ただの人間には興味ありません!「この中に宇宙人、未来人、超能力者がいたら、あたしのところに来なさい。以上!」入学早々、時を止めるような挨拶をした涼宮ハルヒ。そんなSF小説じゃあるまいし…と、誰でもそう思う…。しかしハルヒは心の底から真剣だった。それに気づいたキョンをとりまく日常は、もうすでに超常になっていた…。涼宮ハルヒが団長の学校未公式団体「SOS団」が繰り広げるSF風味の学園ストーリー。
第1期は、原作第1巻『涼宮ハルヒの憂鬱』をベースに、第3巻『涼宮ハルヒの退屈』・第5巻『涼宮ハルヒの暴走』・第6巻『涼宮ハルヒの動揺』の一部エピソードと、原作者谷川流が新規に書き下ろしたオリジナル・ストーリーである『サムデイ イン ザ レイン』を加えた全14話。
2003年6月6日
1巻 涼宮ハルヒの憂鬱
2003年9月30日
2巻 涼宮ハルヒの溜息
2003年12月27日
3巻 涼宮ハルヒの退屈（短編集）
2004年7月31日
4巻 涼宮ハルヒの消失
2004年10月1日
5巻 涼宮ハルヒの暴走（短編集）
2005年3月31日
6巻 涼宮ハルヒの動揺（短編集）
2005年8月31日
7巻 涼宮ハルヒの陰謀
2006年5月1日
8巻 涼宮ハルヒの憤慨（短編集）
2007年4月1日
9巻 涼宮ハルヒの分裂
2011年6月15日
10巻 涼宮ハルヒの驚愕（前）
2011年6月15日
11巻 涼宮ハルヒの驚愕（後）
2020年11月25日
12巻 涼宮ハルヒの直観
