ハリケーンがマイアミに襲いかかろうとするなか、マグワイア病院のERにも、同じく暗雲が立ち込める。院内では、ある重大な告発をめぐってレジデントたちの間に対立が生まれていた。

ハリケーンの勢力が拡大。ERには患者があふれ、ダニーは苦渋の選択を迫られる。一方トムは、仲を縮めつつあった人が負傷してしまい、何とかして彼女を助けようとする。

病院内の予備電力が残りわずかになっていくなか、ヴェロの安全を気にかけるクルス。ソフィーとカミラはその身を挺(てい)してでも、危険な状態にある患者を救おうとする。

ハリケーンの影響でERに患者があふれるなか、ひっきりなしに治療にあたりつつ、新しい上司ともうまくやれるよう苦労するダニー。その医師は、ザンダーの過去をよく知る人物だった。

ダニーが魅力的な警察官にアプローチされる一方、ハーパーは受け持った幼い患者の口うるさい両親に手を焼く。ソフィーは、医師としての在り方が問われる苦しい局面に立つ。

気難しい父の様子を見に実家に戻ったことがきっかけで、くすぶっていたダニーとハーパーの確執が再燃する。トムとソリアーノの休日は思わぬ展開を迎えることに。

来年度のチーフレジデント選出を控え、クルスからの厳しい視線にさらされるダニーとサム。カミラは、ある少女の症状にどうも引っかかる点があり、原因を突き止めようと手がかりを探す。

人事部からのヒアリングを控えたダニーとザンダーは、過去の辛い記憶と向き合うことに。ある緊急事態をきっかけに、心の定まらないトムの葛藤が浮き彫りになる。

クラブ火災の影響で患者が大勢運び込まれ、てんやわんやのER。ダニーのキャリアがどうなるのかが危ぶまれるなか、クルスは苦渋の決断を迫られ...。

前に勤めていた病院で本当は何が起きたのか、正直に打ち明けるザンダー。新年度が幕を開け、ERには新たなチーフが誕生。それとともに新たな試練も押し寄せて来る。