第23回天下一武道会から5年。悟空はチチと、彼の息子である悟飯と共に、山で平和に暮らしていた。そんなある日、不審な宇宙船が地球に到着する。中にいた男は「カカロット」なる人物を求めて、大きなパワーを持つ者を探し始める。その男が最初に向かった先には、打倒悟空のため修行を続けるピッコロの姿が・・・。

カメハウスに住む亀仙人とクリリンを5年ぶりに訪ねた悟空。再会を喜び合う皆の前に突如、悟空をカカロットと呼ぶ戦士が降り立つ。幼い頃の悟空と同じ尻尾を持つその男は、ラディッツと名乗り、自分は宇宙位置の強戦士族サイヤ人で、悟空の実の兄であると告げる。そして、悟空に仲間になれと命じるが・・・。

ラディッツに連れ去られた悟飯を取り戻そうとする悟空の前に、ピッコロが現れる。ピッコロと悟空は、打倒ラディッツのため、一時的にコンビを組む。2人はドラゴンレーダーを利用してラディッツの居所を突き止め戦いを挑むが、圧倒的な力の前に、手も足も出ない。レベルの違いに愕然とする2人に・・・。

歴然たる実力差を前に、なす術のない悟空とピッコロ。最期の望みとして、ピッコロは新必殺技「魔貫光殺砲」を放つが、間一髪でかわされてしまう。しかし、ラディッツがピッコロにとどめを刺そうとした瞬間、悟空が尻尾をつかみ形勢は逆転。だが、ラディッツの嘘に騙され、再び絶体絶命のピンチに立たされる・・・。

ラディッツが驚愕するほどの力を発して宇宙船から飛び出し、強烈な体当たりを食らわせる悟飯。その隙をつき、羽交い締めにされ身動きのできないラディッツを、悟空もろともピッコロの魔貫光殺砲が貫いた・・・！ラディッツは死の間際に、仲間である2人のサイヤ人が、1年後に地球を襲うと告げる。そして悟空も・・・。

神様に連れられ、閻魔大王のもとへやってきた悟空は、そこで、全宇宙の神の頂点に立つ界王様のもとで修行する許可を得る。界王星を目指して、百万キロあるという蛇の道を走り始める悟空。その頃、気絶したままの悟飯を連れ去ったピッコロは、1年後にサイヤ人に立ち向かう戦士としての悟飯の潜在能力を試す。

ピッコロによって荒野に置き去りにされた悟飯は、恐竜に襲われるが、あわやの瞬間に潜在能力が覚醒！高い岩場へと逃れるが、そのまま降りることが出来なくなってしまう。そんな悟飯を、ピッコロは隠れて見守る。一方、悟空は蛇の道で足を滑らせ、次々と伸びる黒い手に地獄に引きずり込まれそうになっていた。

悟空と悟飯のことをチチに伝えられないまま、カメハウスに戻ってしまったクリリン。しかし、突然帰ったクリリンを怪しみ、牛魔王と共にカメハウスを訪れたチチは、亀仙人から2人の行方を聞き失神・・・！そんな中、荒野の岩の上で途方にくれる悟飯は、家を想い満月を見上げる。すると、体にある異変が・・・。

砂漠に開いた穴に落ちた悟飯は、地下の古代遺跡で砂に埋もれたロボットを発見。ロボットは眠りを妨げるなと言うが、悟飯は嫌がられながらも何度もロボットを起こす。何かと面倒を見るうちに悟飯と打ち解けはじめるロボット。しかし、共に追跡から逃げ出そうとご飯が砂を掘り始めた途端、もろくなった遺跡の天井が・・・。

1年後の危機に備え、ヤムチャを訪ねるクリリン。武道から離れ、プロ野球選手として活躍していたヤムチャも、悟空の死とサイヤ人の来襲を知り、神様のもとで修行をする決心をする。そのころ、荒野でサバイバル生活を続けていた悟飯は、ケガをした草食恐竜の世話を始める。だがそこに獰猛な肉食恐竜が現れ・・・。

地球に向かうサイヤ人・ベジータとナッパは、その途中でアーリア星の略奪を目論む。だが、豊かな星だったアーリア星は、独裁者モアイが支配する荒廃した星となっていた。おとなしく城へ連行された2人ではあったが、ナッパが兵を一掃し、最終兵器の怪物をも易々と倒す。ベジータはモアイを殺し、民に感謝されるが・・・。

ランチに付きまとわれながらも、餃子と共に山奥の滝で修行を続けていた天津飯。スカウターを頼りにやって来たクリリンとブルマの話を聞き、神様の稽古を受けることを決める。同じ頃、やっとのことで蛇の道を半分まで進んだ悟空。しかし、道路清掃車の後ろに乗せてもらううちに疲れて眠りこんでしまい・・・。

天津飯たちは神様の修行を受けるべくカリン塔を登り始めた。同じ頃、悟空は寝ている間に蛇の道から滑り、地獄に落ちてしまう。戻れなくなった悟空が、円生樹の実を食べようとするのを鬼のゴズとメズが見とがめる。しかし事情を聞いた2人は、蛇の道への抜け道を教える条件として悟空に鬼ごっこを挑んでくる。

クリリンらは神様の神殿で特訓を開始する。そして、蛇の道に戻った悟空は途中で館を発見、不思議な力で吸い込まれてしまう。しかも館の主である蛇姫が悟空にひと目ぼれ。なんとか引き止めようと様々な策を弄するが、悟空は誘惑をことごとくかわし先を急ごうとする。さらに悟空が結婚していると知った蛇姫は・・・！？

悟空が、ようやく全道程の半分を過ぎた頃、荒野で修行中の悟飯はホームシックにかかり、家に戻ろうとしていた。しかし砂漠を抜けてたどり着いた海岸をいくら走っても、元の場所に戻ってしまう。不思議に思った悟飯は山へ登り、自分のいる場所が島であることを知る。それでも諦めず、イカダで脱出を試みるが・・・。

嵐に巻き込まれ、海に投げ出された悟飯は、打ち上げられた海岸で見知らぬ子供たちに助けられる。最年長のピゲロを中心に子供だけで廃墟に暮らす彼らは、親を失った孤児たちであった。彼らは孤児院への収容を拒み逃げ続けていたのだ。だが、悟飯と出会った翌日、ピゲロと悟飯を残して全員が捕まってしまい・・・。

荒野に戻りいよいよ本格的な修行を開始したピッコロと悟飯。その後、なかなか稽古をつけてくれない神様に業を煮やしたクリリンたちは、すべての時間が混ざり合うという部屋に案内され、時の旅へと送り出される。時空を越えた4人は突然謎の2人組に襲われるが、手も足も出ず・・・。

切られてから半年が経ち、尻尾が再生した悟飯はまたも巨大な猿に変身！ピッコロは即座に月を破壊しようとするが、いくら攻撃しても壊すことができない。攻撃を受けつけない怪しい月の存在に気付いたピッコロは・・・。その頃、やっと蛇の道の終点までたどり着いた悟空は、そこにあるはずの界王の家を探すのだが・・・。

界王星でついに界王様と出会った悟空。超ダジャレ好きである界王のギャグ試練（？）をなんとか突破し、いよいよ界王星での修行が始まった。地球の10倍もの重力下で、界王のペット・バブルス君を追いかけること3週間。見事に重力を克服し、バブルスを捕まえた悟空に、界王はある期待を寄せるのであった。

界王様が悟空に課した次なる修行は、彼の世話係・グレゴリーをハンマーで叩くこと。バブルス以上に素早く逃げ回るグレゴリーを、悟空は必死に追跡！そんなある日、界王は凶悪なサイヤ人の歴史と、彼らが4人を残して滅亡するまでを悟空に語る。それを聞いた悟空は、サイヤ人を倒すため闘志全開で修行に励む！

悟空は界王星で修行を終え、界王様直伝の超技・元気玉の威力を試す。だがサイヤ人は、予定より早く地球に近づきつつあった。さらに界王の計算ミスが発覚し、急遽下界へ戻ることになった悟空は、ドラゴンボールで復活。フルパワーで蛇の道を駆け戻るのだが・・・。そしてついに、最凶の悪夢が天より来襲した！

地球に降り立ったサイヤ人・ベジータとナッパは、最も高い戦闘能力を探し、ピッコロと悟飯のいる場所へ飛んだ。彼らのもとにクリリンも駆けつけ、現れたベジータらと対峙する。戦闘態勢をとるピッコロたちを前に、ベジータはナッパにある命令を下した。ナッパが土にまいた種が、一瞬のうちに不気味に育ち・・・。

土中より現れた6匹のサイバイマンとピッコロたち3人が激突！火花散る戦場に、天津飯と餃子、そしてヤムチャが駆けつけた。集結した6人の戦士に、ベジータはゲームと称してサイバイマンとの一騎打ちをもちかける。先鋒を買って出た天津飯は、一瞬にしてサイバイマンを撃破！！　続くヤムチャも攻勢に出るが・・・。

怒れるクリリンの放った一撃がベジータたちを猛襲！！3匹のサイバイマンを殲滅し、辛うじて避けた1匹もピッコロが倒した。だが直撃を受けたはずのベジータとナッパは無傷。ベジータの許可を得てついに参戦したナッパは、天津飯の腕を力まかせに断ち落とし、5人を相手に圧倒的なパワーを見せつける！！

餃子の捨て身の自爆もナッパには通用しなかった・・・。その死に怒る天津飯だが、奮戦虚しく深手を負ってしまう。ピッコロ、クリリン、悟飯はナッパなわずかなスキをつき奇襲をかけるも、悟飯が恐怖で動けずあえなく失敗。ナッパ怒濤の猛攻のさなか、天津飯は餃子の仇を討つべく、残された最後の力を解放する！！

あえて悟空の到着を待つことにしたベジータは、ピッコロに3時間の猶予を与えた。おさまりがつかないナッパは、やってきた地球の軍隊を相手に大暴れ。壊滅させたうえ、都市までも消し去ってしまう。悟空の到着を願うクリリンだが、叶わないままに3時間が経過。再びナッパと相まみえるピッコロたちの運命やいかに！？

打倒サイヤ人の最後の秘策を胸に、ピッコロたち3人はナッパに襲いかかる。だがやっと掴んだ弱点の尻尾は、鍛錬により克服されていた。クリリン必殺の気円斬もかわされ、絶望の淵へと追い込まれたその刹那、ようやく戦場に近づく悟空の気配が・・・！！その予想外の戦闘力に焦るベジータは、3人の抹殺をナッパに命じる！

ナッパのエネルギー弾から悟飯を守り、ピッコロは荒野に散った・・・。悲しみ怒る悟飯が放った魔閃光も、ナッパを倒すには至らない。力のすべてを使い果たした悟飯に迫る、死の足音。身動きのとれない悟飯に、ナッパのトドメの一撃が振り下ろされた。だが次の瞬間、悟飯が目にしたのは、ついに到着した悟空の姿だった！

悟空は攻防あらゆる面でナッパを圧倒し、まったくツケ入るスキを与えない。怒りのあまり我を失うナッパをベジータは諫めるが、冷静になったナッパが放った最高の技さえも、悟空はかめはめ波で切り返してしまう！いら立つベジータに交代を命じられたナッパは、その怒りの矛先を悟飯とクリリンに向ける！

皆の仇討ちにはやる悟飯とクリリンをカメハウスへ帰し、悟空はベジータとただ2人、新たなる戦場に立った。悟空対ベジータ、天下分け目の超決戦がついに開始！悟空を遙かに上回る実力で圧倒するベジータに、悟空は界王拳で対抗する。だが２倍界王拳を持ってしても、その動きを捉えることができない。

限界を超えた3倍界王拳を駆使し、ベジータを猛襲する悟空。その力はベジータを凌いだものの、悟空の体も過大な負荷に耐えかねていた。プライドを傷つけられ逆上したベジータは、地球もろとも悟空を倒そうと、渾身のギャリック砲を撃つ。これに対抗するべく、運命を賭けた悟空のかめはめ波がベジータに向け放たれる！

自らの手で月を造り出し、大猿に変身したベジータ。通常時の10倍に達する戦闘力で襲いかかるベジータに立ち向かう術はただ1つ、元気玉だ。だが元気玉を作るには、精神を集中させるための時間を稼がなくてはならない。とっさに太陽拳を放ち、ベジータの目をくらませた悟空。地球全ての元気をその身に集めるが・・・。

戦場に駆けつけた悟飯とクリリンが目にしたのは、大猿の手に掴まれた瀕死の悟空だった。悟空を救うべく悟飯たちは大猿の尻尾を狙うが、決死の陽動作戦も失敗に終わる。絶体絶命と思われたその刹那、ヤジロベーの刀が、見事尻尾を切断！人間の姿に戻ったベジータだが、それでも悟飯たちの敵う相手ではなかった・・・。

悟空から元気玉を託されたクリリンは、悟飯と闘うベジータのスキを必死にうかがっていた。界王様の助言を受け、ついにベジータの悪の気をとらえたクリリン。だがヤジロベーの余計な一言が、ベジータにその気配を感づかせてしまう。ギリギリのところで避けられた、希望の一撃。非情にもその元気玉は悟飯の立つ方向へ・・・！

