マイメロディちゃんはかわいいウサギの女の子。平和な“マリーランド”で楽しく暮らしていたのだけれど、不良のクロミちゃんとバクくんの逃げる手伝いをした、と間違えられて、人間の世界へ行くことになってしまった。一方、人間の世界“夢が丘市”では、普通の中学生の女の子、夢野歌ちゃんがバイオリンを上手く弾きたい！と夢見ていた。そんな歌ちゃんの前に、現れたクロミちゃんは「その夢をかなえてあげる！」と言うのだけれど・・・ 歌ちゃんの夢は一体どうなる？ そして、マイメロちゃんはどうするの！？

歌ちゃんの憧れの人、柊先輩は天才バイオリニスト。今度は、この柊先輩に狙いをつけたクロミちゃん達だったが、メロディ・ボゥを使いこなす先輩に圧倒されてしまう。一方、夢野家にやってきたマイメロディちゃんは、人間の世界にやってきたいきさつを説明するのだが、その様子があまりにものんびりしているので、歌ちゃんは心配になってしまった。そして、みんなで「このコを助けてあげよう！」と、決めるのだった。

歌ちゃんのクラスメイトの山本くんは、ちょっぴり内気な男の子。だけど、写真の撮影が上手なことで有名だ。ホームページ制作の授業で、同じ班になった歌ちゃんは、山本くんに、憧れの柊先輩の写真を撮ってくれるように頼んだ。撮影に快く応じてくれる先輩だったけれど、山本くんのオドオドした態度を見て・・・

歌ちゃんの家のお隣には、ちょっと変わった人が住んでいる。お隣の飛田さんは、掃除をするのが大嫌いで、たくさんのゴミに囲まれて暮らすのが大好きなのだ。クロミちゃんは、この飛田さんに目をつけた。マイメロディちゃんをライバル視しているクロミちゃんは、飛田さんに魔法をかけて、マイメロディちゃんに迷惑をかけようとするのだが・・・

サッカー部の練習を見学した歌ちゃんたちは、そこで、キャプテンの内田先輩とマネージャーの高橋さんと知り合った。内田先輩は注目の選手なのだ。おまけに、高橋さんとはなんだかいい感じ？ サッカーを見たことがないマイメロディちゃんは、試合を見ることを楽しみにしていたのだが、対戦校が次々と棄権してしまい・・・

ある日、マリーランドからフラットくんがやってきた。マイメロディちゃんのことを心配するフラットくんは、クロミちゃんをつかまえに出かけよう！と提案した。しぶしぶつきあう歌ちゃんとマイメロディちゃんの前に、バイクに乗った老人が現れた。彼の名前は土方ジョージ。若い頃に渡せなかったラブレターを、初恋の女性に渡すために、夢ヶ丘市に帰ってきたのだ。

歌ちゃんと美紀ちゃんは、柊先輩のことが大好き！美術の授業でも、柊先輩の似顔絵を描いて盛り上がっていた。いつも一緒の二人だけれど、その日は、美紀ちゃんだけが、柊先輩に声をかけられた。家においでよ、と誘われて有頂天になる美紀ちゃん。ところが、歌ちゃんの反応は・・・

真菜ちゃんは、子供の頃に、かわいいもの好きな従妹のハルミちゃんに振り回されたせいで、かわいいものが苦手になってしまった。そのハルミちゃんとおばさんが来ると聞いて、げんなりしていた真菜ちゃんの前に、かわいいマイメロディちゃんが現れた。近付こうとしない真菜ちゃんだったが、マイメロディちゃんは河に落ちて、風邪をひいてしまった・・・

琴ちゃんのクラスでは“おおなわとび”の全国大会を目指して、練習に励んでいる。だけど、クラスの秀才、中沢くんはひっかかってばかり。中沢くんを責める太田くんと、中沢くんをかばう琴ちゃんで、ケンカになってしまう。中沢くんは一生懸命がんばるのだけれど・・・

奏お姉ちゃんは、美人でオシャレな高校生。クラスメイトの菊池くんは、そんな奏ちゃんのことが気になって仕方がないみたい！？ そのくせに、ドキドキしすぎて上手く話しかけられない。そんなある日、アルバイト先の戦隊ショーで、ヒーロー役をゲット！ おもいきって、奏お姉ちゃんを誘うが・・・

