新嘗祭にて「穀物騒動」を起こし一躍人気者となったラブライス。 テレビに田植えに大忙しの彼らであったが、リーダーのひのひかりは何やら様子がおかしい… そんな中、穀立稲穂学園に穀物留学生がやってきた。 彼はラーメンのハーベスター「ショウ」。 新たなライバルの登場に動揺を隠せないラブライス一同。穀物の平和はどうなるのか？

突然教室で倒れてしまったひのひかりをを心配するラブライスメンバーたち。 すると保健室の扉が開き、 稲穂学園の新米ハーベスター「おいでまい」によるハーベストショーが始まった。 熱心なラブライスのファンであるという彼は物語にどう絡むのか… そんな中パンのハーベスターユニット「イーストキング」と共に食事に出かけたラブライス 「パンにしますか？ライスにしますか？」 その何気ない会話を窓の外から睨みつけるショウの姿が……

もりのくまさんとコロ姐の結婚式。 おなじみのメンバーが会場に集まる中、ひのひかりの姿はそこには無かった。 陸稲学科のメンバーによるビデオコメントやこしひかりの ハーベストショーなどで二人の門出を祝い、大いに盛り上がっていた。 そんな祝福ムードに溢れた式の最中、もりのくまさんに一本の電話が……

電話を受け駆けつけた一同が目にしたのは、真っ黒に焦げているひのひかりの姿。 どうやら無理をしすぎて病気にかかってしまったようだ。人気のハーベスターとして 忙しく活動している彼らには次のイベントへの出演が迫っていたため この状況では出演することは絶望的と思われたが……

おにサマ当日。病気のため参加できないひのひかりの代わりに「新生ラブライス」として 出演することとなったおいでまいは無事にハーベストショーを終え、一安心していた。 すると突如空が暗くなり、巨大などんぶりに乗ったショウが現れた。 騒然とする会場内で、ショウによるショー、「麺デペンデンスデイ」が始まる…

おにサマでのショウによる「麺デペンデンスデイ」以降、ラーメン人気が加速した稲穂学園。 ひのひかりが姿を消してから二週間が経ち、心配を募らせる新生ラブライス一同。 そんな彼らの前にショウとこしひかりが姿を現す。 新生ラブライスとショウはこしひかりの提案で ここで決着をつけるための「ウエル」をすることとなったのだが……

ウエルの勝利とひのひかり復活に祝賀ムードのラブライス。 そこへ悩みをかかえているこしひかりがやってくる。なんと！ こしひかりの計らいにより、ささにしき主演で映画をつくることに！？ ノリノリなひのひかり・ひとめぼれ・あきたこまち・にこまるに 対してして様子のおかしいささにしき。無事に撮影を終えることができるのか？

ある日、学校に行く支度をしていたにこまるのもとにやってきたのは、 迷子の赤ちゃん「リンクス小林」を抱いたあきたこまち。 通学途中に炊飯器に入っているところを見つけたのだという。 「捨て米」であるその子を協力して面倒をみることにしたあきたこまちとにこまる。 悪戦苦闘しながらも一生懸命世話をする中で、二人が見つけたものは……

とある夜、夜空を流れてくる光り輝く彗星を見上げているちんこ坊主とまなむすめ。 お互い眠りにつき朝起きてみると２人の体が入れ替わっていた？ その状態でまなむすめは幼稚園に行き、ちんこ坊主はステージにあがることに・・・ 普段の私生活がまったく異なる２人はどのようにこの危機を乗り越えていくのか？

聖パンハイスクールと稲穂学園から次々と人が消えていき、 おいでまいやリンクス小林までも連絡が取れなくなってしまう。 心配しているラブライスの元へ現れたのは様子のおかしいショウであった。 突然襲いかかってくるショウに窮地に追い込まれるラブライスのもとへ現れたのは……？

目の前に現れた二人のショウの姿に困惑するラブライスとケーキング。 しかしその片方の正体は「炭水化物抜き」を進める「ノンカーボ」であった。 穀物同士を争いに導き、やがて消し去ることを目的としている彼の攻撃は、 次々と穀物たちをその手から発するビームによって消し去っていく。 やがてその攻撃の矛先はラブライスたちに向き……

ひのひかりの連作障害やおいでまいの失踪はショウではなく 全てノンカーボが原因であった。 こしひかりを消すほどの圧倒的な力を持つノンカーボに対して ラブライスは大ライスシャワーで応戦するが…… はたしてノンカーボに勝つことができるのか？ 米・パン・麺の平和を守る戦いがここに完結する！