ベジータの衝撃を受け瀕死の悟飯だが、尻尾が再生していた！ベジータがヤジロベーと闘う間に大猿に変身した悟飯。理性を失い暴れる大猿だが、悟空からの必死の呼びかけが届いたのか、ついにベジータを急襲！ベジータはなんとか大猿の尻尾を切るが、倒れてくる巨体を避けられずに押し潰されてしまう。

長き死闘の果てに、ついにベジータを撃退した悟空たち。傷つき倒れる彼らをブルマたちが救出した。ピッコロが死んだため、神様もドラゴンボールも消滅。失われた命はもう戻らない。消沈するブルマたちだが、クリリンはある1つの可能性を考えていた。ベジータたちが言っていた、ナメック星のドラゴンボールとは？

ベジータとの闘いで生き残ったものの、大ケガを負って入院する悟空たち。また、ナメック星に行くための手段を探していたブルマは、サイヤ人の宇宙船を動かそうとして破壊してしまう。途方にくれる彼らに、ミスター・ポポが手を差しのべた。ポポとともに、地球の果てまでやって来たブルマたちが見たものとは・・・！？

ユンザビット高地にあった神様の宇宙船は、ブルマの家で改造が進められていた。あとは、誰が行くかを決めるだけ。しかし、頼りのミスター・ポポは、神様の神殿を留守にはできないと断る。メカにくわしいブルマとボディーガード役のクリリンが行くことになり、恩人のピッコロを生き返らせたい悟飯も名乗りを上げる。

1か月間の宇宙旅行がついにスタート。不安だらけで出発したものの、最初の1週間はトラブルもなく、クリリンと悟飯はイメージトレーニングに励み、ブルマは退屈を持て余していた。だが突然、ナゾの敵から攻撃を受け、一同はワナだらけの敵宇宙船内に取り込まれてしまう。脱出しようとするが、ブルマが敵の手に落ち・・・。

ナゾの宇宙船に乗っていたのは、なんと子供たちだけだった。フリーザに故郷を滅ぼされた彼らは、悟飯たちをなかなか信じてくれない。その時、宇宙船がピンチに！悟飯たちは、子供たちと力を合わせて流星群から船を守る。その結果、誤解もとけて、再びナメック星を目指すことになるが、今度は宇宙潮流に巻き込まれ・・・。

宇宙潮流に巻き込まれた悟飯たち。潮流を乗り越えた先に、ついにナメック星らしき惑星を発見する。さっそくドラゴンボールを探そうとした悟飯たちは、ガケ崩れに襲われたところを、ナメック星人のライチとザークロに助けられる。親切なライチの手助けもあり、思っていた以上に順調にことは運んでゆく。

早くも3個のドラゴンボールを見つけた悟飯たち。一方、地球では悟空がケガを治して激しい特訓を開始。さらに、ベジータもフリーザの基地にたどりついて治療を受け、復活を果たしていた。悟飯たちのドラゴンボール集めはその間も順調に続き、さらに2個のドラゴンボールの入手に成功していた！

順調に、ナメック星でのドラゴンボール集めを進めてゆく悟飯たち。氷の洞窟内にあった6個目のドラゴンボールも、数々の難関を突破し、なんとか手に入れることに成功する。ついに、最後の1個がある場所を突き止めるが、そこにはライチとザークロが待ち構えていた。彼らの行動に隠された秘密とは・・・？

ライチとザークロは、悟飯たちの宇宙船をだまし取ろうとして、ナメック星人になりすましていた別の宇宙人だった。すんでのところで宇宙船を奪い返し、今度こそ本当のナメック星に到着した一行。しかし、時を同じくしてベジータもドラゴンボールを求め、ナメック星に到着した。悟飯たちに危機が迫る！

悟飯たちやベジータより一足先に、ナメック星に到着した一団がいた。永遠の命を得るために、ドラゴンボールを狙うフリーザ一味だ。同じ目的を持つベジータは、一味のキュイと闘い、かつては同等だった相手を難なく倒す。また、悟飯たちもフリーザの手下を一蹴するが、命綱の宇宙船を破壊されてしまう。

ドラゴンボールを探して、ナメック星を移動するフリーザ一味。悟飯とクリリンは、近くを通り過ぎるフリーザから身を隠すが、その強大な気に恐怖を覚える。一方、地球では、復活した悟空がベジータとフリーザの存在を聞きつけ、ブリーフ博士の改造した宇宙船でナメック星に急行しようとしていた。

フリーザたちの後を追う悟飯とクリリンは、ナメック星人の村に到着した。村を襲ったフリーザたちはドラゴンボールを渡すよう村人を脅すものの、それが通じないと知るや村人たちを殺し始める！長老は一味がスカウターを頼りに村を探していることを知り、スカウターを破壊するが、その抵抗に怒ったドドリアが・・・！

フリーザ一味の幹部・ドドリアは怒りにまかせ、ナメック星人の戦士を皆殺しにしてしまった。さらに、子供たちの命だけでも守ろうと、ドラゴンボールを差し出した長老さえも殺してしまう。残った子供たちも命を奪われそうになったその時、とっさに悟飯が飛び出した。子供を救い、逃げる悟飯たちは追跡者を振りきれるのか！？

悟飯とクリリンを見失ったドドリアは、激怒し周囲を爆破！！ 2人を抹殺したつもりでフリーザのもとへ戻ろうとするドドリアに、ベジータが不意討ちをかける。以前とはうって変わってベジータに全く歯が立たないドドリアは、フリーザこそが惑星ベジータを滅ぼした張本人であることを告白して命乞いをする。

悟空がナメック星に向かっていることをブルマから聞かされ、悟飯たちは大喜び。ところが、悟空の宇宙船に隕石が衝突し、ナメック星への軌道からずれて灼熱の惑星突入の危機に・・・！そのナメック星では、気を探る技も身につけたベジータが、フリーザたちを出しぬいて、残るドラゴンボールのある村へやって来ていた。

ベジータはナメック星人たちの村を襲い、力ずくでドラゴンボールを手に入れた。星の危機を知ったデンデは、悪の手から仲間を救ってほしいと悟飯たちに頼み込み、クリリンとともに最長老の家へ出発する。一方、宇宙船内で修行に励む悟空はピッコロたちが界王星に到着したという朗報に勇気づけられる。

界王はナメック星に感じる超特大の気の主を察知し、絶対フリーザには近づくなと悟空に警告する。暴虐の限りを尽くすフリーザの行状を聞いたピッコロたちは、より強くなろうと、界王のもとで修行させてもらうための課題・ダジャレに挑戦。その頃ナメック星では、ベジータが単独行動中のザーボンに闘いをしかけていた。

ベジータの猛攻により追いつめられたザーボンが、ついに真の力をあらわにする。醜悪な姿に変身し、強大なパワーでベジータを圧倒！絶対的な力の差を見せつけベジータを完膚無きまでにたたきのめし、フリーザへ報告に向かう。同じ頃、クリリンとデンデは最後のドラゴンボールを持つ最長老のもとへ到着していた。

最長老に面会したクリリンは、最後のドラゴンボールを受け取り、さらに自分の中に眠っている力を最大限に引きだしてもらう。一方、ドラゴンボールのありかを吐かせるため、ザーボンは息も絶え絶えなベジータをフリーザの宇宙船に連れ帰り、不本意ながらもメディカルマシーンでの治療を開始する。

界王星ではバブルスやグレゴリーを相手に天津飯たちの修行が続けられていたが、修行の成果に疑問を抱くピッコロは1人だけ参加しない。しかし、いざ組み手を始めると、ピッコロは以前より格段に上がったヤムチャの腕に驚く。一方ナメック星では、メディカルマシーンで治療を受けたベジータが復活を果たしていた。

ベジータがフリーザの宇宙船からドラゴンボールを奪って逃亡！一気にすべてを集めてしまおうと、最後の1つを持ってブルマのもとへと急ぐクリリンを追いかけるが、その追跡劇に気付いたザーボンも現れ、一触即発の危機に陥る。そのころ悟飯は、ベジータの隙をつき、池に沈めてあったドラゴンボールを手に入れていた。

クリリンのドラゴンボールを狙うベジータと、ベジータを追いかけてきたザーボンが、再び相まみえる。だが、変身後のザーボンをいともたやすくベジータは倒す。その強さに観念したクリリンは、最後のドラゴンボールを渡してしまう。同じ頃、宇宙船内の悟空は磁気嵐が原因で生じた100倍超重力と闘い続けていた。

惑星フリーザからギニュー特戦隊が発進！その目的地であるナメック星では、ドラゴンボールを持ってブルマのもとへ戻る悟飯が、ベジータに見つかってしまう。しかし、とっさの機転でベジータからドラゴンボールを隠しおおせた悟飯は、休むまもなく、潜在能力を引き出してもらうためにクリリンと最長老の家へ急ぐ。

フリーザが放った超特大のエネルギーが大地を震わせ、ブルマの持つ四星球が海中へ転落する。慌てて潜水艇で海中に潜ったブルマは、ドラゴンボールと無数の卵を守る巨大蟹と対決！なんとか無事にドラゴンボールを取り戻して地上に帰還するが、今度はフリーザの手下・ブールベリとラーズベリに捕まってしまう。

フリーザ配下のブールベリとラーズベリは、ブルマの話を聞き、ドラゴンボールを自分たちのものにしようと企み始める。ブルマは海にまだ残りのドラゴンボールがあると2人を騙して、潜水艇で海中を案内するが、途中で2人についた嘘がバレてしまう！その頃、宇宙船の中の悟空は100倍重力をも克服していた。

無事に修行を終えた悟空は、ナメック星での決戦に備えて宇宙船内で休息に入る。一方、クリリンと悟飯は最長老のもとへようやく到着するが、そこでベジータと遭遇。なんとか悟飯の能力を引きだすことに成功するものの、ベジータの力には及ばない。と、その時５つの大きな気が接近。もしや、この気の正体は・・・。

ついにナメック星に到着したギニュー特戦隊。倒すためにはドラゴンボールの力でベジータを不死身にするしかない・・・。ベジータと協力してドラゴンボールを集めるクリリンたちだが、あと一歩というところでギニュー特戦隊が現れてしまう。グルドVSクリリン＆悟飯、リクームVSベジータの闘いが始まった！

クリリンたちを獲物と決めたグルド。特戦隊の中では戦闘力の劣るグルドは、なんと時間を止める超能力を持っていた。それでもスピードをいかしてグルドを追い詰めるクリリンたちだったが、ついにはグルドの最終奥義である金縛りの術で動きを封じられてしまう。身動きの取れないクリリンたちは絶体絶命の危機に陥る！

不意討ちによりグルドを倒したベジータは、リクームとの対決に望む。パワー全開で先制攻撃をしかけるベジータだったが、戦闘力2万の攻撃もリクームには通用しない。パワフルな攻撃の前に瀕死状態となるベジータ。とどめのリクームイレイザーガンの攻撃にさらされたその時、クリリンの機転が彼を救う。

7つのドラゴンボールをすべて集めたフリーザは、願いをかなえる方法を突き止めるために最長老のもとへ向かう。一方、リクームに対して攻撃をしかける悟飯。全力を振り絞って闘うが、リクームは余裕の表情。渾身の力で放った魔閃光弾も片手で受け止められてしまう。そして、悟飯は遊び飽きたリクームによって・・・。

ついに悟空が到着。すべての状況を理解した悟空は、悟飯とクリリンだけでなくベジータにも仙豆を与えるのだった。3人が元気になったことを確認すると、リクームに対し1人で立ち向かう悟空。あまりにも落ち着いているその姿に不安を覚えるクリリンたちだったが、悟空はたった一撃でリクームを倒してしまう。

ジースとバータはスカウターで見た悟空の5000という戦闘力に油断して、攻撃を開始する。しかし、自慢のスピードを活かした直接攻撃を2人がかりで仕掛けても、一撃も当てることができない。格闘戦に不利を感じた2人は、ついに合体技であるパープルコメットボールを発動。多数の光弾が悟空を襲う！

ジースとバータに手を引かせるため、バータを一撃で気絶させて実力の差を見せつける悟空。その力に恐れをなしたジースは、ギニュー隊長のもとへ飛び去ってしまう。ジースを逃がしたことに憤慨するベジータは、バータとリクームにとどめをさし、悟空の甘さをののしる。一方、ギニューはジースの報告を受けて・・・。

ギニューの強さを認めた悟空は、クリリンと悟飯を逃がすために、ドラゴンボールの探索に向かわせる。それを見たベジータは隙をついて戦闘を離脱、クリリンたちの後を追いかけていってしまった。ただ1人ギニューたちに立ち向かう悟空。ギニューはその実力を確認するかのように、一騎打ちを仕掛けてきた！

18万にも達した悟空の戦闘力を見て、超サイヤ人の伝説が真実であったと恐れを隠せないギニュー。一方のクリリンと悟飯は、ドラゴンボール探索のためにブルマの隠れている場所に戻ったのだが、ブルマの姿はそこにはなかった・・・。そうした状況のなか、ついに最長老のもとにフリーザが到着してしまう。

デンデがクリリンたちに神龍を呼び出すための合い言葉を無事に伝えられるよう、ネイルはフリーザに対して時間稼ぎの闘いを挑む。また、悟空はギニューとの無益な闘いを避けるために圧倒的なパワーを見せつける！しかし、ギニューは不利な状況を楽しむかのように、なぜか自らを傷付け始める・・・。