マイメロディちゃんはお料理することが大好き！ 歌ちゃん達が学校に行っている間に、お料理だけでなく、お洗濯もお掃除もやってしまおうと大奮闘！ でも、マイメロディちゃんの小さな身体では何かと大変なことばかり。一方、夢野家のお隣に引っ越してきた“ミコたん”も、お料理のことで困っていた・・・

歌ちゃんのクラスメイト、白山くんはちょっと変わった男の子。というのも、魔法にかかった時以来、マイメロディちゃんのことが好きになってしまったのだ！ 歌ちゃんに相談して、マイメロディちゃんに会わせてもらおう！ と決意したのだが、その日、歌ちゃんは風邪でお休みだった・・・

ノラ猫に追われているところを、柊先輩に助けられたマイメロディちゃん。さらに、先輩はお家まで送りとどけてくれた。突然の来訪にびっくりしてしまった歌ちゃんだけれど、先輩に憶えてもらっていると知って大喜び！！ おまけに“美術館に行こう！”と誘われてしまった！！だけど、その美術館には実は・・・

小暮くんは陸上部で短距離走の選手を目指してがんばっている。でも、背の高い先輩たちには勝てなくて、いつも補欠選手。気にしていないふりをしているけれど、ほんとは、すごく悔しいのだ。ある日、歌ちゃんをからかっていたら、逆にそのことを指摘されて、うろたえてしまう。そんな小暮くんの前に現れたのは・・・？

お父さんの部屋をそうじしていた歌ちゃんとマイメロディちゃんは、ふとしたはずみで、お父さんのレコードプレイヤーを壊してしまった。電気屋さんでは直せないと言われて、骨董街のレコード屋さんを紹介された。ところが、そこの店長さんはとんでもない偏屈者で、追い出されそうになってしまう。そこに現れたのは、有名な二枚目俳優、松本ヨーイチだった。

柊先輩のメールアドレスをゲットした歌ちゃん。マイメロディちゃんのおかげで、なんとかメールを送ることができた。そのメールの効果で、先輩とまた美術館に行くことになった！！美紀ちゃんも誘って、おしゃれをして待っていたのだけれど、クロミちゃんが悪夢魔法をかけた人が実は・・・ 柊先輩のピンチ！？

マイメロディちゃんの家族はみんな仲良しでいつも笑顔！！ だけど最近、みんなちょっぴり淋しそう？ それは、マイメロディちゃんが人間の世界へ行ってしまい帰ってこないから・・・ それなら、みんなで会いに行こうか？ とおじいちゃんは提案した！! 一方、人間の世界で、歌ちゃんがお買い物をしていると・・・？

今日の琴ちゃんは朝からウキウキ！！ というのも、お父さんと海に行く約束していたから。水着と浮き輪の準備もカンペキ！！ ところが、お父さんに仕事の電話がかかってきてしまった。もう、海にはけないの？ 琴ちゃんは悲しくて怒ってしまう。そこで、何とかしようと頑張る お父さんだったが・・・！

夢野家のみんなは海にやってきた。奏お姉ちゃんの彼氏の菊池くんと、友達の小暮くんも一緒！！ マイメロディちゃんとフラットくんも、海で遊んで大喜び。さらに、荷物の中から、マリーランドに帰ったはずのおじいちゃんまで現れた！ 大はしゃぎするみんなだけれど、ぬいぐるみのフリをしなければいけなくて・・・

歌ちゃんたちは柊先輩の別荘に招待された。夢みたいな生活にウットリする歌ちゃん。さらに、この島には“流星を一緒に見た人とずっと一緒にいられる”という不思議な伝説があるらしい。その流星を一緒に見ようよ、と柊先輩に誘われてドキドキ！！ だけど、クロミちゃんの悪夢魔法が発動してしまった！！

クロミノートを読み返していたら、腹が立ってきたクロミちゃん。怒りにまかせて暴れていると、バクくんの秘密のノートを発見してしまった！そこにはバクくんの赤裸々なキモチの数々がつづられていた・・・秘密を見られたバクくんは傷ついて、クロミちゃんのもとから飛び出してしまった！

