戦いの炎が世界を包みこもうとするなか、思わぬ現実を突きつけられるエアベンダーの少年。それから100年後、水の部族の兄妹がすべてを変える発見をする。

アバター・キヨシにちなんで名づけられた小さな島で、最強の戦士たちと出会うアン、カタラ、サカ。一方、アバターの居場所を突き止めた火の国の王子は...。

オマシュの街で、ひとりの整備士、そして抵抗軍を率いるハンサムなリーダーと出会ったアンたち。裏切り者の存在をめぐって意見を対立させた3人は、土の王国を守ることはできるのか。

捕らわれの身となったアンは、国王と対面した後でゲームに挑まされる。アンを救い出すため暗いトンネルを進んでいくカタラとサカは、互いを認め合うことの大切さを知る。

消えた村人たちを助け出すため、精霊の世界へと足を踏み入れた3人。だがそこには、大きな危険、つらい記憶、そして謎めいた存在が待ち受けていた。

火の国の追手が迫るなか、仲間を救うためアバター・ロクに助けを求めるアン。その後、要塞(ようさい)に閉じ込められたアンは、仮面の人物に助け出される。

大きな危険にさらされた、北の水の部族のもとにやってきた3人。サカが水の部族の姫と知り合う一方、カタラは水の技の達人に戦いを挑む。そしてアンは、クルクの言葉を胸に刻む。

火の国を率いて北に攻め入ったジャオが、水の部族の力を封じるために恐ろしい作戦を実行する。希望が消えたと思われたその時、アンの身に驚くべき変化が起こる。