ギニューと体が入れ替わってしまった悟空は、不慣れなうえに傷ついている体でギニューの後を追う。一方、悟飯とクリリンはフリーザの宇宙船で全てのドラゴンボールを発見するが、合言葉がわからずに神龍を呼び出すことはできない。そこに悟空の姿をしたギニューが到着。クリリンたちは悟空の登場に喜ぶが・・・。

悟空の体でパワーを全開にするギニューだが、戦闘力は思うように上がらない。悟飯たちの攻撃に、不慣れな体のギニューは大苦戦。しかし、体になれてくると形勢は逆転し、今度は悟飯たちがピンチに。そこにジースを倒したベジータが参戦。再び窮地に追い込まれたギニューは、ベジータとのボディチェンジを狙う。

ベジータとのボディチェンジが行われようとしたまさにその瞬間、2人の間に悟空が飛び込んだ。元の姿へと戻った悟空だが、そのダメージはあまりに大きく、最後の力をふりしぼったかめはめ波もギニューをとらえることはできない。再びベジータとのボディチェンジを狙うギニューに対し、悟空がとっさにとった策は・・・？

神龍を呼び出すための合言葉を聞くために、クリリンは最長老のもとへと向かう。一方、デンデも合言葉を伝えるべくクリリンたちのもとへと向かっていた。ネイルと闘っていたフリーザは、この闘いがそのための時間稼ぎだったことを知って激怒。猛スピードで悟飯たちへと迫る。はたして神龍を呼び出すのは誰なのか！？

ついに現れたナメック星の神龍。かなえられる願いは3つだが、1人ずつしか生き返らせることができないという。迷う悟飯たちにピッコロは、自分を生き返らせ、さらにナメック星にワープさせて欲しいと呼びかける。残る願いはあと1つ。その時、悟飯たちに出し抜かれたベジータが、怒りの形相で神龍の前に現れた！！

願いがかなわず怒り狂うフリーザ。その気は悟飯たちを怯えさせるには、十分すぎる程に強大なものだった。だがベジータは3人で闘えば勝てると豪語する。ベジータもまた大幅にパワーアップしていたのだ。一方、悟飯たちのもとへと急ぐピッコロは瀕死のネイルを発見。ネイルは自分と同化しろとピッコロに提案する。

変身を開始したフリーザは、ベジータの父・ベジータ王を殺し惑星ベジータを破壊した時でさえ、一度も変身することはなかったと語る。そしてフリーザの変身は完了。巨大化した体から発する気は、今までとは比べものにならない。フリーザが軽く片手を振り上げるだけで、周囲はすべて吹き飛んでしまうのだった・・・！！

フリーザの角で腹を突き刺されたクリリンが、無残な姿で湖へと落ちていく・・・。その光景に怒りを爆発させた悟飯が、フリーザに猛攻撃をしかける。その力に驚くベジータ。超サイヤ人に一番近いのは悟飯なのだろうか！？だがその攻撃もフリーザには効かなかった。フリーザはさらに戦闘力を上げ、悟飯に襲いかかる。

悟飯への攻撃を目の当たりにしたベジータは、あまりの力の差に手を出すこともできない。フリーザが悟飯にとどめを刺そうとしたその瞬間、クリリンの気円斬がフリーザの尻尾を切った。不思議がるフリーザを挑発し、逃げ回るクリリン。そのスキをついてデンデが悟飯のもとへかけよる。デンデが持つ能力とは・・・。

ついに到着したピッコロが自信たっぷりにフリーザと対峙する。クリリンはそんなピッコロの態度に不安を隠せない。だがピッコロの自信は本物だった。クリリンと悟飯の手を借りずに、1人でフリーザと闘うピッコロ。あの凄まじいパワーのフリーザと互角の勝負をするピッコロの姿に、3人は希望を見出すのだった。

本気の力はまだまだこんなものじゃないというフリーザだが、ピッコロもまた重い服を着て闘っていた。服を脱ぎ本気になったピッコロの力は、フリーザに勝るとも劣らない程凄まじいものだった。それにも関わらず、余裕の態度を崩さないフリーザ。困惑するピッコロに対し、フリーザが語り始めた驚愕の事実とは・・・！？

2度目の変身を遂げたフリーザが執拗にピッコロを痛めつける。たまらず飛び出した悟飯は、フルパワーの気功波をフリーザに放つが、あとひと息というところで弾き返されてしまう。サイヤ人の強さを改めて認識したフリーザは最後の変身を開始。一方ベジータは、デンデの能力を利用して超サイヤ人になろうと目論む。

ついに真の姿を現したフリーザは、悟飯たちが見ることもできない超スピードの攻撃でデンデを殺してしまう。悟飯たちは3人がかりで攻撃するが、フリーザに触れることすらできない。ただ1人フリーザの攻撃が見えていたベジータは自信たっぷりにフリーザに挑む。ベジータは本当に超サイヤ人になったのだろうか！？

己を超サイヤ人だと信じて疑わないベジータは、フルパワーのエネルギー弾をフリーザへ放つが、蹴りだけで簡単にはじかれてしまう。その圧倒的な力の差に絶望。大粒の涙を流して、生まれて初めての挫折を知る・・・。完全に戦意を失ってしまったベジータに刻一刻と死が迫っていたその時、悟空の傷がついに完治した。

フリーザのもとへ到着した悟空。パワーアップを果たした悟空を見たベジータは、フリーザに「これが超サイヤ人」と告げる。しかしその瞬間、フリーザのビームがベジータの心臓を貫く！！ 実力を見込んだ悟空にサイヤ人の誇りを託し、絶命したベジータ・・・。その遺体を埋葬した悟空は、フリーザへの怒りを爆発させる。

宇宙最大の闘いが、ついに始まった。闘いの最中、悟空に対し「ここまでやるサイヤ人は初めてだ」と、感心するフリーザ。そして悟空の実力を試すかのように、超能力で操った津波のようなマグマを浴びせかけるのだった。遠くで闘いを見守る仲間たちは、常識を超えるハイレベルな闘いに、ただ驚くことしかできない・・・。

悟飯を救うため、地球ではチチがナメック星へ飛び立つ準備を進めていた。同じ頃、悟空は気が読めないというフリーザの弱点を見ぬいて、2発のかめはめ波を使った不意打ちを成功させる。だが、カスリ傷１つ負わないフリーザは、超能力で悟空を攻撃。立て続けに金縛りを繰り出し、勝負にケリをつけようとする。

ウォーミングアップは終わりだと口を揃え、2人は戦いの場を地上へと移す。依然として余裕の笑みを浮かべるフリーザは、自らにハンデを課すと宣言。人を食ったようなその態度に、悟空は先制攻撃を仕掛けるのだった。一方ブルマはその頭脳が仇となり、カエルの姿をしたギニューにボディチェンジを食らう羽目に・・・。

悟空に隠された力を計算しても、マックスパワーの半分も出せば勝てると豪語するフリーザ。悟空はその立ち込める気から、虚勢ではないと感じとる。そして次の瞬間、フリーザのひじ打ちが悟空の顔面をとらえた。一方、地球では宇宙船の打ち上げが失敗。悟飯たちの前には、ブルマの身体を得たギニューが現れる。

悟飯たちと一緒にいたギニューは、ブルマからピッコロへ体を変えようとするが、悟飯に見破られて再びカエルに戻ってしまう。ブルマは元の体に戻れて大喜び。一方、悟空はフリーザの前に大苦戦。一気に追い込まれるも、仲間たちのことを思い出して再び反撃に転じる。そして20倍界王拳のかめはめ波で勝負に出るが・・・。

悟空が放った渾身の20倍界王拳かめはめ波も、フリーザには通用しなかった。手に傷をつけられたフリーザは激怒。再び一方的な猛攻で悟空を襲う。体力が限界の悟空は、最終奥義・元気玉にすべてを賭けることを決意する。その頃界王星には、隊長を除くギニュー特戦隊がごきげんなポーズで乗り込んでくる。

確実にフリーザを倒すために、時間を費やし巨大な元気玉を造ろうとする悟空。しかし、訝しがりつつも無防備な悟空を攻めていたフリーザは、水面に映る元気玉を見て悟空の作戦に気付いてしまう。万策尽きたと思われた瞬間、ピッコロが奇襲に出るが・・・。同じ頃、ギニュー特戦隊は界王星を乗っ取ろうと動き始める。

界王星を襲い始めたギニュー特戦隊に対し、修行を積んだヤムチャたちが互角の闘いを展開する。一方の悟空は、ピッコロの助けによって命拾いするも、元気玉の完成にはまだ時間が必要。懸命に時間を稼ぐピッコロに、悟飯とクリリンも加勢する。相次ぐ邪魔に激怒したフリーザは、星をまるごと消そうともくろむ！

界王星での一戦はギニュー特戦隊の敗退で決着し、ナメック星でも元気玉の超絶パワーの前にフリーザは散ったと思われた。しかし、歓喜に浸る悟空たちの前に再び姿を現すフリーザ！仲間たちはなす術もなく、次々と倒されてしまう。その時、限界を突破した怒りに震える悟空の体に、突如異変が起こり始める・・・！！

ついに超サイヤ人となった悟空。悟飯にピッコロを連れて地球へ帰るよう命ずると、驚愕パワーで怒涛の猛攻をフリーザにしかける。超サイヤ人相手でも勝てると踏んでいたフリーザだったが、指から発射した必殺の光線を次々とかわされてしまう。未だかつて経験したことのない脅威に、絶対的な自信も揺らぎ始め・・・。

悟空の猛攻に自尊心を傷つけられたフリーザは、ナメック星の破壊を決意。強大なエネルギー波を星の中枢へ撃ちこむ。しかし自爆を恐れパワーを抑制したため、星の爆発まで5分の余地を残してしまう。一方、宇宙船に辿り着いた悟飯は、地球へ戻るためブルマを探しに出発。そして悟空とフリーザの最後の闘いが始まった。

フリーザは30秒で悟空を倒すと豪語し、気を集中し始める。界王様はその隙をついて攻撃するよう悟空に勧めるが、フルパワーのフリーザを倒してクリリンの敵を討つのだと、その言葉を無視。悟空とフリーザの激闘が最高潮を迎え、ナメック星消滅の時は刻一刻と迫ってくる。ブルマは無事に救出できるのか・・・？

大地が割れ、消滅が迫るナメック星。その頃、地球ではミスター・ポポがドラゴンボールを集めていた。界王様の狙いはフリーザに殺されたナメック星人の復活、と同時にポルンガも復活させること。一方、悟飯たちの脱出まで時間稼ぎの闘いをする悟空だったが、悟飯とブルマが到着した宇宙船に思わぬトラブルが発生してしまう。

ナメック星の消滅まで3分を切った時、地球の神龍によって、フリーザに殺された者が蘇った。ナメック星の最長老も復活し、ポルンガが出現。皆の心に希望の光がさすものの、悟空がフリーザに痛恨の一撃を受けてしまう。父の気が消えたことを感知した悟飯は、引き止めようとするブルマに背を向けて宇宙船を飛び出す！

気をためなおして戻って来た悟空は、フリーザ以外の者のワープをポルンガに頼もうとする界王様に、自分も闘いに決着をつけるためナメック星に残ると宣言する。界王様は悩みぬいた末に了承、その願いはデンデによってポルンガに届けられた。そして消滅寸前のナメック星には悟空とフリーザのみが残された・・・。

ナメック星から地球にワープした者は、みな喜びに浸っていた。しかし悟空の状況を知り、不安を募らせる。ナメック星が消滅したら、悟空は生き延びることができないからだ。逆にベジータは自分が宇宙一になれると高笑い。悟空とフリーザの死闘は両者一歩も譲らぬまま、ついにタイムリミットまで1分を切り・・・！

力と力、誇りと誇りが激しくぶつかり合い、相譲らぬ戦いを続ける悟空とフリーザ。その頃地球では、ブルマが悟空の運命に不吉なものを感じていた・・・。そんなブルマの心配をよそに、悟空は次第にフリーザを圧倒！この世で誰も超えるはずのない自分を超える孫悟空の出現に、フリーザのとった恐るべき行動とは・・・！？

フリーザはフルパワーの反動によって気が減少、「たかがサイヤ人ごとき」に苦汁を嘗めさせられる。フリーザの渾身の一撃も、もはや悟空には通用しない。悟空の余裕の態度にフリーザは激昂、円盤状の気を放ち悟空を追いつめたかに思えたが、逆に自分の体を切断してしまう。命乞いをして、その命を繋ぎ止めたが・・・。

ナメック星のドラゴンボールなら、人間を何度も蘇らせることが可能だと知り、悟飯たちは歓喜の声を上げる。これで、クリリンと餃子を再び生き返らせることができるのだ。そしてナメック星では、悟空の圧勝でその死闘に終止符が打たれようとしていた。しかし立ち去る悟空の背後から、フリーザが最後の一撃を・・・。

