貴族の守護者ライジェル、彼の忠実な執事であるフランケンシュタイン、ユニオンの実験体だったM-21は、正体を隠したまま私立芸欄（イェラン）高校で日常を過ごしている。平穏な日常を送っていたが、ある日、高校に過激な集団が乗り込んできて…！ 生徒達を守るため、M-21は選択を迫られる。 そして、その頃謎の戦闘部隊 DA-5 が、調査の任務を帯びて日本へ派遣され…。 果たして彼らの平和な日常はどうなってしまうのか？

日本で起きた一連の事件を調査するため、貴族のレジスとセーラが芸欄（イェラン）高校にやってくる。ライジェルとフランケンシュタインは正体を隠しながら二人と接するが、レジスとセーラはM-21が改造人間であることに気づき、警戒する。一方、下校中に田代がまた不良とのケンカに巻き込まれ…。

いつの間にか平凡な日常に溶け込んでいたM-21。ことあるごとに対立していたレジスとの間にも少しずつ信頼感が生まれる。加瀬はセキュリティシステムをハッキングしようとしていたタオと、思いがけずハッキング対決を繰り広げることになる。一方、ユニオンの特務部隊DA-5は、ついにM-21の居場所を突き止める…

ユニオンの特務部隊DA-5に捕まってしまったM-21。しかし、逆にこのチャンスを利用して昔の仲間たちに関する情報を探ろうと試みる。自分の思い通りにことが運ばないシャークは、M-21に替わる、他のターゲットを探し始めるが…。そんな中、田代とセーラは道端で困っていたタキオと偶然出くわし、加瀬はハッキング対決をしたタオと予想外にも意気投合する。

レジスの身が危ないと気付いたセーラが助けに飛び出す。ライジェルとフランケンシュタインも、田代と加瀬まで危険な目に遭っているかもしれないと思い、セーラの後を追う。M-21は自分を犠牲にして一行を救おうと画策し、レジスも共に立ち向かう。DA-5との戦いが始まった！しかし敵はユニオンの最精鋭特務部隊、そう簡単に倒せる相手ではなく…。

フランケンシュタインとタキオ、セーラとハマーの戦いは激しさを増していく。田代と加瀬を巻き込みたくないタオとタキオは葛藤するが、リーダーであるクランスは勝つために、とてつもなく残酷なプランを実行する…!そんな中、M-21達の元に辿り着いたライジェルは、クランスを圧倒的な力で迎え撃つ。

平和な日常に戻ったライジェル達。田代はセーラに惹かれていることに気付いて、想いを伝える方法を周りに相談する。そんな中、正体を知られたライジェルはある決断をしなければならず..。

レジスの祖父ゲシュテルは貴族のロードの命令により日本へ。そこで思わぬ人物と再会する。ゲシュテル、フランケンシュタイン、ライジェル、3人の関係性は一体？ついにフランケンシュタインとライジェルの過去が明かされる！

ライジェルとフランケンシュタインが初めて出会った貴族の地、ルケドニア。ライジェルは他の貴族からフランケンシュタインを守るために自分の執事として屋敷に住まわせる。しかしその行為を、いくらNOBLESSEの判断とはいえ、許せない貴族たちがいた。貴族の味方をするか、フランケンシュタインの味方をするか、ライジェルは選択を迫られる・・・！

セーラを迎えに芸欄(イェラン)高校に現れたラエルは、M-21、タオ、タキオ一行を襲撃する。 さらに、誘いをセーラに断られ、逆上したラエルは、フランケンシュタインにまで戦いを挑む。 仲間を守るため、ライジェルを守るため、フランケンシュタインは、これ以上黙って見ているわけにはいかなくなる。

ロードであるラスクレアからの召喚を受け、セーラは一人故郷ルケドニアへ向かった。 ラスクレアはライジェルを守るための虚偽の報告を見抜き、セーラとゲシュテルを厳罰に処することにする。 一方、セーラとゲシュテルを救うために、ルケドニアの地に降り立ったライジェル、フランケンシュタイン、レジス。 貴族の地・ルケドニアで大波乱の幕が上がる！

聖地に向かうライジェルたちの前に、強敵が立ち塞がる。 一方、投獄されていたセーラはゲシュテルの強制永眠を防ぐために脱獄を図る。 ライジェルたちはセーラとゲシュテルを守るため、それぞれの想いを秘め激しい戦いが繰り広げられる。 セーラとゲシュテルを救うことができるのか・・・？

ゲシュテルの強制永眠を防ぎ、事態を収めるために、ラスクレアと家主たちの前に姿を現わすライジェル。家主たちは彼の驚異的な力に圧倒される。遂に明かされる先代ロードが永眠についた本当の理由・・・。 ロードとNOBLESSEの戦いが幕を開ける！