あいかわらず組織は盤石ではなく、今回は、CIAに吸収合併され、イーサン・ハントは、単独行動を強いられてしまう。いつものように孤立無援なわけである。その窮地をなんとか仲間とともに、脱していくのだ。もっとも、仲間もいるし、CIAが攻撃してくることもないので、四面楚歌というほどではないけど。ダニエル・クレイグ版007の方が、よほど孤立している。
簡単にあらすじ。
ミッション終了のイーサン、連絡場所のショップへ。いきなり閉じ込められ、同僚を目の前で殺される。さらに、どこかへ拉致される。
敵は、シンジケートという組織らしい。イーサンは、拷問される寸前に、なぜか、敵側にいた女性が助けてくれる。
シンジケートの動きを掴んだイーサンは、ウィーンに到着。あるオペラの会場へ。そこにはオーストリアの首相が来ていた。
シンジケートの目的はオーストリア首相の暗殺だが、結局、防げなかった。ただ、またも、例の女が現れた。
そのとき、その女が、シンジケートに潜入している、イギリスの諜報部員、イルサだと知る。
シンジケートの資金源の暗証番号のデータがデジタル金庫にあるらしい。イーサンとイルサは、合流し、デジタル金庫のあるモロッコへ。
デジタル金庫からデータを盗み出すが、土壇場で、イルサがデータを持ち逃げする。
イルサはロンドンへ。イギリス諜報部のアトリーにデータを引き渡そうとするが、本物かどうかわからんので受け取れない、シンジケートに戻れといわれてしまう。
実は、ベンジーがデータのコピーを取っていたのだ。ところが、データは、イギリス首相にしか開けないようになっていた。
といっているうちに、ベンジーが捕まってしまう。
仕方なく、イーサンは、イギリス首相のもとへ。イギリス首相を眠らせて、データを開く。
イーサンは、ベンジーの身柄との交換場所へ。そこには、イルサもいた。イーサンは、データは全部自分が記憶している。だから、自分を殺せば、データは消滅するよ、と言ってシンジケート側を慌てさせる。
シンジケートのレーンは、イーサンを追っかけているうちに、捕まってしまい警察行き。