フリーザに完全勝利した悟空に、猶予はなかった！ナメック星爆発のタイムリミットが刻一刻と迫っていたからだ。悟空はフリーザの宇宙船で脱出を試みるも、宇宙船は故障。フリーザを倒し宇宙最強の戦士となった悟空は為すすべもなく、銀河に一筋の閃光を放ったナメック星とともに消滅してしまうのだった・・・。

ドラゴンボールを使えば、悟空とクリリンを死んだ場所に蘇らせることは可能だ。しかし、ナメック星が存在しない今、2人が生き返る場所は宇宙空間。2人を蘇らせるという希望は、一瞬にして絶望にかわった。その時、ベジータは2人の魂を地球に呼びよせてから生き返らせればいいと提案。果たして、その結末は・・・！？

フリーザ戦から数ヶ月・・・。地球ではクリリンにガールフレンドができるなど、平穏な日々が続いていた。そんなある日、平和を脅かす不吉な影が天界に迫る。かつて、悟空たちがデッドゾーンに封じたガーリックJr.が復活したのだ。そして神様を小瓶に封じ、人間を魔族に変えるアクアミストを地球に流し始める。

アクアミストを吸うと魔族化し、ガーリックJr.のしもべとなってしまう。天界から地上へと流されたミストは、汚染範囲を広げてカメハウスを包み込み、ブルマやヤムチャたちまでもが魔族化してしまう。運良く吸わずにすんだ悟飯とクリリンは、ミストの効果を消す超神水を探しに天界へ向かうが・・・。

アクアミストを吸ってから24時間が経過すると、超神水でも元に戻すことはできない。悟飯の窮地に駆けつけたピッコロは、四天王と魔族化したヤムチャたちを1人でくい止め、そのスキに悟飯とクリリンを天界へ向かわせる。しかし、二人を天界で待ち構えていたのは、ヤムチャに噛みつかれて魔族化したピッコロだった。

悟飯によりデッドゾーンに封じられた過去をもつガーリックJr.は、恨みを晴らすため、四天王に悟飯を集中攻撃させ、徹底的にいたぶりつくす。かろうじて攻撃をかわし、致命傷を避ける悟飯だったが、四天王の1人ゾルドが一瞬の隙をつく。その時、自分を犠牲にして悟飯を守ったのはクリリンだった・・・。

完全にガーリックJr.のしもべとなってしまったのか、情け容赦のないピッコロの猛攻が悟飯を襲う！悟飯は尊敬するピッコロを攻撃することができず、防戦一方。さらに悟飯をかばい、クリリンまでもがピッコロに噛まれて魔族化してしまう。ひとり孤独な闘いを強いられることになった悟飯に、果たして勝機はあるのか？

夜が明ける前に全世界に超神水を流さなければ、アクアミストの効果を消すことはできない。残された時間で超神水を行き渡らせるためには、世界中の気流が集まる天界の底の穴から流すしか方法はない。しかし天界の底に行くためには、先代の神々が眠る墓がある、神仙界という危険な場所を通らなければならない・・・。

ミスター・ポポの案内で神仙界を訪れた神様は、先代の神々の攻撃を受けながらも、天界の底をめざす。一方、悟飯たちは、魔凶星の影響で何十倍もの力を得たガーリックJr.に苦戦。互角に渡り合っていたピッコロも、突如力が抜け体が半透明になってしまう。一心同体である神様が死ねばピッコロも・・・神様の身に危険が！？

悟飯はガーリックJr.に攻撃を仕掛けるが、永遠の命を得ている者を倒すことはできない。だが、先代の神々から攻撃を受けていた神様は、ミスター・ポポに超神水を託して天界の底から流させる。人々を魔族にし、世界を支配する計画を潰されたガーリックJr.は激怒。デッドゾーンを再び発生させる・・・。

デッドゾーンに対し、シールドを張ってピッコロとクリリンを守ろうとする悟飯。先代の神々から解放された神様とミスター・ポポを吸い込もうと、ガーリックJr.はデッドゾーンのパワーを上げる。だがその時、ピッコロとクリリンがシールドを飛び出した。その瞬間にできた一瞬の隙をつき、悟飯は全力で魔凶星を狙う！

平和に戻った世界。マロンの買い物につき合わされていたクリリンは、ウェディングドレスに憧れるマロンの姿を見て、プロポーズを決意する。1000歳の誕生日を迎えたウミガメから、伝説の真珠“マーメイドの涙”の話を聞いた彼は、悟飯と共に海底に向かう。しかし、マーメイドの涙は魚たちの大切な宝物だった・・・。

チチは悟飯に周災悪という家庭教師をつける。周は悟飯に体罰を与え、反抗的な態度を帰ってこない悟空のせいだと罵る。一方、宇宙から帰還したベジータは、ブルマに悟空が地球に戻る日まで一緒に暮らすよう提案され、渋々承諾・・・。そんなある日、悟飯は突然強大な力を感じて家を飛び出した。その気の正体とは・・・！？

悟飯をはじめ、巨大な気のもとに集結した戦士たちは、その気の正体がフリーザと知って絶望する・・・。着陸した宇宙船から現れたフリーザとコルド大王。サイボーグ化して生き長らえたフリーザは悟空への恨みを晴らすため、地球人を皆殺しにせよと部下に命令する。だが、彼らの前に突如謎の少年が立ち塞がった！

謎の少年は、フリーザの部下を次々と倒していく。余裕を見せるフリーザ親子に対し「超サイヤ人は孫悟空さんだけじゃない」と宣言するや、みずから超サイヤ人に変身した。その姿に悟空の姿を思い浮かべたフリーザは、怒りにまかせて、ナメック星を滅ぼした時の10倍ものエネルギーで攻撃を仕掛けるのだが・・・？

フリーザを一刀両断した謎の少年。その絶対的な強さに驚愕する悟飯たち。命乞いをするコルド大王にも冷静にとどめを刺した少年は、悟飯たちに悟空を迎えに行こうと誘う。戦闘時とはうって変わった穏やかな態度から少年を信用する一同。そして数時間後、少年の言葉どおり、悟空の乗ったカプセルが到着した・・・。

地球に到着した悟空に、少年は自分の正体を打ち明ける。トランクスと名のるその少年はベジータの息子で、3年後に現れる人造人間のことを警告するため約20年後の未来からやって来たというのだ。さらにトランクスは、自分の乗って来たタイムマシンは母親が作ったものだとも語る。悟空も驚くその母親の正体は・・・？

ナメック星爆発の瞬間、ギニュー特戦隊の乗って来たカプセルで脱出した悟空。不時着したヤードラット星の人々に救出され、新たな技を習得した彼は、それを披露する。未来を変えるため、3年後に現地での集合を誓い合う戦士たち。そんな中ブルマは、人造人間が作られる前にドクター・ゲロを倒すことを提案する。

戦士たちの修行は順調に続いていた。超サイヤ人となった悟空との力の差に憤るベジータは、ブリーフ博士に300Gの重力室を作らせ、修行を開始。激しい特訓の末に重力室を破壊し、大ケガを負って寝込んでしまった彼は、父と過ごした子供の頃の夢を見て、王子のプライドを再認識。悟空を超えるため、闘志を燃やす。

買い物帰りの山道で猪に襲われたチチは、楽しそうにエアカーを飛ばす夫婦の姿にフラストレーションを爆発させる！悟空とピッコロに免許を取れと命令するが、教習所でも意地を張り合う2人は、デッドヒートを繰り広げる始末・・・。そんなある日、雨の路上教習中に、幼稚園のバスが崖崩れに巻き込まれるのを目撃・・・。

修行を終え、約束の地点に集結した戦士。だが、トランクスの予告した10時間を過ぎても敵の気配は感じられない。その時、仙豆を届けて去っていったヤジロべーのスカイカーが突然爆発！ついに出現した人造人間たちは街に降りる。戦士たちは気配のない敵を探すのに戸惑うが、ついにヤムチャが人造人間を発見する・・・。

人造人間と対峙した悟空は、ヤムチャを傷つけ、無慈悲に街を破壊しつくす彼らの行為に激昂！闘いの場を他所に移し決着をつけようとする。そんな悟空に対し人造人間は「ドクター・ゲロは、悟空のこれまでの闘いを偵察したうえで自分たちを製造したため、自分らの実力は悟空を上回っている」と告げるが・・・。

超サイヤ人に変身した悟空の力は、人造人間たちの予想を遥かに上回っていた！あまりの強さに、驚きを隠せない人造人間たち。しかしピッコロは、超サイヤ人となった悟空のパワーが、以前ほどではないことに疑問と不安を抱く。そしてピッコロが懸念したとおり、闘いの趨勢は徐々に人造人間へと傾いていくのだった。

劣勢に立たされた悟空は仙豆を食べるが、一向に回復する気配がない。それもそのはず、悟空は心臓病に冒されていたのだ。それを知ったピッコロは悟空を助けに入るが、20号に妨害されてしまう。絶体絶命かと思われたその時、ベジータが現れ悟空を救出。だがピッコロは、ベジータでは19号を倒せないと危惧する・・・。

超サイヤ人として覚醒したベジータは19号を圧倒、たちまち破壊してみせる！その実力を目のあたりにした20号は、ベジータには勝てないと悟り逃走を始めた。しかし、追ってくるピッコロたちを目にした時、彼はある計画を画策する。ピッコロたちのエネルギーを吸収して自分の力にし、ベジータを倒そうというのだ。

気配がないという利点を活かし、ピッコロを襲撃してエネルギーを吸収する20号。しかし、悟飯のおかげで窮地を脱したピッコロは、逆に20号を圧倒していった。そこへ、以前に約束したとおりトランクスも未来から助力にかけつける。だが、19号や20号を見たトランクスは、驚愕の事実をベジータたちに告げたのだ・・・！！

ピッコロに追いつめられた20号だが、様子を見にやって来たブルマたちを襲撃し、その隙に研究所へと逃げ出す。残されたベジータたちは、トランクスとブルマから、20号がドクター・ゲロであることや、彼ら以外にも人造人間がいることを告げられる。それを知ったベジータは、嬉々としてドクター・ゲロの後を追うが・・・。

あくまでも人造人間17号＆18号との闘いを望むベジータに対し、その復活を阻止するよう説得をするトランクス。一方、ピッコロとクリリン、天津飯の3人は、手分けしてドクター・ゲロの研究所の捜索にあたる。だが、ドクター・ゲロの方がひと足早く研究所に戻り、ついに17号と18号を目覚めさせてしまうのだった！

17号と18号は、ドクター・ゲロを破壊し、残っていた人造人間16号をも目覚めさせてしまう。恐れていた事態の到来に、恐怖するトランクス。しかし3体の人造人間は、トランクスたちには目もくれず悟空の家を目指すのだった。そのことに自尊心を傷つけられたベジータは、トランクスの制止も聞かず、彼らの後を追う！

トランクスやピッコロの助力を頑なに拒むベジータは、単身18号に勝負を挑み、ほぼ互角の攻防をくり広げる。想像をはるかに越えるベジータの実力に、トランクスはもちろんのこと、さすがの17号たちも驚きを隠せない。しかし、無尽蔵のスタミナを有する18号に対し、ベジータの動きは下降線を辿る一方。そして・・・！

窮地のベジータを救出するため、18号に飛びかかるトランクス！だが、トランクスの攻撃は、軽く18号にかわされてしまう。ピッコロたちも、ベジータたちの救出に飛び出すが、今度は17号が18号のサポートにかけつけ、ピッコロたちを一蹴。そしてついに、ベジータも18号に完膚なきまでに叩きのめされてしまい・・・。

仙豆によって体力を回復したピッコロたちだが、人造人間のあまりの強さに愕然とする。プライドをズタズタにされたベジータは、復讐の誓いを胸にその場を立ち去ってしまった。一方ピッコロは、悟空を安全な場所に移すようクリリンに伝えると、自身はとある決意を固め、クリリンたちと別行動をとるのだった。

人造人間たちはトラックを強奪し、一路悟空の家を目指す。人造人間たちよりも早く悟空の家に到着したクリリンとトランクスは、意識のない悟空を飛行艇に乗せてカメハウスへと急行する。一方、人造人間に敗れたピッコロはさらなるパワーアップのため、神様と融合すべく天界におもむく。だが神様の反応は・・・？

トランクスは「パラレルワールド」の仕組みに隠された事実に気付く。たとえ悟空たちが人造人間を倒したとしても、トランクスのいた悲惨な未来は変わらないのだ。未来のブルマは、もうひとつの平和な未来があってもいいと考え、タイムマシンを作ったのだ。しかし、もう一台のタイムマシンの存在が明らかとなり・・・。

謎のタイムマシンの存在を知ったトランクスたちは、とある場所でその発見に成功する。トランクスより1年も早く現代に到着していた、古びたタイムマシンの中には不気味な卵の殻が。さらにその近くには、奇妙な生物の抜け殻が発見された。言い知れぬ恐怖に震えるトランクスたち。このタイムマシンの持ち主は・・・！？

ジンジャータウンという町の人々が、忽然と姿を消してしまう。町はタイムマシンの発見現場からほど近い場所にあった。天界からこの様子を見ていた神様は町を襲った怪物の姿を目の当たりにし、ピッコロとの融合を決意する。融合の末ついに誕生した新ピッコロは、ジンジャータウンに急行し、怪物を発見する。

