一人暮らしの大学生・川越はるまは、クリスマスの朝、いきなりサンタのオネーサンからプレゼントを渡される。寝ぼけまなこで状況が掴めないまま受け取ったはるまだが、プレゼントの中身はなんと一人の少女だった！？

年が明け、初のお正月を迎えるちょこは、人間社会のことをほとんど知らない。初めてのお正月なのに・・・とつまらなそうにしているちょこを見て、かわいそうかなと思ったはるまは、ちょこと一緒に初詣に行くことに。

通学途中、はるまは駅でコンタクトを落として困っている女性に出くわす。その女性ははるまとちょこが住んでいる“つばき荘”の新しい管理人だった。管理人の千歳は、やっとの思いでつばき荘へ辿り着くのだが・・・

千歳は好意を抱いているはるまに肉じゃがを作って渡そうとするが、何と言って渡したら良いか試行錯誤する。バレンタインデー当日、千歳は買い物途中に、はるまにチョコを買おうとするが、そこに偶然ちょこが現れる。

千歳が洗濯物をたたんでいるところに現れたちょこはブラジャーを見るのが初めてで、つけてるところが見たいと言う。ちょっとだけとつけてみせる千歳。それを見たちょこははるまにブラジャーを買ってとおねだりする。

ちょこは公園で兄弟が木にひっかけたバトミントンの羽を取ってあげるが、降りる時に足をかけた枝が折れてぶら下がってしまう。公園に通りかかった駆が木の上を見て不思議に思っていると、上からちょこが降ってくる。

はるまと一緒に出かけようとしたが、連れて行けないと断られ、ふくれっ面をするちょこ。はるまはフラワーショップの綾乃と映画を観に行く約束をしていた。一方、千歳は街中ではるまらしき人影を見かけるが･･･。

はるまたちがいた居酒屋に、綾乃が偶然入ってくる。知人と気付いた珠美が綾乃を誘い、一緒に飲むことに。待っているちょこのため、綾乃と一緒に帰ろうとしたはるまだが、綾乃からもう一軒付き合ってと頼まれ･･･

朝出かけるとき綾乃のフラワーショップの前を気まずそうに通るはるま。その様子をつばき荘の窓から見ていたちょこが、お兄ちゃんとお花屋さんの間に何かあったのか千歳に尋ねる。分からないフリをする千歳だが･･･

商店街の福引で、ちょこは一等の家族温泉旅行を当てる。家族4人で温泉に行けるということで、お兄ちゃんに加え千歳も一緒に行こうと誘うちょこ。そこにちょうどよく現れた真琴も参加し、みんなで温泉に行くことに。

朝から温泉でホコホコ顔のはるまとちょこ。一方、妄想しながら朝寝坊の千歳。はるまたちは山を登って、楽しくハイキングするが、茶屋で休んでいたはるまの横で、立ち入り禁止の札の向こうに白い人影が通り過ぎる。

夜、ちょこが絵日記を描いていると、電話がかかってきてコンビニへ出ていくはるま。翌朝、はるまは朝食を残し、ちょこの話も上の空で出て行ってしまう。はるまの様子が変だと気付いたちょこは、千歳や真琴に尋ねる。

梅雨も明け季節は夏。運転手付きの高級車に乗ったお嬢様・華山田ゆりかは公園のトイレの窓から抜け出そうとして、ちょこに出くわす。ちょこは言われるがまま、ゆりかを助け出すが、その後ゆりかはどこかへ・・・。

アイドルの子が子供たちと一緒に踊るテレビ番組に釘付けのちょこだが、はるまは「ねこにゃんダンス」を知らない様子。ちょこが買い物に行こうと幼稚園の前を通ると、「ねこにゃんダンス」の音楽が聞こえてきて・・・

夏の暑い日。はるまは珠美からの電話で、プールの監視員のバイトを頼まれる。いざプール当日。プールサイドで走ってきた少年とぶつかり、よろけて倒れる千歳。ちょこは少年を呼び止め、謝らせようとするが・・・。

今日はお祭りの日。千歳とちょことはるまの3人でお祭りへ。ちょこは初めてのお祭りにおおはしゃぎ。金魚すくいをしたり、たこ焼きを食べたりと、歩き回っているうちに、人込みの中ではるまと千歳とはぐれてしまう。

お祭りの日の駆とちょこを見て以来、ゆりかは夢にまで見るほど気がかりな様子で、どことなく上の空。転校生の親睦を深めるパーティーに誘われたゆりかは、それをヒントに駆をティーパーティーに誘う計画を練る。

ねこにゃんダンスが踊れるようになったので、ビデオに録って番組に応募したいと張り切ってねこにゃんダンスを踊るちょこだが、撮影も終了し応募しようとしたところ、5名以上の団体でないと応募ができず・・・

巷で大人気のねこにゃんダンスを踊るオダエリが出演している番組にちょこは釘付け。だが絵里子は街中で騒がれるのが少し憂鬱な様子。翌朝、ねこにゃんダンスの中継を行うはずが、絵里子がいなくなってしまい・・・

テレビに映っている可愛らしい子猫を見て、ちょこはペットを飼いたいと言うが、はるまはアパートがペット禁止のため無理だと言う。街でも人のペットが気になって仕方がないちょこは、野良猫を見つけ追いかけていく。

悲しいことがあって、落ち込んで元気のないちょこを、駆とゆりかは一生懸命励まそうとする。なんとかしてやりたいと思うはるまに、千歳が気晴らしに遊園地に誘ってくれたおかげで、みんなで遊園地へ行くことに。

はるまと学食でお昼を食べているちょこ。そこへ珠美が現れ今度の学祭の出し物でメイド喫茶をやるという。メイド喫茶がお店屋さんごっこみたいなものと聞いたちょこは興味を示し、メイド喫茶のお手伝いをすることに。

神様、ボクに妹をください──。それは子供の頃の幼い願い。大きくなるにつれ忘れていった、本当にかなうはずのない儚い願い。かわりばえしない日々にまぎれて、思い出すこともない昔の願い。過去の夢なんだろうか。

ね、知ってる？クリスマスって、サンタさんがプレゼントを持ってきてくれる日なんだよ！みんなに素敵なプレゼントが届きますように･･････。