"デーモン"と呼ばれる小生物にアナと名前をつけて、飼い始めた剣斗(けんと)少年。だが、驚異的な能力を持つ彼の新しい友だちを、周りのみんなが快く思っているわけではない。

旅に出た剣斗とアナを、さまざまな危険と困難が待ち受ける。西に向かう運送会社の車に乗せてもらうことにしたものの、そこには、優しそうに見えるが怪しい雰囲気の男がいた。

静岡で、サービスエリアがそのまま町になった活気のある地域に到着し、ほっとしたのもつかの間。剣斗とアナは、宿泊できる場所を見つけられず途方に暮れる。

廃墟と化したショッピング施設で襲われ、取り残されている子供がいることを知った剣斗は、その子を救い出すために立ち上がる。

名古屋に到着した剣斗と楓(かえで)の目の前で、1台の小型飛行機が墜落。そこに突如現れた巨大グモのデーモンが暴れ始める。

クモのデーモンから剣斗を救おうと戦っている最中に、アナが突然変異する。平和機関で働いている友人に電話をかける楓。

アナを取り返すため、大阪で一ノ瀬に力を貸してほしいと懇願する剣斗と楓。だが、平和機関の本部に忍び込むのは容易ではない。

楓と一ノ瀬、剣斗の3人が力を合わせて、アナを救出しようとするなか、楓は久しぶりに祖父と顔を合わせ、意見の違いから衝突する。

最初は反抗的な態度をとっていたが、少しずつ九重航矢との生活に慣れていく剣斗。だが、アナが近くにいることを感じ取り...。

アナの友達に助けてもらい、博多行きの列車の切符を手に入れる剣斗。だが、平和機関に居場所を嗅ぎつけられてしまう。

平和機関に追われながら旅を続ける剣斗とアナは、キリコという名の謎めいた少年に出会い、彼の家に泊めてもらう。

やっと見つけた剣斗の生活環境に危機感を持った楓は、彼を連れて帰るために、剣斗の母親の件に着手することに。

暴れ狂う復元のデーモンから逃げようと力を合わせる面々。だが、剣斗は危険を承知で、キリコと直接話をするために博多へ戻る。