悟空やフリーザとそっくりな気を持つ怪物・セルが、ピッコロの前に現れた。未知の敵と対峙するピッコロ。セルはそれをあざ笑うかのように、ピッコロの必殺技である魔貫光殺砲を繰り出した。動揺を隠せないピッコロにとどめを刺すべく、つづいてセルは、かめはめ波のポーズをとる。恐るべき怪物の正体は一体・・・？

悟空の必殺技であるかめはめ波を、いともたやすく放つセル。ピッコロは間一髪で避けたものの、セルにつかまり左腕の生体エキスを吸収されてしまう。冥土のみやげにと自らの生い立ちを語るセルだったが、それは正体を聞き出すためのピッコロの罠であった。すぐさま左腕を再生したピッコロは、再びセルに挑む！

セルを倒すべくパワーを全開にするピッコロのもとに、クリリン、トランクスが合流。未熟な体で3人に勝つことは難しいと悟ったセルは、ひとまずその場から逃亡する。やがてベジータもピッコロたちの前に現れるが、セルを逃がしたピッコロへの怒りを露にする。気を消し移動するセルを見つけることはできるのか！？

自分たちの状況が変わらないことを知りながらも、生まれたばかりのセルを消し去るため、未来の世界へと向かったクリリンとトランクス。2人はドクター・ゲロの研究所で幼体のセルを発見し、建物もろとも破壊する。その際、研究所で手に入れた17号の設計図を元に、ブルマは人造人間たちの弱点を調べ始める。

生体エキスを求め、人々を襲い続けるセルがバジルタウンに現れた。偶然通りかかったクリリンがセルに挑むも、返り討ちにあってしまう。絶体絶命かと思われたその時、ピッコロと天津飯がクリリンを救出！そしてカメハウスではついに悟空が眠りからさめ、超サイヤ人をさらに超えるという一大決心をしていた。

悟空、悟飯、ベジータ、トランクスの4人は、1日で1年分の時が過ぎる、精神と時の部屋での修行を決める。圧倒的な“無”の空間を初めて体感し、不安を覚えるトランクス。一方、人造人間たちは悟空を追い、悟空の家からカメハウスへと移動する。そこで出迎えたピッコロたちと、再び一戦交えることになるが・・・。

悟空を探し、カメハウスへと現れた人造人間16号、17号、18号の三体。しかし、神の神殿で修行中の悟空はもちろんいない。神と合体しパワーアップしたピッコロは人造人間を誘い出し、無人島で17号と闘い始めるのだった。17号と戦うピッコロの強大なパワーが、人造人間を探すセルに感知されてしまう・・・！！

地球を救う一筋の希望、人造人間の緊急停止コントローラーをブルマは完成させていた。カメハウスへと急ぐブルマ。いまだ続いているピッコロと17号の想像を絶する闘いは、徐々に17号有利へと傾いていた。パワーを使う度にどんどんスタミナを消費してゆくピッコロに対し、人造人間は全く疲れを知らないのだ！！

ついに、闘いを続ける17号とピッコロの前にセルが姿を現した。セルの圧倒的なパワーを前に、立ちすくむピッコロ・・・。17号、18号を急襲して完全体になるため、セルは彼らに襲いかかる！！完全体になられてしまうと、手の打ちようがない！ピッコロは決死の覚悟でセルに挑むが、ダメージすら与えることができない・・・。

ピッコロを難なく倒したセルは、17号を吸収せんと容赦ない攻撃を始める。セルの超パワーの前には、17号のパワーも全く歯が立たない。大きく口を開けた不気味な尾に吸収されるかと思われた瞬間、これまでは、闘うそぶりを見せなかった16号が動いた。「闘う時がきたのだ・・・」と、セルを阻止すべく立ち上がった！

16号の必殺技ヘルズフラッシュがセルに炸裂。セルと互角のそのパワーに、誰もが希望を抱き始める。だが隙をつき、セルは17号の吸収に成功！ついに変態し始めるセル。18号を連れ、その場を逃げ出そうとする16号。だがパワーアップを果たしたセルが16号たちに迫る！とうとう18号も吸収されてしまうのか！？

後ろに迫るセルを足止めし、18号を逃がすため、命の危険も顧みず天津飯は新気功砲を連発する。なんとか18号と16号を逃がすことには成功するが、天津飯の命はもはや風前の灯火。そして、倒れた天津飯をセルが光弾で消し去ろうとした、まさにその時、神の神殿から瞬間移動で現れた悟空がセルの前に立ちはだかる！

ついに精神と時の部屋での修行を終えた、ベジータとトランクス親子。彼らはすぐさま、セルを倒すために神の神殿から飛び立った！一方、セルの猛攻から身を隠す16号と18号のもとへ、セルの魔の手が近づいていく・・・。そして神の神殿では、悟空と悟飯が、精神と時の部屋での修行をスタートさせようとしていた。

18号を吸収して完全体となるため、無人島に隠れている16号と18号に迫るセル。ついにセルは完全体になってしまうのか、と思われてその時、パワーアップを果たしたベジータが到着！金色に輝く超サイヤ人へと変身したベジータは、セルに対し容赦ない攻撃を見舞うのだった。ベジータの超パワーが、セルを圧倒！！

精神と時の部屋での修行により、ベジータは第2形態となったセルをも上回るほどのパワーを手にしていた。パワー全開で戦うセルも、パワーアップした「超ベジータ」の前では子ども扱い。そして、ブルマが作った人造人間緊急停止コントローラーを持つクリリンが、セルとベジータが対決する島へと到着するのだった。

セルが全力を込めた光弾も、超ベジータにはかすり傷ひとつ負わすことはできない。トランクス、クリリン、16号、18号が見守るなか、セルを追いつめていくベジータ。歴然たる力の差にセルを殺す価値もない存在とベジータが感じ始めたその時、挑発するようにセルが放つ危険な誘惑。「完全体になりさえすれば！！」

完全体になることができれば負けないというセルの言葉に、ベジータのプライドが反応する。より強いものと闘いたいというサイヤ人の本能によりベジータは完全体セルとの闘いを選んだのだ。そしてトランクスの制止も聞かず、セルを逃がしてしまう。ベジータの猛攻から逃れたセルの視界に、探し求めていた18号が！

セルは完全体へと進化するために、18号に襲いかかる。それを阻止しようとするトランクスだったが、その前に立ちはだかったのはなんとベジータだった！完全体へのパワーアップをくい止めるため、トランクスは父ベジータへと攻撃を加える。その隙をついたセルは太陽拳を目くらましに、ついに18号を吸収する！！

トランクスたちの隙をつき18号を吸収したセルは、巨大な光のたまに包まれていく。カメハウスや神の神殿、全世界にその衝撃が伝わる。爆煙の中から現れた完全体セルに対し、クリリンとトランクスは攻撃を仕掛けるが・・・！？その頃、精神と時の部屋で修行を続けていた悟飯が、苦労の末に超サイヤ人への変身に成功する！

完全体セルの一撃で、クリリンはいとも簡単に倒されてしまった。そしてついに超ベジータがセルに挑みかかる。セルに対して、強烈な攻撃を連発するベジータ！だがセルは、全く本気を出していなかったのだ・・・。ベジータは全力を込めたキックをセルに見舞うが、セルにダメージを与えることはできないのだった。

セルの本気の一撃によって、大ダメージを受けるベジータ！セルの実力に驚愕するベジータだったが、全身全霊を込めたファイナルフラッシュにより、セルの上半身を吹き飛ばす！　だが、たやすく再生したセルの攻撃により、ベジータは失神。父に代わり、ついにパワーを解放したトランクスがセルに挑みかかる！！

髪の毛が逆立ち、全身もひとまわり大きくなった超トランクスが、セルとの闘いをスタートさせた。だが、トランクスはセルの攻撃を受け続けているばかり・・・。それは、セルを自分にひきつけクリリンがベジータを救出する作戦だったのだ。クリリンが無事逃げたことを確認すると、トランクスはさらに気を高めていく！

気を上昇させ、全身の筋肉を増大させていくトランクスは、セルと対峙しながら地獄のような未来のことを思い出していた。人間を無差別に襲う17号と18号。悟飯らZ戦士は次々殺され、残った戦士はトランクスだけとなってしまった。そんな未来がくるのを防ぐためにも、トランクスはセルを倒さなければならない！

超トランクスはセルを上回る気で、攻撃を始める。だが余裕の表情で、それを交わしていくセル。パワーばかりをアップさせたトランクスは、セルのスピードについていけなくなっていたのだ。セルにそのことを指摘され、敗北を認めてしまうトランクス・・・。だが究極の闘いを楽しむため、セルは武道会の開催を提案する。

10日後に、セルと武道家たちが闘う新天下一武道科意を開催することを宣言し、セルはトランクスの元から飛び去った。それを聞いていた人造人間16号は、セルゲームへの参加を希望。カプセルコーポレーションで身体の修理をすることになる。そしてセルは、誰もいない荒野に武道会用の武舞台を作りあげるのだった。

テレビ局を襲撃したセルは、全世界へ向けてセルゲームの開催を宣言する放送を始めた。挑戦者たちとセルが闘い、誰もセルを倒すことができなかったら人間すべてを殺すというのだ！ベジータとトランクスはセルゲームに勝つため、悟空たちの後に、再び精神と時の部屋に入り修行をすることを決意するのだった。

全世界はセルの放送によりパニックに陥る。そんななか、セルゲームに向け戦士たちの準備が始まった。16号の修理をするブルマ。神の神殿で、悟空親子を待つベジータ親子。そしてついに、悟空と悟飯が精神と時の部屋での修行を終える！だがセルゲーム開催を知った悟空は、残りの時間を下界で過ごすと言うのだった。

まだ1日入ることができるのに、精神と時の部屋での修行をしないと言う悟空を、不思議な顔で見送るベジータとトランクス。悟空は悟飯と共に、チチと牛魔王の待つ我が家に帰るのだった。残りの時間を修行せずに過ごすという悟空を不思議がるクリリンをしり目に、悟空と悟飯はのんびり釣りなどの遊びに明け暮れる。

買い物の途中で、チャズケ村の老人ラオと少女ライムに出会った悟飯、チャズケ村では顔役のバーボンが村人を強制労働させて、セルからの避難ドームを作らせていた。バーボンに逆らうラオの前に殺し屋桃白白が現れる。しかし、悟飯が悟空の息子だと知り桃白白は逃走。バーボンの野望は、悟飯の前に潰えるのだった。

セルゲームまであと8日。精神と時の部屋で11歳になっていた悟飯の誕生会を開こうとするチチは、アルバムを発見し悟飯と名づけた日を思い出していた。悟空もまた、生まれたばかりの悟飯が自らの危機をすさまじい気で回避していたことを思い出す。そして夜になり、牛魔王やクリリンも参加して悟飯の誕生会が開かれた。

修行を終えたピッコロと入れ替わりに、精神と時の部屋へ入ってゆくベジータ。セルゲームに臨む戦士たちの準備は着々と進んでいた。その一方で、王立防衛軍はセルに総攻撃をかけるが、逆に全滅してしまう。それを見た悟空はセルに殺された人を生き返らせるため、新しい神様によるドラゴンボール復活を思いつく。

界王の協力で、ナメック星人の気を捉えることができた悟空は、新しいナメック星へ瞬間移動。最長老の推薦で、デンデを地球の神様として連れ帰った。優秀な龍族、デンデの力によりドラゴンボールを復活させることに成功！その頃地上では、格闘技世界チャンピオンのサタンが、セルゲームへの参加を宣言していた。

ベジータが修行を終え、サタンがＴＶでセルを倒すことを宣言する中、復活したドラゴンボールをドラゴンレーダーで探し始める悟空。なんと2つのドラゴンボールを、悟空より先に手にしていたのは桃白白だった。だが桃白白は悟空の出現に驚き、またもすぐ降参。ドラゴンボールは7つすべてが悟空の手に集まった。

ついにセルゲーム開催の日がやってきた。会場に真っ先に到着したのは、サタンとTVの中継スタッフ。サタンがセルを挑発するなか、悟空、悟飯を始めとするＺ戦士が続々集結！まず悟空が闘おうとするが、未だにセルの実力に気付いていないサタンに止められてしまう。最初に、サタンが闘うというのだが・・・！

セルの攻撃をトリックだと信じているサタンは闘う気満々。だがそのとき、上空にヘリコプターが飛来し、サタンの弟子、ピロシキとカロニーが飛び降りてきた！ 師匠であるサタンの前に、自分たちが闘おうというのだ・・・。セルに簡単にあしらわれる2人。ついにサタンも闘いを挑むが、あっさり払い飛ばされてしまう・・・。

いよいよZ戦士が登場し、セルゲーム本番開始。なんと悟空は、最初の挑戦者を志願。セルとの闘いが始まった。瞬時に移動し壮絶な闘いを繰り広げる2人の姿を、サタンはトリックだと言い放つ・・・！！ だが、まだまだ悟空もセルも本気で闘ってはいなかったのだ。そして、ついに悟空が100％の力でセルに挑みかかる！

セルの要求により、フルパワーで挑む悟空。セルも、100％の力で応戦。巨大な力と力が真っ向から激突する。天津飯の四身の拳やピッコロの魔貫光殺砲などで攻撃するセル。さらに、超パワーのかめはめ波で悟空を地球もろとも吹き飛ばそうとする。危険を察知した悟空は上空に瞬間移動。自分を標的にさせて地球を救う。