八百屋さんの権蔵さんと仲良くなったマイメロディちゃんは、はじめて一人でおつかいに行くことにした。いつものようにパラソルで飛んでいると、強い風が吹いて、落っこちてしまった。パラソルが壊れてしまい困っていると、同じく一人でおつかいをしている女の子“里佳ちゃん”に出会った・・・

今日は柊先輩のお屋敷でパーティーが開かれる。クロミちゃんは柊先輩と踊るつもりで、ウキウキとダンスの練習をしていた。ところが、背の高さが違いすぎて踊れないことに気付いてしまった！悲しみにくれていると、バクくんがメロディ・キーの秘密を教えてくれた・・・禁断の魔法を使えば、自分に魔法をかけて願いを叶えることができる！！

今日は学校で授業参観がある。歌ちゃんは、お父さんがいつも変な格好をして来るのでちょっぴり憂鬱だった。ところが、クラスにはもっと憂鬱なコがいた。クラスメイトの加納さんは、ナイスバディで目立ちまくりのお母さんと、自分が比べられてしまうのが嫌で仕方がなかったのだ！そんな加納さんをクロミちゃんが見逃さないはずがなくて・・・

歌ちゃんのクラスの委員長、駒鳥つくねちゃんはちょっぴりドジな女の子。無理をしてがんばりすぎてしまうから、ますます失敗ばかり。今日も、頼まれたことを一人で全部引き受けて、焦ったせいで転んでしまい、資料を整理するはずが逆に散らかしてしまった。そこに現れたのが、マイメロディちゃん。つくねちゃんは手伝ってもらって嬉しかったのだけれど・・・？

真菜ちゃんが格闘技のコーチをしているジムを見学していた歌ちゃんは、そこでなぜか、妹の琴ちゃんを目撃した。一体どうして、琴ちゃんがジムに？実は琴ちゃんのボーイフレンドの太田くんが格闘技を習っていたのだ。おまけにいじめっこで強くて有名な、ライバルジムのヤマトくんとの対戦をひかえて特訓中だった。マイメロディちゃんも格闘技に興味津々で・・・

歌ちゃんのクラスの有働くんは、背が高くて身体が大きいのに、気弱な自分にコンプレックスを抱いていた。ところが、不良に絡まれていたところを柊先輩にカッコよく助けられ、自分も柊先輩のようになりたい！という夢を抱くようになった・・・ 一方、柊先輩は、バクくんが吐き出した黒音符の奏でる音楽に、心を魅了されていた・・・

マイメロディちゃんの故郷、マリーランドでは異変がおこっていた。お城のゴルフコースのバンカーが、大きくなってしまったようなのだ。もしや、これはマイメロディちゃんの魔法がクロミちゃんの悪夢魔法に負けているからなのでは！？これは一大事！ということで、マリーランドの 王様がパワーアップの秘術を施すために、人間界へと向かった。

歌ちゃんと小暮くんはいつもケンカばかり。だけど、ホントは・・・好きだったりして！？クラスの女の子たちにからかわれた小暮くんはムキになって否定してしまう。小暮くんは、スタイルが良くて美人の女の子、が理想だと言い張った。そこに現れたのは、クラスで一番の美人、宮前貴子ちゃんだった。何故か小暮くんをデートに誘った貴子ちゃんだが・・・

最近の音楽部は活気がなくて、永代橋先生は困っている。柊先輩が部活に来てくれないので女の子たちがサボるようになってしまったのだ。おまけに、柊先輩は音楽への情熱を失ってしまったみたい・・・一体どうしたらいいの？思い悩む先生の前に、クロミちゃんとバクくんが現れた！！クロミちゃんは魔法をかけるのだけれど・・・？

お掃除をしていた歌ちゃんが、偶然にもマイメロディちゃんの弱点を突いてしまった。気絶してしまったマイメロディちゃんを介抱しているところに、柊先輩から電話がかかってきた！歌ちゃんは大喜びで出かけて行った。ところが柊先輩には狙いがあって・・・ 一体、マイメロディちゃんの弱点って？

