法契約者がフィリップの父だと知り驚くオズ。 ビーラビットはチェインを攻撃するが、チェインのダメージが違法契約者に伝わると気付いたオズは、フィリップの父を守るためアリスの力を制御しようとする。 自分の過去と、フィリップの父への思いを重ね合わせ激昂するオズ。 そしてフィリップの父に対し説得を試みるのだが――。

ギルバートは自分がナイトレイ家の養子になった経緯をオズとアリスに語り出す。 オズがアヴィスに堕とされた後、ギルバートに養子の話を持ちかけたのはブレイクだった。 ナイトレイ家の養子ヴィンセントがギルバートをナイトレイ家に迎えたいと要請しているというのだ。 ベザリウス家を裏切る事は出来ない、と抵抗するギルバートだったが――。

ギルバートの帽子を探して町に出たオズ達はなぜか酒場の酔客と腕相撲をすることになる。 そこにオスカーが現れ、うろたえるギルバート。 その後、再会を喜ぶオズ、オスカー、ギルバートの幸せそうな様子に疎外感を感じたアリスはその場を逃げ出してしまう。 そして路地裏に潜んでいたブレイクと遭遇するが…。

オズ達は行方不明になったブレイクとアリスを探し出すため、シャロンのチェイン・エクエスの力を使って、チェシャ猫の住み処へと向かう。 そこにたどり着いた直後、チェシャ猫が襲いかかってきた。 シャロンの助けにより一時は逃げ切ることに成功するが、再び現れたチェシャ猫の襲撃により、オズとギルバートはぐれてしまう。 一方その頃、パンドラの本部では――

ギルバートとはぐれ、チェシャ猫から一人逃げ惑うオズ。 すると突然アリスの記憶の中に出てきた謎の男が現れ、オズは鏡の中の世界へと導かれる。 そこで再会を果たすオズとギルバート。男はオズに、アリスを見つけ助け出して欲しいと要請する。 早く発見しなければアリス自身がこの空間に取り込まれてしまうというのだ。

アリスの記憶で作られた空間へと転送されたオズ。 そこでオズは衝撃的な光景を目の当たりにする。 ショックを受けるオズに同調するかのように、ビーラビットの力が暴走を始めた。 鴉の力でも抑えられないほどの凄まじいビーラビットの力。 その力はやがて、オズ達のいるチェシャ猫の空間そのものを破壊し始める。

チェシャ猫の住み処から脱出したオズとアリス。 ２人が現れたのは、四大公爵が集うパンドラ本部の大広間だった。 不審者として追われ逃走する２人。 時を同じくしてブレイクも戻ってくるが、自分が不在の間シャロンが行方不明となっているという事実を知らされる。 早速捜索を開始するブレイクだが――

行方不明となったシャロンを救出するべく、シャロンの元へ急ぐブレイク。 大きな代償を強いられながらも、ブレイクはシャロンの救出に無事成功する。 そこでオズはシャロンとブレイクの普段は見られない一面を垣間見ることになる。 その後、一通の手紙を手にしたオスカーがオズの元に駆け込んできた。

ラトウィッジ校へと潜入したオズ達。 そこで耳にしたピアノ曲が懐中時計のオルゴール曲と同じだと気づいたオズは、演奏者を探して図書室へとたどり着く。 そこにはエリオットとリーオという２人の生徒がいた。 が、意見の食い違いからオズはエリオットと言い争いになってしまう。 そして図書室を出たオズの前にひとりの女生徒が現れ――。

バスカヴィルの民から逃れるため、校内の地下通路を逃走するオズ達。 そんな中、オズはエリオットに煽られ自分の心情を吐露しはじめる。 そこに再びバスカヴィルの民が迫ってきた。 エイダを守るため応戦するオズとエリオットだが、バスカヴィルのチェインに一蹴されてしまう。 絶対絶命のピンチに、オズはジャックの言葉を思い出し――。

レインズワース邸へと戻ってきたオズ達。 だが、オズ、ギルバート、アリスはラトウィッジ校での一件を引きずって浮かない表情のままだ。 ブレイクとシャロンはアリスの悩みを訊き出そうとするが、その内容にシャロンの乙女スイッチが作動、暴走気味のアドバイスが始まる。 そこにオスカーが加わり、その場はますます混迷の色合いを深めていくのだった……。

サブリエの悲劇に関してさらなる情報を求めるオズ達は、四大公の中で最も長く生きているというルーファス＝バルマの元を訪ねる。レイムに案内された部屋には丸々と太った奇怪な姿の紳士が待っていた。 その紳士、バルマ公は情報が欲しければ対価をよこせと要求する。 バルマ公が欲する情報はブレイクが持っていた。

ブレイクとバルマの証言によって次々と明らかになる真実。 ブレイクの過去、アリスとアヴィスの意志の関係、そしてヴィンセント…。 それらはオズ、アリス、ギルバートにも深く関わる内容だった。 バルマ公の狙いはブレイクを詰問し、その情報を引き出すこと。 そしてさらなる真実を求め、ブレイクを追及しようとするバルマ公だったが――

アリスの記憶の欠片を求め、違法契約者の取り締まりに精を出すオズ達。 だがアリスの記憶の欠片はなかなか見つからない。 ギルバートはヴィンセントから百年前の真実を聞き出せるのではないかと考え、ナイトレイ家を訪ねるがヴィンセントはギルバートの質問に答えようとはしなかった。 そんな中、首都レベイユには不穏な兆しが現れはじめていた。

突如としてレベイユに出現した大量のチェイン。 アリスによれば、アヴィスの意思の変調が影響しているのだという。 チェインを食い止めるため、出動するパンドラのメンバー。 レベイユに戻ったオズ達も人々の救出に奔走する。 そしてブレイクがマッドハッターを解放し、街からチェインが一掃されたかに見えたのだが――

レインズワース家に滞在しているオズ達の元をオスカーが訪ねて来た。オズにベザリウス家に戻って欲しいというのだ。父親のことを気にするオズだが、オスカーはオズの父は十年前のあの日以来、行方不明になっているとオズに打ち明ける。ベザリウス家に帰ってきたオズは、壁にかけられたチェインの絵に見覚えがあることに気づく。