「まさに神でした……」うっとり陶酔し、クライとの出会いを語るティノ。かつてハンターになる前の少女時代、帝都に来て間もない頃の《嘆きの亡霊（ストレンジ・グリーフ）》に助けられた思い出話。当時の事はまったく記憶にないクライだったが、あちこち話して回るティノに同行する中で、次第に何があったのか思い出していき……。これはストグリ、そしてクライに対するティノ・シェイドの憧憬。その始まりの物語である。

先日のオークションでクライと宝具を巡り争ったグラディス家から、クライへの指名依頼が届く。全くやる気のないクライだが探索者協会のノルマを達成しないと強制的に除名になるため、依頼を受けざるを得なくなる。更には《魔杖（ヒドゥン・カース）》からの打診、《霧の雷竜（フォーリン・ミスト）》からの因縁、そして『白剣の集い』への招待……。次々と舞い込むあらゆる面倒事から逃げる為、クライはバカンスへと向かうのだった。

楽しいバカンスのため温泉を目指して進むクライたち一行。道中を平穏に過ごしたいクライは、リィズにしごかれるティノを見かね「訓練禁止」を言い渡す。バカンス中は戦闘を一切しないこと。そう決めたクライに従うリィズ達は、ゆく先々で起こる大事件をスルーしていく。街を襲う雷精、街道に出現するオークの大群に火精――クライ達に端を発するその全ての厄災は、後を追いかけるアーノルド達に降りかかるのであった。

追ってくるアーノルド達から逃れるため、魔物がはびこるガレスト山脈を突っ切るクライ達。そんな危険地帯で遭遇したのは、残忍な魔物『迷い巨鬼（ポテ・ドラゴス）』。早々に撤退を決めたクライは、ポテ・ドラゴスの執拗な追跡から何とか逃げきることに成功する。到着した湖のほとりで骨休めのキャンプを楽しんでいたクライ達だったが、そこへ現れたのは怒り狂ったアーノルド！　しかし、いつもと様子が違っていて……？

念願の温泉街に到着したクライ達。温泉を堪能するクライが遭遇したのは、のんびりと湯に浸かっているドラゴンだった！　一方、【万魔の城（ナイトパレス）】を命からがら脱出してきたアーノルド達も街に到着。《千変万化》の実力を身をもって知った彼らはクライと和解を果たすも、アーノルドは何やら一人で思い悩んでいる様子……。その頃、街では不穏な影がちらつき始めており、クライは謎の亜人に連れ去られてしまう。

バレル盗賊団によって街は制圧され、リィズ達は捕まってしまった。いまだ姿を見せないクライをあぶり出すため人質に手をかけようとするバレル一味。だが突然、地底人（アンダーマン）の襲撃を受ける。無数のアンダーマン達を率いていたのは、なんとクライ！さらにドラゴンまで現れて場は混沌と化す。次々と起こる予測不能の事態に戸惑うバレル盗賊団。そんな彼らの前に現れる笑う骸骨の仮面を被った3人組――。

バカンスを謳歌し、3週間ぶりに帝都へ帰還したクライ。終わっていたはずの『白剣の集い』は帝都で起こった抗争のため延期されていた。渋々参加するクライの目の前で、狐面の暗殺者によって皇帝が狙われるという事件が発生。皇帝暗殺を目論むのは巨大犯罪組織『九尾の影狐（ナインテイル・シャドウフォックス）』。組織の全貌も全てが謎に包まれた敵から皇帝を守るため、クライに護衛依頼が打診される。

宝具に目がくらみ引き受けた皇帝の護衛依頼。仕方なくメンバー集めに動くクライは、相変わらずノリと勢いで決めていく。テルム、ケチャチャッカ、クリュス、キルナイト・バージョンアルファ、そしてクライ。ここにドリームチームが結成された！　厳戒態勢の中、外遊へと向かう皇帝一行。クリュスと近衛団長フランツに怒られながらも緊張感皆無で護衛に参加するクライ。そうして何事もなく初日を終えたかに思えたが……。

皇帝の一行に紛れ込んでいた『九尾の影狐』の構成員によるドラゴンの襲撃。駆けつけたアンセム、そしてテルムの活躍によって事なきを得るも、度重なる襲撃に内通者がいると判断した皇帝は、クライを自身のそばで護衛させることに。一方、クライに不信感を抱いていたテルムはとある結論に達した。クライが『狐』の構成員であると……。狐を巡る勘違い。そのことがクライ、テルム、ケチャにとって思いもよらぬ事態を招く。

いよいよ旅は終盤へ。空路で目的地に向かうと聞き、準備のために旅程の延期を申し出るクライ。その動向を逐一うかがっていたストグリのメンバーも、クライのサポートに奔走する。ようやくすべての準備が整い満を持して飛行船に乗り込むクライだったが、次第に雲行きが怪しくなっていき……。そんな中、突如として皇帝の命が狙われる事態に。暗躍していた『九尾の影狐』が本性を現す。

『九尾の影狐』の襲撃から無事に皇帝を守ったクライだったが、さらなる災難が降りかかる。なんと飛行船ごとレベル１０の宝物殿【迷い宿】に入り込んでしまったのだ。狐のファントムとの生死をかけたやり取り。それを切り抜けたクライは、全員無事に解放してもらうため宝物殿のボスである母狐に会いに行くことに。相手は人間をはるかに超越する神。そんな母狐を前に、クライがとった行動とは――。