クラスメイトの占部恵子ちゃんの占いがよく当たると評判になっている。小暮くんも恋の悩みを言い当てられてドキっとしてしまう。一方、歌ちゃんたちも、その評判を聞いて占いをしてもらった。歌ちゃんが占ってもらったのはもちろん、先輩との恋の行方！ところが、その占いで教えられたラッキーアイテムは変なものばかりで・・・？

今日は歌ちゃんのお誕生日。マイメロちゃんは三日前からケーキを作ってくれている。家族もお友達も、みんなで集まってお誕生日パーティーをするはずなのに、時間になって来てくれたのは、小暮くんだけ・・・一体どうして？もしかして、これは悪夢魔法のせい？ 小暮くんは歌ちゃんのために何とかしようとするけれど・・・？

奏お姉ちゃんは、役者を目指している同級生の菊池くんと付き合っている。しっかり者でやさしいお姉ちゃんは、菊池くんの夢を応援していたのだが、小さな失敗でクヨクヨしている菊地くんの意気地のなさに、堪忍袋の緒がきれてしまった。反省した菊池くんは、奏お姉ちゃんの理想の男性になりたい！と願うのだが・・・そこにクロミが現れて、魔法をかけられてしまった！

クロミちゃんの子分のバクくんは、働き者でがんばりやさんだ。黒音符集めのお仕事だけでなく、なまけ者のクロミちゃんのお世話に、アルバイトやボランティア活動までしている。すっかり街の生活にも慣れ、街の人達ともうちとけていた。そんなバクくんの知られざる日常を、密着レポート！一体バクくんってどんなコ？

バクくんの一族には、知られざる秘密の力があった。55年に一度、眠っている人の夢の中に入れるというのだ。バクくんは一世一代の晴れ舞台とばかりに、クロミちゃんだけでなく、家族や、マイメロちゃんたちも呼び出した。さて、一体誰の夢に入ろうとしているのかというと・・・それは、柊先輩だった！！

めずらしく急いで帰る真菜ちゃん。しかも、デートなの！？スポーツ万能でかっこいい、あの真菜ちゃんが？歌ちゃんたちがこっそりあとをつけると、DVDをレンタルしてそのままお家に帰ってしまった。実は、真菜ちゃんの大好きな映画のDVDの発売日だったのだ。そんな、真菜ちゃんの横には、ペットのカエル、コジローがいた・・・

ある日突然、歌ちゃんの家の、お隣の家がなくなってしまった！一体どうして？ところが、もっと驚いたことに、翌朝、お隣にはお城が建っていた。そのお城は、人気映画シリーズ「ハルノスケシリーズ」に出てくるお城にそっくり。実は、お隣に引っ越してきたのは、そのハルノスケシリーズの監督、黒川監督だった。

クリスマスが近いある日、駅にお父さんを迎えに行った琴ちゃんは、同じくらいの年の女の子がお母さんと一緒にいるのを見て、少し寂しくなってしまう。「お父さんがいるもん！」と強がってはみるものの、やっぱり・・・ 琴ちゃんがクリスマスに、サンタさんに頼んだのは特別なプレゼントだった！

今日はお正月。初詣におみくじに、みんな仲良く楽しい時間を過ごしている。そこに、マリーランドの王様と大臣がやってきた。マイメロディちゃんは、特別にマリーランドに帰って良いことになり、ひさしぶりに里帰することになった。もちろん、仲良しの歌ちゃんと一緒！さて、マリーランドの新年って、一体、どんな感じ？

かっこよくてモテモテの柊先輩は、今日も、女の子たちに追いかけまわされている。なんと親衛隊までいるのだ！ 女の子達の声援に、周りの男子たちは面白くないみたい？ ケンアクなムードになるのを止めたのは、柊先輩の親友を自称する“柿崎くん”だった。でも実は、柿崎くんも内心は複雑みたいで・・・

マイメロディちゃんの朝のお目覚めはとっても早い。毎朝、歌ちゃんたちのお弁当と朝ごはんを作っている。みんなが学校に行った後は、おうちのお掃除にお洗濯にお掃除にetc・・・お家のお仕事で大忙し！ だけど、みんなの夢を守る使命もしっかり果たす、マイメロディちゃんの一日に密着しちゃう！！