互角の戦いを続ける悟空とセル。場外負けなど無意味だというセルは、武舞台を吹き飛ばしてしまう。倒すか倒されるかの本気の闘いの幕が切っておとされた。セルに向かい、上空から超特大かめはめ波を撃つと見せかけた悟空は、発射直前にセルの前へと瞬間移動！特大かめはめ波が、至近距離からセルを直撃する！！

悟空、渾身のかめはめ波が、セルの上半身を吹き飛ばした！だが上半身が消滅したにも関わらず、細胞を再生させ復活するセル！死闘を再開する悟空だったが、まだまだ気も十分で余裕のあるセルに対し、全力で闘い続けた悟空には徐々に疲れが見え始めていた。そして悟空は、突如セルに対して降参を宣言する！！

降参してしまった悟空に、驚くZ戦士たち。だが悟空は、セルより強い戦士として、次の挑戦者に悟飯を指名する。セルとの闘いをためらう悟飯。信じられないことに悟空はセルに仙豆を与え、そのパワーを回復させる。ついに、パワーを完全回復したセルと、悟空が最強と認めた悟飯との地球を賭けた決戦が始まる！

セルの攻撃の前に、手を出さずに耐え続ける悟飯。悟飯は闘いの最中、セルに対し降参を勧める。自分の秘めたパワーによってお前を殺したくない、そうセルを説得する悟飯に対し、セルは容赦ない攻撃を加え続ける。そしてついに、悟飯はセルに対して一撃を放つ。その攻撃の威力に、セルは不気味な笑いを浮かべた・・・。

セルがいくら攻め続けても、悟飯は本気で闘おうとはしない。セルの虚をついた16号が、セルをはがい締めにし自爆しようとした。だが自爆装置はブルマに取り除かれていた・・・。16号を破壊したセルは、戦意のない悟飯が闘わざるを得なくするため、セルジュニアを生み出し闘いを見守るZ戦士たちを襲わせるのだった！

セルジュニアの猛攻に苦しめられるZ戦士たち。ただ立ちつくすのみの悟飯。頭だけで転がっていた16号の頼みで、サタンは16号を悟飯の前に投げた。「悟飯、俺の好きだった自然や動物たちを守ってやってくれ。」そう語りかける16号は無惨にもセルに踏みつぶされてしまう。その瞬間、悟飯の怒りは限界を超えた！

セルの思惑通り、悟飯のパワーが臨界点に！そして悟飯はセルから仙豆を奪い、Z戦士たちのもとに向かうと、悟空ですら苦戦したセルジュニアを一撃で葬り去ってしまう。次々とセルジュニアを倒し、全滅させた悟飯を満足そうに見守る悟空。対照的にセルは怒りの表情で悟飯を見ていた。いよいよ最終決戦が始まる！

悟飯とセルが、フルパワーで激突する最後の闘いが始まった！ 悟飯のスピードについてゆけず、攻撃をすべて避けられてしまうセル。焦ったセルはフルパワーのパンチを悟飯に見舞う。だが悟飯はセルのパンチに耐えてみせ、逆にパンチを叩き込んだ・・・。たった2発のパンチで、セルは地面にひざまずくのだった！

セルを圧倒し始める悟飯。セルの多彩な技も、悟飯には全く通じない。ついにセルは、地球をも破壊するほどの超かめはめ波を上空から悟飯に撃つ！だが、悟飯の超かめはめ波に押し返されてしまう！ 手足を失い再生したセルだったが、絶え間ない悟飯の猛攻に耐えきれず、ついに口から18号を吐き出してしまう・・・。

18号を吐き出し、セルは第2形態へと戻ってしまった。悟飯には敵わないと悟ったセルは、身体を膨らませ、地球と全人類を道連れにしようととする！全員が死を覚悟した瞬間、悟空が動いた！「バイバイ、みんな。」悟空は自爆するセルと共に界王星へと瞬間移動。悟空の犠牲により、地球は救われたかに見えた。

残された核から再生し、パワーアップして復活したセルは、地球に戻り、トランクスをたった一撃で倒す。最愛の息子の死に我を忘れ、セルに襲いかかるベジータだったが、難なくあしらわれる。死を覚悟したベジータを悟飯が救出するが、左腕を負傷・・・。それを見たセルは、チャンスとばかりに容赦なく襲いかかる！

完全体を遥かに上回るパワーに、セル自身も驚き、喜んでいた。セルはすべてに終止符を打つために、太陽系ごと吹き飛ばせるほどの気をため、超巨大かめはめ波を撃とうとする。すさまじい気に圧倒される悟飯の頭に、界王の助けを借りた悟空の声が響く。その声に励まされた悟飯は、超かめはめ波で対抗するのだった。

セルと悟飯が同時に放った超巨大かめはめ波が激しくぶつかり合う！パワーがほぼ互角のため、2人の間でせめぎあうエネルギー。悟空の励ましに加え、ベジータやピッコロ、天津飯らZ戦士の加勢を受け、悟飯はすべての力を絞り出し、ついにセルを消滅させる！その隣には、まるで悟空がいるかのようだった。

闘いはついに終焉を迎えた。力を出し尽くし立つこともできない悟飯だったが、その笑顔には満足そうな笑みが浮かぶ。そしてZ戦士たちは、セルに殺された人々を復活させるため神の神殿へ向かう。神龍の力で人々は復活。だが、悟空は、あの世で修行するために、復活させないで欲しいというメッセージを送ってきた。

悟空は閻魔大王のはからいにより、肉体を持ったままあの世に行き、修行をするというのだった。神龍の2つの目の願いで、クリリンの望みを叶え、17号と18号の体内にある爆弾を消し去った。その翌日、未来へ帰るトランクスを見送るため、カプセルコーポレーションに悟飯、クリリン、ヤムチャらZ戦士が集まった。

人造人間に蹂躙される未来に戻ったトランクスは、母ブルマと再会、そして17号と18号を難なく撃破する。かつては適わなかった相手であったが、過去における修行で、とてつもなくパワーアップしていたトランクスの敵ではなかったのだ。数ヵ月後、トランクスはタイムマシンを狙うセルをも簡単に消滅させるのだった。

あの世で一番強いという大界王に修行してもらうため、界王と共に大界王星へとやってきた悟空は、大界王の城の前で、西の銀河の達人・パイクーハンと出会う。あの世の武道家のレベルの高さを見た悟空は、やる気十分。大界王の依頼で、地獄で暴れているセルを退治に行くパイクーハンと共に、悟空は地獄へと向かう。

東西南北の銀河の強者たちが集まる、あの世一武道会が開催されることとなった。優勝者は、大界王の修行が受けられると聞いた語空もなんとか出場権を手に入れる。悟空の最初の対戦相手は、たくさんの手足を持つ強敵、南の銀河代表のキャタピー。悟空に圧倒され、パワーアップのためサナギになるキャタピーだが・・・！？

1回戦を勝ち抜いた悟空の次の相手は、東の銀河代表のアークア。弱そうに見えたアークアだが、どこでも水中にしてしまう超能力を持っていた！武舞台の上を覆ったに水の中で闘うことになり、魚のような動きのアークアに苦戦する悟空。一方、パイクーハンは、北の銀河代表のオリブーを倒し、順調に勝ち進んでいた。

悟空は西の銀河代表のマーライコーを倒し、決勝へと駒を進める。決勝戦の対戦相手は、やはりパイクーハン。北の界王と西の界王の声援を受け、悟空とパイクーハンの決勝戦が始まった！　お互いの実力を探りつつ闘う2人。ついに悟空は超サイヤ人となり、パイクーハンも道着を脱ぎ捨て、本気の決勝戦がスタートする！！

超サイヤ人悟空と、重い道着を脱ぎ捨て身軽になったパイクーハンは、互角に闘いを続けていた。闘いの場は宇宙にまで広がり、両者まったく譲らず宇宙の果てまで必殺技の応酬が続いた。ついに悟空のかめはめ波がパイクーハンを捕らえ、闘いに決着をつけた！しかし、大界王の判定により、2人とも場外で失格に・・・。

セルとの死闘から7年が過ぎ、悟飯も高校に入学。サタンシティの学校に通うことに。だが、正義感あふれる悟飯は、登校途中に超サイヤ人の姿で銀行強盗を退治してしまい「金色の戦士」は街の噂になってしまう。さらに、普通の高校生として学生生活を送りたいとの思いもむなしく、うっかり体育の授業で大活躍・・・。

なんとかして自分の正体を隠したまま正義のヒーローを続けたい悟飯は、ブルマに相談。トランクスと遊んでいる間に作ってもらった変身アイテムで、ヒーローに変身できるようになった悟飯は大喜び！さっそくバスジャック事件を解決し、とっさに「グレートサイヤマン」と名乗った悟飯の、ヒーロー・ライフが始まる。

グレートサイヤマンの正体を、エンジェラという少女に見られてしまった！？秘密をバラすと言われ、仕方なく彼女とデートをする悟飯。だが、初デートに悪戦苦闘。さらに、デート中も事件が発生する！エンジェラの目を盗み、グレートサイヤマンに変身、見事に事件を解決した悟飯。実はエンジェラが見たのは・・・。

悪党グループ・レッドシャーク団が起こした騒ぎに駆けつけたビーデルは、ボスと闘うことになってしまう。苦戦するビーデルを助けに行きたい悟飯だが、なかなか授業を抜け出せずにイライラ・・・。なんと悟飯の貧乏ゆすりで地震が起き、その隙に悟飯はビーデルのもとへ駆けつける。しかし、その時すでにビーデルは・・・。

怪獣トトの子供チビが、サーカス団に捕まり見せ物にされてしまった。悟飯はグレートサイヤマンに変身しチビを助け出すが、泥棒として追われてしまう。チビを奪い返そうとビーデルが登場、グレートサイヤマンこと悟飯は大ピンチに！誤解も解け、一件落着かと思われたその瞬間、グレートサイヤマンの正体が・・・！

グレートサイヤマンの正体を知ったビーデルは、一緒に天下一武道会へ参加することを約束させる。それを聞いたベジータも、武道会参加を表明。さらに悟空も、あの世から1日だけ戻ってきて、参加するという！　悟空との再会を喜ぶ悟飯はクリリンやピッコロにも参加を勧め、大会へ向け久しぶりの修行を開始する。

あの世では悟空、地球ではベジータたちZ戦士が修行に励み、悟飯は弟の悟天と一緒に修行していた。まだまだ幼い悟天だが、悟飯の知らない間に、なんと超サイヤ人に変身できるようになっていた・・・。そこにビーデルが突然押しかけてきて、約束通り空を飛ぶ方法を教えることに・・・。自分の修行ができず焦る悟飯・・・。

ビーデル、そして超サイヤ人にはなれるが空は飛べない悟天に、舞空術を教えなければならず、悟飯の修行は全く進まない。その頃、カプセルコーポレーションで特訓中のベジータ目の前で、トランクスが超サイヤ人に変身！その潜在能力に高さに驚くベジータ。天下一武道会は、もうすぐそこまで近づいていた。

ビーデルは、ようやく舞空術をマスター。そして、天下一武道会開催の日がやってきた。にぎやかな会場に、悟飯、ピッコロ、ベジータらZ戦士たちが、続々と集まってくる。懐かしい仲間との再会を喜ぶみんなのもとへ、頭の上に「わっか」をつけたまま、占いパパに連れられた悟空が1日だけあの世から帰ってきた！

ビーデルと悟飯のクラスメートたちが武道会の応援に駆けつけた。その1人シャブナーは、グレートサイヤマンの正体を明らかにするため、素顔をカメラに収めようとするが、企みはことごとく失敗！そんななか、天下一武道会大人の部の予選が始まり、Z戦士たちはパンチングマシーンで驚異の高得点を連発する！

大人の部に先がけて、トランクスと悟天も参加している天下一武道会少年の部がいよいよスタート。だがその前に、とっておきのイベントが用意されていた。それは、サタンがセルを倒したシーンを再現した映画だった。大興奮する観客たち。あまりのお粗末さに、あきれるZ戦士・・・。そしてトランクスの試合が始まった。

トランクスに続いて、今度は悟天が登場。ちょっぴり緊張する悟天だが、トランクスと同じようにあっさりと勝利。当然のことだが、2人とも順調に勝ち進み、決勝戦は、トランクスと悟天の対決となった。ついにスタートした決勝戦で、子供とは思えないすさまじい闘いを繰り広げる2人に、観客たちは驚愕する・・・！

少年の部優勝を賭けた、トランクスと悟天の闘いは続く。気で攻撃するトランクスに、悟天もかめはめ波ならぬ「かめかめ波」で対抗！闘いに熱中した悟天とトランクスは、ついに超サイヤ人に変身！セルとの闘いで見た金色の戦士に似た姿に、サタンは驚く。激しいバトルは、ほんのわずかの差が勝敗を分けた・・・。

少年の部優勝者のトランクスは、エキシビョンマッチとしてサタンと闘うことに！だが、決勝戦での闘いぶりを見たサタンは、トランクスにビビり、軽く殴らせてうまく負けようとするが、トランクスの「軽い」一撃がもろに顔面にヒット！その頃、予選を勝ち抜いた悟空たちは、謎の選手シンとキビトに出会う。

