学園の入学試験を受けるため、セシルや再会したクレナ、ドゴラと共にラターシュ王国学園都市へやって来たアレン。4人は入学試験に先立ち、「鑑定の儀」を受けることに。以前は才能無しと鑑定されたアレン。果たして今回は……。鑑定後、アレンたちの前に「勇者」ヘルミオスが現れる。彼はアレンの能力に興味津々な様子で！？

担任から夏休みの課題はダンジョン攻略だと予告された新入生たち。課題に備え、アレンは新たなパーティーメンバーを募集。その結果「僧侶」の才能を持つキールが仲間に加わる。しかし、キールは何やら訳ありな様子で！？後日、特別授業の講師として「剣聖」の才能を持つドベルグが学園にやって来る。授業中、クレナがドベルグにスキルの使い方を質問すると……。

キールが正式に仲間に加わったパーティー「廃ゲーマー」は、B級ダンジョンの攻略へ乗り出す。出現する魔獣たちを順調に討伐しながらダンジョン最下層を目指す一同。2か月後、ついに……。それから迎えた夏休み。キールが王家の使いと交わした約束について、グランヴェル卿に報告をするアレン。会話の最中、2人は約束の裏に潜んだとある謀り事に気が付く。

ダンジョンの罠で転移したドゴラとセシルを発見したアレンたち。合流を果たし、危機的状況を乗り越えた一同はダンジョンの最下層に到達。そこで A 級ダンジョン初攻略をかけて、ボス魔獣と戦闘を開始する。それから夏休み明け、学長に呼び出されたアレンとクレナ。2 人は 1 週間後に開催が迫った学園武術大会への参加を提案される。

2年生に進級したアレンたち。進級と同時にクラスにはエルフの国「ローゼンへイム」の王女・ソフィアローネ（ソフィー）、彼女の護衛・フォルマール、そしてドワーフのメルルが転入してくる。「廃ゲーマー」に加入した３人はレベルアップをするべく、アレンたちとＢ級ダンジョンに挑戦することになる。そしてあっという間に月日が流れ夏休み前。アレンとクレナは再び学長に呼び出されて……。

学園武術大会最後の試合として、アレンとヘルミオスの試合が開始。試合序盤、圧倒的な速さと重さを誇るヘルミオスの剣技の前にアレンは防戦を強いられる。しかし、新たに手に入れた B ランク召喚獣を召喚すると反撃を開始し、徐々に押し返していく。そんな彼に手加減無しの一撃を放つヘルミオス。一方、アレンは対勇者用のとっておきの秘策を用意していた。

大陸間の協力関係を崩すため、侵攻を開始した魔王軍。そのことに気が付いたアレンたちは、敵の目論見を断つための要となるローゼンヘイムへ向かう。避難所となっている町・ネストを訪れた一同は負傷者や避難民たちの救護と情報収集を開始。するとソフィーの母親にしてローゼンヘイムの女王が魔王軍との戦闘の最前線・ティアモにいることが判明して！？