冒険には、まだ続きがあった—— 国際テロ組織・テントをめぐる一連の任務から帰還した矢先、乃木憂助（堺雅人）の目に飛び込んできたのは、祠に置かれた赤い饅頭。それは、別班の緊急招集を告げるサインだった——！ 憂助が、父でありテントの指導者でもあったノゴーン・ベキ（役所広司）に銃弾を放った“あの日”。 また、薫（二階堂ふみ）、ジャミーン（本間さえ）と再会し、２人を力強く抱きしめた“あの日”。 その裏で一体何が巻き起こっていたのか…？ “世界中を巻き込む大きな渦”の中へ 冒険が、再び幕を開ける――

自衛隊の非公認部隊である「別班」、その一員である主人公・乃木憂助（堺雅人）。自身の復讐を果たそうとする実の父親・ノゴーンベキ（役所広司）を射殺し、事は済んだかに見えたが、その裏で、新たなる冒険はすでに始まっていた。別班招集を意味する赤い饅頭、その意味を知り驚愕する乃木、新たな冒険は、かつてないほど険しいものになる。

序盤戦の大クライマックス回！！そしてシリーズ最大規模、あなたの予想を全て覆す展開は、リアタイ視聴超必須！別班奪還へ、事件の首謀者は！？ キプロスで、アリ（山中崇）を尋問したところ、新庄（竜星涼）の居場所が判明する。公安を裏切った新庄は、ある大富豪の伝手でタイへの逃亡に成功していた。タイで新庄確保に動き出す乃木（堺雅人）とドラム（富栄ドラム）。そして、櫻井司令（キムラ緑子）の指示で乃木の部屋に別班の仲間が来るという。しかし、時間に現れたのは、丸菱商事専務の長野（小日向文世）だった。彼の正体は、果たして味方なのか、それとも敵か…

囚われた5人の別班を追う乃木（堺雅人）は、ノゴーン・ベキ（役所広司）脱獄を実行した新庄（竜星涼）を主犯と見て、タイへ渡った。その乃木の前に新たなる別班員として姿を現したのは、丸菱商事の長野専務（小日向文世）。長野の協力により、新庄を追い詰め拷問する乃木だったが、別班の一件には新庄が関与していないことを知る。 そして遂に、別班を捕らえた真犯人が姿を現す！！！ それは、バルカで出会い命を助けられた恩人、公安の野崎（阿部寛）だった。 野崎の暗躍の全貌が明かされる。

野崎（阿部寛）の裏切りに気づけなかった乃木（堺雅人）は自身の甘さを責めつつも、逃亡先の手がかりを追っていく。 そんな中、野崎を知る3人にターゲットを絞る。野崎の手足となり、乃木をロシアに誘導しようとした警視庁サイバー対策課の東条（濱田岳）、野崎の上司である公安部長の佐野（坂東彌十郎）、そして、野崎が信頼を寄せるバルカ警察チンギス（Barslkhagva Batbold）である。 果たして、何が見えてくるのか… ？

野崎（阿部寛）の行方を追った乃木（堺雅人）は、東条（濱田岳）、チンギス（Barslkhagva Batbold）、佐野公安部長（坂東彌十郎）に接触し話を聞く。 そして、佐野の口から語られたのは、野崎守の潜入捜査の真実だった。 一体何を目的としているのか、野崎とシンシーの関係性はなんなのか！？ 物語の中核を形成する5年前の物語が紐解かれる。 そして、野崎すら知り得ない現実が、幕をあける…

野崎の潜入捜査がシンシーにバレた。発端は死んだはずの野崎の部下、リュウミンシュエン。野崎からのメッセージも解読され絶対絶命の別班奪還作戦に、非情な決断が下される。 “VIVANT”の物語が始まった5年前、語られた野崎（阿部寛）の過去。シンシーの狙いが見えてきた中で、野崎の潜入作戦が敵に見破られてしまう。 …と、そこにあらわれたのは、死んだはずの野崎の部下、乃木（堺雅人）と瓜二つの男、リュウミンシュエン（堺／二役）だった。 さらに、野崎が暗号化して日本に送っていたメッセージも解読され、絶体絶命の状況に陥ってしまう。 黒須（松坂桃李）たち別班員を助ける為に奔走する乃木に、非情な通告が行われる。