子供の部は終了したが、本当は大人の部で闘いたかったトランクスと悟天は、マイティマスクを襲撃。肩車して奪ったマスクをかぶり、こっそり大人の部に出場する。トーナメントのくじ引きで互いに顔を合わせる選手たち。シンにスポポビッチ・・・、いわくありげな出場者が集まった天下一武道会大人の部、ついに開催！

大人の部、第1試合はクリリン対プンター。観客たちは、巨体を誇るプンターの勝利を確信したが、クリリンは余裕の一撃で勝負を決める。続く第2試合、ピッコロの対戦相手は、謎の男シン。神と融合したものだけにわかる直感で正体を察したピッコロは、闘いが始まらないうちに自ら棄権してしまう。シンの正体は！？

シンが界王神であると知り、驚愕するピッコロ。そして第3試合は、ビーデル対スポポビッチ。彼は、前回の大会でサタンに敗れた時とは、性格だけでなく、強さまで別人のように変わっていた。ビーデルの猛攻撃も効果がなく、何度でも立ち上がってくる・・・。焦ったビーデルは、スポポビッチの首を折ってしまった！

首が折れても闘い続けるスポポビッチに、さらに攻撃を続けるビーデルだが、倒れる素振りもない。疲れが出始めたビーデルを、スポポビッチの容赦ない攻撃が襲う！全く抵抗できない相手に容赦なく攻撃を続ける非道な闘いを、超サイヤ人となった悟飯が止めようとしたその瞬間！ スポポビッチの仲間ヤムーが・・・。

大怪我をした娘を心配するサタンのもとに悟飯が現れ、ビーデルに仙豆を与えて回復させる。そして第4回戦を闘うために急いで武舞台に向かった悟飯だが、グレートサイヤマンの正体がバレてしまう。クラスメートの声援のなかで、悟飯とキビトの闘いがスタート。激しい闘いのなかで、キビトが悟飯の耳元で囁く・・・。

キビトに言われた通りに超サイヤ人となった悟飯を、ヤムーとスポポビッチが襲う！界王神に金縛りをかけられて動けなくなった悟飯に、2人は謎の器具を突き刺し、悟飯のエネルギーを吸収して逃亡。力の抜けた様子で武舞台に横たわる悟飯。なぜ界王神は、悟飯を襲わせたのか？　そして、2人の行動の目的は・・・！？

スポポビッチとヤムーの後を追う悟空たちは、界王神から魔人ブウ復活を企む魔導師バビディの存在を聞く。復活には強力なエネルギーが必要で、悟飯のエネルギーもそのために使われるのだ。ついにバビディの本拠地である宇宙船を突き止め、岩陰に隠れて様子をうかがう悟空たち・・・。そこに、バビディが姿を現した！

悟空たちの存在に気付き襲いかかる魔王ダーブラ。キビトが倒され、クリリンとピッコロは石にされてしまう！だがダーブラは、それ以上は攻撃せず、余裕の笑みを浮かべ宇宙船の中へ立ち去った。バビディの野望を阻止し、ピッコロたちを助けるため、悟空、悟飯、ベジータ、界王神の4人は宇宙船へと潜入する・・・。

宇宙船にある格闘場・バトルステージ1ではバビディ配下の戦士・プイプイとベジータのバトルが続く。実力の違いを見せつけ、優勢なベジータ。見かねたバビディは、ステージをプイプイの得意とする重力10倍の惑星ズンに変えてしまう。10倍の重力でも自在に動けるプイプイの攻撃に、果たしてベジータの運命は・・・！？

続くバトルステージ2で、魔獣ヤコンと悟空の闘いが始まる。ふがいないヤコンの闘いぶりを見たバビディは、ステージをヤコンの生まれた光のない暗黒星へと変える。超サイヤ人となった悟空の光が、暗黒に潜むヤコンを照らし出す！しかし、ヤコンは光をエネルギーとして食べてしまう性質を持っていたのだった！

バビディの宇宙船での闘いは続いていた。そんななか、武道会会場では出場者の大半が棄権してしまったため、決勝トーナメントをバトルロイヤルに変更することになる。18号、そしてマイティマスクとトランクス＆悟天は、あっという間にサタン以外の出場者を場外負けにすると、サタンを無視して激突を開始する！

18号とマイティマスク、そして闘いについていけないサタンによる、おかしな決勝バトルロイヤルは続いていた。闘い慣れた18号をなかなか倒せないトランクスと悟天は、一気に決着をつけようと超サイヤ人に変身し、強烈な攻撃でスパートをかける。だが、2人の変装に気付いた18号が、気円斬でマントを一刀両断！

マイティマスクの失格で、天下一武道会・決勝バトルロイヤルは、18号とサタンの一騎打ちとなる。18号はサタンをはがい締めにすると、なにやら耳打ちを始める・・・。時を同じくして、バビディの宇宙船では、バトルステージ3に魔界の王ダーブラが登場。石にされたクリリンたちを元に戻すため、悟飯が立ち上がる！

悟飯とダーブラの一騎打ちが始まった！闘い慣れていない悟飯は、パワーでは明らかに劣る相手に意外な苦戦をしてしまう。ふがいない闘いぶりにイラつくベジータを見たダーブラは、なぜか闘いを放棄して引き上げてしまう・・・。どうやら邪心を持つ相手を下僕にできるバビディの力を使い、何かを企んでいる様子・・・！？

バビディが水晶玉に呪文を唱えると、突然ベジータが、頭を抱え苦しみ始めた！額にMの文字が現れたかと思うと、いきなり悟空に対し攻撃を始めるベジータ。悟空と闘いたいという邪心を見抜いたバビディは、彼らを天下一武道会会場に移動させてしまう。満員の観客席を、ベジータの発する巨大エネルギー弾が襲う！！

ベジータは悟空と闘いたいという秘めた欲望のために、わざとバビディの魔法にかかったのだった。それを聞いた悟空は、ベジータと1対1の勝負をすることを決意する。闘いの舞台を誰もいない荒野に移し、2人のサイヤ人の決闘が始まった。その頃悟飯と界王神は、ブウ復活を阻止せんとバビディのもとへ急いでいた。

ついに悟空とベジータ、サイヤ人同士の闘いが始まった！バビディの思惑通りに、壮絶な死闘を繰り広げられていく・・・。ブウ復活に必要なエネルギーを溜めるため、バビディは2人を闘わせたのだ！見る見るうちに、エネルギーのゲージが上がってゆく・・・。果たして、恐怖の魔人ブウはこのまま復活してしまうのか！？

悟空とベジータの地球を揺るがす闘いは続き、魔人復活に必要なエネルギーが溜まりつつあった。復活を阻止すべく、悟飯と界王神がバビディとダーブラへ攻撃を仕掛けた、ちょうどその瞬間、ついにエネルギーが満タンに！するとブウが封印されているという球から、すさまじい勢いで真っ白な煙が吹き出し始めた！！

絶対に魔人ブウを復活させてはならない！怪しげな煙を吹き出し始めた球に、全身全霊を込めたかめはめ波を撃ち込み続ける悟飯。その攻撃により、ブウの球は2つに割れてしまうが、なんとその中は空だった！驚く界王神、そしてバビディの見守るなか、吹き出した煙が上空で集まり始め、人間の姿になっていく・・・。

復活したブウは、あまり凶悪に見えず、バビディの言うことにも、全く耳を貸そうとしない。だが、自分をバカにしたダーブラを、いとも簡単にやっつけてしまった！その頃、遥か彼方の荒野では、ブウの復活に気付いた悟空とベジータが、闘いを中止する。悟空の隙をつき気絶させたベジータは、ひとり飛び立つ・・・。

ブウに攻撃を仕掛ける悟飯と界王神だが、2人がかりでも全く歯が立たない。そして、界王神が死を覚悟した瞬間、ダーブラの放った槍がブウの腹を貫いた！裏切られる前に倒すべきだと考えたダーブラは、ブウと闘い始める。ちょうどその頃、武道会会場を抜き出したトランクスと悟天は、バビディの宇宙船を発見！

怒ったブウは、なんとダーブラをクッキーにして食べてしまった！あまりのことに唖然とする一同・・・。だが、ダーブラが死んでしまったため、石にされていたクリリンとピッコロが復活を果たす。ブウの強さに、またもピンチを迎える悟飯と界王神であったが、その時、バビディの宇宙船がいきなり大爆発を起こした！！

破壊王子ベジータと、ブウとの闘いが始まった！腹に穴を空けられても、全くダメージを受けないブウに、ベジータはこれまでにない苦戦を強いられる。ちぎった自分の体を使い、相手をぐるぐる巻きにして攻撃するブウの奇想天外な作戦に、ベジータがピンチに陥ったその時、見かねたトランクスが飛び出した！

ブウの隙をつき攻撃を加えるトランクスは、悟天と協力し、見事にベジータを救い出す！その間に、ピッコロがバビディを倒しはしたものの、肝心のブウはダメージを受けた様子もない・・・。倒す方法はただひとつ。覚悟を決めたベジータは、幼い2人を気絶させると、ピッコロに安全な場所まで連れて逃げるよう頼む・・・。

ブウをこの世から消滅させるため、そして愛する者を守るため、ベジータは自らの気をすべて体内に集中させ大爆発を起こす！周囲はまばゆい光に包まれ、その破壊力に世界中が震えた。バラバラになって吹き飛ばされる魔人ブウ・・・。ベジータの勝利を確信したその瞬間、あたり一面に飛び散った肉片が合体を始める！

復活したバビディが、ブウの力によって地球を蹂躙し始めたその頃、ブルマとビーデルたちは、ベジータが殺した武道会会場の観客を生き返らせるためにドラゴンボールを集めていた。願いを叶えるために必要な7個目は、なんと無人島の怪物が持っていた。ドラゴンボールを集めるため、ビーデルが怪物に立ち向かう！

悟空がメタモル星人から習った合体技フュージョンを使えば、ブウに対抗できるかもしれない！わらにもすがる思いのZ戦士たちだったが、フュージョンは、力や体格が、ほぼ同じ者同士でなければ使うことができない。そこで悟空は、体格も近く、底知れぬ力を持つトランクスと悟天の2人にフュージョンを教える！

ドラゴンボールの力で蘇ったキビトは、ブウとの闘いで瀕死の重傷を負った界王神、そして悟飯を見つけ、界王神界へ連れて行く。一方、ブウを使って地球を攻撃していたバビディは、全世界の人々にテレパシーでメッセージを送り始める。自分に逆らったピッコロと悟天、トランクスの3人の居場所を教えろというのだ！

3人を差し出さないと順番に町を滅ぼしていくというバビディに、世界中がパニックに陥る。その頃、界王神界では、悟飯が界王神から伝説の剣・ゼットソードの話を聞かされていた。ゼットソードを見事引き抜いた者には、絶大なパワーが与えられるというのだ！だが歴代界王神の中にも、引き抜いた者はいない・・・。

地上の仲間たちには死んだと思われている悟飯は、ゼットソードへの挑戦を始める。そして超サイヤ人になり、ついに界王神界で誰も抜いたことがない剣を引き抜いた！非常に重いゼットソードを使い、ブウを倒すため修行を始める悟飯。その頃、神の神殿で、トランクスと悟天がフュージョンの特訓を始めていた！

神の神殿でフュージョンの特訓をする悟天たちに、トランクスの家を見つけたという、バビディからのテレパシーが届く！すぐに出てこなければ、西の都もろとも破壊してしまうというのだ。ドラゴンボールを集めて町を復活させることはできるが、トランクスの家に置いてあるドラゴンレーダーがなくなってしまう！

トランクスがドラゴンレーダーを取ってくるまでの時間稼ぎのため、悟空はブウの前に立ちはだかった。バビディたちの気を引くため、これまでにフリーザとセルを倒した超サイヤ人の姿を順に披露してゆく。さらにパワーを上げ、超サイヤ人3に変身！その強大なパワーでブウを攻撃、ほぼ互角の戦いを繰り広げる！！

悟空とブウの全世界を震撼させる闘いは、なおも続いていた。トランクスがやっとのことでドラゴンレーダーを見つけ出すと、「2日後にもっと強ぇヤツが現れる・・・」と言い残し、悟空は瞬間移動でその場を立ち去ってしまう。残されたブウは、悟空を逃がしたことを非難するバビディに対して、恐ろしい行動に出る・・・！

支配者バビディを殺したブウは、気の向くままに地球を破壊し始める！一方、超サイヤ人3になり大量のエネルギーを消費したため、悟空がこの世にいられる時間はあと30分しかなくなってしまう！急いでトランクスと悟天にフュージョンを教え始める悟空だったが、そのポーズはめちゃくちゃカッコ悪かった・・・。

ブウは、人間をお菓子に変えて食べたり、粘土にして家を作ったりと、やりたい放題！早くフュージョンを覚えなければならないのだが、トランクスと悟天は、カッコ悪い合体ポーズがイヤで、どうも修行に身が入らない。そんな様子を見かねた悟空は、超サイヤ人3になり2人を説得。悟空が、あの世に帰るときが迫る・・・。

