6年3組、羽渡唯子のクラスにやってきた転校生・青柳立夏。必死に話しかける唯子だが、立夏は冷たい態度で心を開こうとしない。転校初日から孤立する立夏だが、最愛の兄・清明の知り合いだという青年・我妻草灯と出会い、心惹かれる。そんな立夏の前に「BREATHLESS」を名乗る愛とミドリが現れる。2人は「LOVELESS」の名を持つ立夏を迎えに来たというが――。

突然巻き込まれた、愛とミドリとの言葉(スペル)バトル。草灯は「BELOVED」の名を持つ、清明のかつての戦闘機だった。「立夏が好きだ」と何度も繰り返し、立夏を守る草灯。本心なのか、清明の命令だからなのか・・・立夏の心は乱される。そして草灯の助言に従い清明の遺言を探し出した立夏は、兄の死に『ななつの月』が関わっていることを知る。

心を開き始めた立夏をますます好きになる唯子。そんな唯子に想いを寄せる弥生は、体が弱く、学校を休んでいる間に唯子に急接近した立夏にライバル心を燃やす。しかし立夏の心を占めているのは、やはり草灯の存在だった。いつもつながっていられるようにと、立夏に携帯を渡す草灯。さらに、立夏にピアスの穴を開けて欲しいと頼みこんでくる。

立夏のためなら死んでもいい。しかし「ななつの月」に関することには絶対に答えられない――。近くて遠い草灯の言葉。つながらない携帯を胸に不安を募らせる立夏のもとへ、再び愛とミドリがやってくる。一方、複雑な問題を抱える立夏を気にかける担任の東雲瞳は、立夏の通知表を読み返すうちに、奇妙な変化に気付く――。

謎だらけの清明の死の真相。信じたいけれど、信じられない草灯の存在・・・。眠れぬ夜を過ごす立夏の前に、新たなサクリファイスと戦闘機がやってくる。「SLEEPLESS」の名を持つ、金華と銀華。2人は勝負の前に、謎の封筒を掲げる。そこには、立夏が本当に知りたいことが書いてあるというが…。

水曜日はカウンセリングの日。勝子は「友達」の話をする立夏の様子に微妙な変化を感じ取る。一方、青柳家へ家庭訪問に向かった瞳は、奈津生と瑤二という謎の少年たちと出会い、言葉(スペル)によって捕らわれてしまう。その姿を目撃した草灯は、戦闘機のみでの戦いを開始する！しかし痛覚を持たない「ゼロ」である奈津生と瑤二の攻撃は鋭い。痛みに耐えながら、草灯は律先生の言葉を思い出す…。

草灯の言葉(スペル)によって氷雪に閉ざされた公園。しかし「ゼロ」は痛みだけでなく、暑さや寒さも感じない…。ついに膝をついた草灯に、笑顔で近づく瑤二。その手には金槌と釘が握られていた！想像を絶する痛みを堪え、草灯は再度言葉(スペル)を放つ。そのとき、痛みを感じないはずの奈津生と瑤二の体に異変がおきる！立夏に会いたい――。戦闘に傷ついた体を引きずりながら、草灯は立夏のもとへと歩き出す。

渋谷の街ですれ違う2人の少女。ミミなし女子高生の倭と、ミミありで生真面目そうな江夜。一見接点のなさそうな2人の携帯にメールが届く。「いますぐ我妻草灯を潰してきて」送信者は渚先生。2人もまた渚先生によって作られた「ゼロ」だった。一方、草灯が謎の女子高生と立ち去ったことを知った立夏は、胸騒ぎを感じる。奈津生と瑤二との戦いで重症を負った草灯に、もう1人で戦わないと約束させたが……。

自慢の「ゼロ」が草灯との戦いに勝利し、ご満悦の渚先生。しかし倭の傷に気がつくと、足手まといなら新しいサクリファイスと交換する、と冷たく告げる。「ヤマトと別々になるなんて、耐えられない…！」渚先生の言葉は、倭本人以上に江夜の心を貫く――。一方、奈津生と瑤二の力を借り、何とか草灯を連れ帰った立夏は、戦闘機の無茶な戦いはサクリファイスの責任だと咎められる。戸惑う立夏だが、そのとき、新たな戦闘機の気配を感知する…！

江夜と倭との2：2の戦闘をひかえ、緊張を隠しきれない立夏のもとに、倭が一人でやってくる。喫茶店で倭と2人…。警戒する立夏だが、倭は気にする様子もなく話しかけ、さらに胸にある「0（ゼロ）」の文字を見せてあげる、と身を乗り出す！驚きのあまり立夏がこぼした熱いコーヒーが胸元にかかり、思わず声をあげる倭…。その反応に、立夏は違和感を覚える。

日曜日、横浜に「思い出作り」に出掛けた、立夏・唯子・弥生。保護者として瞳先生も一緒だ。にぎやかに遊園地をめざす4人の後を追う草灯…。さらにキオまで合流して、遠くから立夏たちの様子を見守ることに。しきりに携帯を気にする立夏の様子に、草灯は何故か満足げな笑みを浮かべていた。観覧車から見える、美しい青い海と空。「あいつにも見せてやりたい…。」立夏が観覧車から降りたつと、そこには草灯が立っていて――。

唯子に誘われ、弥生の家でゲームをしていた立夏は、不思議なメモに気がつく。それは金華・銀華から手に入れた暗号に酷似していた。謎のアルファベットと数字が示すものは、ネットゲームの待ち合わせ場所と時間…。草灯と連絡がとれないまま、立夏は1人でゲームを開始する。待ち合わせの場所に訪れると、そこには「女神」が待っていた。ゲームに集中していた立夏は、突然強い眠気に襲われる。深い眠りに落ちた立夏の頬をやさしく撫でる手。その手に誘われるように、立夏が見た光景は……。