選抜組の四人ーーティア、モニカ、エレナ、そしてアネットが任務地でなぜか消息不明となった。 手がかりを得るため、クラウスは任務開始前の期間を振り返る。

任務先の歓楽地モデロで休暇を楽しんでいた選抜組の四人は、アネットの生き別れになった母親・マティルダと遭遇する。だが彼女の記憶はアネットから失われておりーー

マティルダの正体は帝国のスパイだった。 陸軍に引き渡すべきと主張するモニカに、ティアは断固反対する。選択を迫られ、アネットが仲間たちに示した意志とはーー

ティアたち選抜組の四人は、マティルダを国外に逃がすための作戦を開始する。クラウスとリリィも現地に到着。さらに想定外の強者も参戦し、事態は混迷を極める。

遡ること二ヶ月前。初の不可能任務のため、ガルガド帝国首都に潜入していたモニカは、技術者の息子・マテルと接触する。それをきっかけに自身の人生を振り返る。

陽炎パレスでの日常が戻ってきたある日、サラが一般人の男性からラブレターをもらう騒動が勃発。 ティアは仲間たちを指揮し、完璧なデートを演出しようと意気込むがーー

「俺様、アルバイトをしますっ!」。 任務のため、街のレストランにアネットが潜入する事になった。 見張りに同行した仲間たちは、アネットの意外な一面を目撃しーー

第三の不可能任務先は、合衆国の大都市ミータリオ。 「蛇」との決戦を前にし、 現地での指揮役を命ぜられたティアは密かに思い悩む。 だが旅立ちの日は刻々と近付きーー

「灯」メンバーはそれぞれ潜入し「蛇」の情報を集める。 ミータリオの街の裏では連日、謎の「スパイ殺し」が暗躍し、各国スパイの不審死や行方不明が相次いでいた。

大都市ミータリオの裏で同時多発する闘い。 「灯」はそれぞれ死力を尽くして立ち向かうが、「蛇」のメンバー「紫蟻」の 悪辣さと強大さは、想定をはるかに上回っていた。

第三の不可能任務はついに最終局面を迎える。死力を尽くして闘う「灯」と「蛇」の「紫蟻」。かつての「焔」壊滅劇の、秘められた真実までもが明らかとなっていきーー

「灯」は大都市ミータリオから陽炎パレスに帰還。いつもの日常が戻るーーかと思いきや、事件の残した波紋は大きい。教え子たちを導くため、クラウスの下した選択は…？