ウィーンのバイオリンコンクールに出場した柊先輩。日本で先輩の優勝を祈っていた歌ちゃんだが、その結果は・・・！ 実は、柊先輩にダークパワーの魔の手が迫っていたのだった。歌ちゃんの恋は？柊先輩は？マイメロディちゃんとクロミちゃんの魔法対決の行方は？ そして、ダークパワーって一体何なの？！

落ち込んでしまった柊先輩を励ますために、クロミちゃんは魔法の“メロディ・バイオリン”を手に入れようと決意した。そのためには、警備のきびしいマリーランドのお城に突入しなくてはならない。もし捕まれば、一生、お城の反省部屋で過ごさなくてはいけない！！ 全ては愛する柊先輩のため、クロミちゃんは出発した！

ついに、魔法の“メロディ・バイオリン”を手に入れた柊先輩。その音色に心の隅々まで魅了されてしまう。しかも、そのパワーにより、クロミちゃんの魔法がさらにパワーアップした！ マイメロディちゃんピンチ！ さらに、ダークパワーの精・ダーちゃんは、邪魔なマイメロディちゃんと歌ちゃんのキズナを壊す方法を柊先輩に伝えて・・・！

憧れの柊先輩がクロミの手助けをしていたことを知り、歌ちゃんは大ショック！！歌ちゃんはすっかり元気をなくしてしまう。みんながそれぞれ方法で励まそうとするけれど、歌ちゃんの心には届かない・・・ そんな時、“夢の扉”が開いたことに気付いたマイメロディちゃんは、元気のない歌ちゃんのため、たった一人で悪夢魔法に立ち向かう決意をした！！

ある日マイメロディちゃんは、良いことを思いついた。柊先輩におねがいして、黒音符を集めるのをやめてもらおう！ 早速、おみやげのタルト作りにとりかかった。何ていったって、マイメロディちゃんの作ったお菓子を食べると、みんな楽しくて優しい気分になってしまうのだから！ ところが、柊先輩の家に向かう途中で、色々なことに巻き込まれてしまい・・・

黒音符100個まであとひとつ！ 浮かれるクロミちゃんとは対照的に、バクくんは浮かない顔。バクくんは、マイメロディちゃんに仕返しをしたい訳ではないのだ・・・ そんなバクくんの前に、マリーランドにいるはずの家族全員がやってきた！ 住んでいたお家が壊れてしまい、バクくんを頼ってきたのだが、柊先輩は冷酷な態度で追い出してしまう。

ピンク音符も黒音符も100個まであとひとつ! ピンク音符が100個揃うと発動するドリームパワーの曲に歌詞をつけるため、美紀ちゃんは悩んでいた。ポエム作りが得意な美紀ちゃんを、見込んでおねがいしたのだけれど、美紀ちゃんはスランプに陥ってしまった！ このままだと、ピンク音符が揃ってもドリームパワーの曲が歌えない！？

ついに発動したダークパワー！ その影響は夢ヶ丘市から世界中に広がり、異変を引き起こしていた。一方、マイメロちゃんはダークパワーの曲の悲しい調べに涙を流す・・・ 柊先輩の深い悲しみを知った歌ちゃんは、もう一度、柊先輩と話しをするために、ダークパワーの中心地へと向かった・・・！

完全に覚醒したダークパワーの精・ダーちゃん！ さらに強大になったダークパワーは世界中を包み込んでいた。 このまま終わりになんてさせない！ ドリームパワーを発動させて、みんなの歌声で世界を・・・柊先輩の心を救ってみせる！ おねがい！マイメロディ！みんなのためにタクトを振って！！

マイメロちゃんがパワーアップ！！完全なドリームパワーがついに発動した！ ダークパワーに対抗する美少女グループ「夢防衛少女隊」がついに完成！？ みんなの歌で柊先輩も世界も救う！！ ドリームパワーと歌ちゃんの歌声は、ダークパワーを打ち破り、柊先輩の心に届くのか！？