あの世の閻魔大王から、悟飯が生きていることを知らされた悟空は、気を探り界王神界へと瞬間移動、親子の再会を果たす。その頃、悟空にフュージョンの修行を任されたピッコロは、言うことを聞かない2人に手を焼いていた・・・。そしてブウは、気まぐれで盲目の少年の目を治すなど、不可解な行動をとり始めるのだった・・・。

修行を続ける悟飯に、悟空がゼットソードの切れ味を試してみようと言いだした。見事、巨大な岩を真っぷたつににし、続いて宇宙一硬いというカッチン鋼にチャレンジする悟飯。だが、カッチン鋼に振り下ろされたゼットソードは、ポキリと折れてしまう！予想外の事態に驚く一同の背後に、怪しげな謎の老人が現れる・・・。

トランクスと悟天が、いよいよフュージョンに挑戦！初めのうちは2人のポーズが微妙に合わず、何度も失敗を繰り返したものの、やっとフュージョン戦士ゴテンクスが誕生する！そのパワーに大喜びのゴテンクスは、超サイヤ人での合体をマスターしろというピッコロに逆らい、さっそくブウと闘おうとするが・・・。

ブウの破壊行為によって、地球人類の約8割が死んでしまったなか、残った人類の希望、ミスター・サタンがブウを退治へ向かう！？ いやいやながらブウの家に到着したサタンは、うまく取り入ったふりをしつつも、セコイ作戦を使いブウを倒そうとする。果たして、地球の未来を賭けたサタンの大作戦は、成功するのか？

ゼットソードから現れた老界王神の不思議な能力で、悟飯はパワーアップの儀式を受けることとなる。一方、超サイヤ人でフュージョンしたゴテンクスだが、調子に乗りすぎてブウと闘う前に時間切れ・・・！？そして、肝心のブウは、一緒に暮らすことになったサタンの言葉を聞いて、意外なセリフを口にするのだった・・・。

心ない2人組の手によって、ブウがかわいがっていた子犬が、ライフルで撃たれてしまう！怒ったブウが手を出す前に、サタンが2人を退治。ブウの能力によって子犬も回復した。一件落着かと思われたが、逆恨みするライフルの男にサタンが撃たれた！サタンのケガを治療する、ブウの体に異変が起き始める・・・。

すさまじい怒りによって、ブウの体が2つに分かれてしまった！そして、新たに生まれた純粋悪のブウと、元のブウとの一騎打ちが開始される。魔人同士の息詰まる闘いが続き、ついにはブウ（善）の変化ビームを、ブウ（純粋悪）が息で吹き返し、チョコにして食べてしまった！！すると、またもその体に変化が・・・！？

変化したブウは、ゴテンクスと闘うために神の神殿にやってきた！だが今のゴテンクスでは、ブウに勝てる見込みはゼロ・・・。ピッコロは時間稼ぎとして、人類を全滅させるという約束をブウに思い出させる。一方、界王神界では、老界王神のおふざけに怒った悟飯がすさまじい気を発し、パワーアップを実感していた。

なんとかブウに、1時間だけ待つという約束をさせたピッコロは、精神と時の部屋でトランクスと悟天を修行させる。修行はどうにか成功し、待ちきれずにいたブウを精神と時の部屋に連れて行く。ここなら、壊れても困る物は何もない・・・。いよいよ、ブウとゴテンクスの宇宙存亡を懸けた、全開最強バトルが始まった！！

修行によりパワーアップしたゴテンクスは、ブウに攻撃を炸裂させる。だが、全く効果はない様子・・・。そこでゴテンクスは、超サイヤ人となり、新たな技を操り出し始める！光の輪を使って相手を締めつけるギャラクティカドーナツは、ブウにたやすく破られ、ついにゴテンクスは究極の技を使おうとするのだが・・・。

ゴテンクスは驚きの必殺技、スーパーゴーストカミカゼアタックでブウに攻撃を仕掛ける！口から出したたくさんのオバケが、ブウに突撃し爆発！見事ブウは木っ端微塵に吹き飛んだ！！と思われたが、またも破片が集まり再生してしまう。絶望したピッコロはブウを精神と時の部屋に閉じ込めるため、扉を破壊・・・。

精神と時の部屋から出ることができず、もうお菓子も食べられないと思ったブウは激怒！その叫び声で次元に穴を空け、外に出てしまう！取り残されたゴテンクスとピッコロ・・・。ゴテンクスは、見よう見まねで超サイヤ人3に変身することに成功！ブウと同じく叫び声で、精神と時の部屋から脱出するのだが・・・！？

お菓子にされたブルマや仲間たちを食べられてしまい、怒りが頂点に達した超ゴテンクス3は、ブウに攻撃を開始！神の神殿を壊しながら戦いは続いてゆく・・・。連続スーパードーナツで、ついにブウを捕らえたゴテンクスは、それをボール状に・・・。そしてピッコロと一緒にブウをボールに見立てたバレーボールを始める。

超サイヤ人3で、激烈な攻撃を続けるゴテンクス。対するブウは一歩も譲らない。やがてゴテンクスの攻撃力がブウを圧倒し、とどめを刺せるかと思ったその時、超サイヤ人3への変身が解けてしまう！さらにフュージョンまでが時間切れで終了してしまい大ピンチ！希望は界王神界から地球に向かう悟飯へと託された！

絶体絶命のトランクスと悟天だったが、その目の前でブウは眠り始めてしまう・・・。不思議に思い、様子をうかがう2人のチビッコたち・・・。と、その時ブウを倒すため、悟飯が地球に到着した！パワーアップした悟飯と、その強烈な気に反応するブウとの死闘が開幕！圧倒的な力で、悟飯はブウを攻撃し続けるのだった！！

老界王神の力によってパワーアップした悟飯は、ブウを上回る力を発揮！悟飯に一方的にやられて、怒りが爆発寸前のブウは、いきなり立ちつくして全身をふるわせ始めた！悟飯の機転により、すんでのところで自爆からは逃げ出したものの、目の前に再生したブウが現れる！ゴテンクスと闘いたいと言うのだが・・・！？

ブウの言葉に、再びフュージョンするトランクスと悟天。超サイヤ人3に変身し、ブウと闘おうとした瞬間、ピンク色の物体がゴテンクスを包み込んでしまう。切り離した身体の一部を使って、ゴテンクスとピッコロを吸収する、ブウの作戦だったのだ！2人を取り込み、パワーアップしたブウが、悟飯に襲いかかる・・・！！

パワーアップを果たしたブウの前には、悟飯ですら苦戦を強いられる。界王神界からその闘いを見ていた老界王神は、悟空に自分の命を与えて生き返らせると宣言。また同じ頃、閻魔大王の目の前には、なんとベジータが・・・。ブウから地球を、そして全宇宙を救うため、ベジータを生き返らせようとしていたのだった・・・！！

老界王神の命を得て、悟空は見事に復活を果たす！そして老界王神は、自分が付けていたポタラというアイテムを悟空に渡すのだった。2つのポタラを、2人が1つずつ付けることで合体し、フュージョンのようにパワーアップできるというのだ！悟空はすぐさま地球へと瞬間移動し、悟飯と合体しようとするが・・・。

ブウに悟飯を吸収されてしまい、悟空は一気にピンチに陥ってしまう。だがその時、いきなり地球に現れた巨大な気！その正体は、閻魔大王によって生き返ったベジータだった！！悟空は瞬間移動によってベジータと合流して闘うが、やはりブウには敵わない・・・。そしてついに2人は、ポタラでの合体を決意する・・・！！

ポタラの力を使って、ついに合体を果たした悟空とベジータ！宇宙最強の究極戦士、ベジットが誕生する！！無数のエネルギー弾を放つブウではあったが、パワーにおいて完全に上回るベジットは、その攻撃をすべて跳ねかえしてしまう。そして、ブウを完全に叩きのめすために、ベジットは超ベジットへと変身する！！

超ベジットの放ったビックバンアタックによって、バラバラになってしまうブウ。またも再生を始めるブウだが、これまでとは違い、かなりのダメージを受けていた。あまりの強さに焦りを感じたブウは、隙をつきベジットの体内へ侵入！内部から破裂させようとするが、そんな攻撃はベジットに効くはずもなかった。

ゴテンクスのスーパーゴーストカミカゼアタック、ピッコロの魔閃光、悟飯のかめはめ波と、吸収した者たちの技を使って攻撃を始めるブウ。だが、ベジットは瞬間移動を使い、すべての技をかわしてしまう！追いつめられたブウはベジットに近寄り、いきなり変化ビームを浴びせベジットをアメ玉に変えてしまった！！

アメ玉にされ、ベジットも食べられてしまうのか・・・。と、思いきや、手も足もないアメ玉になってもその強さは変わらない！？小さなアメ玉に、コテンパンにやられてしまったブウは、しかたなくベジットを人間の姿に戻した。満身創痍のブウは、自分の体の破片を使って、ベジットを吸収しようと最後の賭けに出る！

ブウの作戦により、吸収されてしまったベジット。だがそれは、すでに吸収されてしまった者たちを救うための作戦であった。吸収される寸前に、バリアを張っていたベジットは、なぜかブウの体内で悟空とベジットに分離してしまう。ベジータは、2度とベジットにならないと、ポタラを外し、壊してしまうのだった・・・。

ブウの胃腸から頭の中へと移動した悟空とベジータは、吸収されてしまった悟飯、ピッコロ、トランクス、悟天たちを発見する。だが彼らは、2人に向かって攻撃を始める！2人は仲間たちに反撃することができず、ピンチに陥ってしまう。悟空たちを攻撃しているのは、ブウの記憶が作り出したニセモノだったのだ。

ブウの体の中で悟空とベジータは、ようやく本物の悟飯たちを発見する。仲間たちを肉でできた繭から助け出すと、ブウの姿は除々に元へ戻っていった。吸収されていた仲間の他に、ベジータはブウ（善）が捕らえられている繭を見つける。その時、体内にブウが出現し、サイヤ人対ブウの激しい闘いがスタートする！

ただの超サイヤ人ではブウのパワーに敵うはずもなく、危機に陥る悟空とベジータ。肉の繭に捕らえられたブウ（善）を流れ弾からかばうブウの不自然な動きに、ベジータが気付いた！なにか秘密があるはずだと直感した2人は、ブウの制止を振り切り繭をはがす！すると、再び魔人ブウの姿に変化が現れ始めた！！

子供のような姿になってしまった魔人ブウ。それを見た界王神は、はるか昔の魔導師ビビディとの闘いを思い出していた・・・。今の姿こそが、ビビディも手を焼いた、凶悪で残忍な本来の魔人ブウの姿だった！そして、凶暴な本性をむき出しにしたブウは、いきなり地球を破壊してしまう！巻き込まれた悟空たちは・・・！？

界王神の力により、悟空とベジータ、そしてサタンとデンデは界王神界に避難して無事だった！地球を破壊しただけでは怒りが収まらないブウは、多数の惑星を破壊し、ついには瞬間移動で大界王星に出現する！鬼神のようなブウを見て、戦慄するクリリンたち・・・。仲間の危機を知った悟空は、ブウをおびき寄せる！

界王神界を舞台に、ブウとの最終決戦の幕が切って落とされた！！信じられないことに、悟空とベジータはジャンケンで闘う順番を決めるという・・・。戦闘種族サイヤ人の本能、いや誇りなのか、こんな極限状況でも戦闘を楽しんでいるのか、2人とも2対1で闘う気は全くないのだ。最初に闘うのは、悟空に決まった！

悟空は超サイヤ人3に変身して闘うが、魔人ブウ（純粋）に対しては、それでも力不足だった。たまらずダウンしてしまった悟空に代わって闘うベジータだったが、とてつもないパワーを持つブウには敵わない。ベジータをかばい、再び悟空が立ち上がる！「カカロット、お前がナンバー1だ」、ベジータは思わず呟いた・・・。

闘いを続ける悟空だが、どんないダメージを与えても再生してしまうブウに大苦戦。決着をつけるためには、一気にパワーを放出し、完全に消滅させるしかない。1分間あれば、ブウを消滅させるだけの気を溜められる！そう言う悟空に、ベジータは自分が時間をかせぐことを決意。ベジータの長い1分間が始まる・・・。

悟空の気がなかなか溜まらず、ブウの攻撃を受け続けるベジータ！だがそこに、なんとサタンが登場！界王神界での出来事を現実だと信じられないサタンは、すべて夢だと思い込んでいた・・・。だがサタンの姿を見たブウは、突然苦しみ始め、口からブウ（善）を吐き出してしまう。そして、ブウ対ブウの闘いが始まった！

ベジータの体力も限界、悟空の超サイヤ人3の変身も解けてしまい、ブウ同士の闘いもブウ（純粋）が優勢となっていた。そこでベジータは、ナメック星のドラゴンボールでポルンガを呼び出し、地球を復活させて、地球の人々を生き返らせることを界王神に命令する。どうやらベジータには、作戦があるようなのだが・・・。

ベジータの作戦通り、悟空は地球の人々の元気を集め、史上最大の元気玉を作ろうとする！界王の力を借り、地球の人々にメッセージを送るベジータ。Z戦士とその仲間たちはすぐに協力してくれたが、事情のわからない他の地球人たちは協力しようとしない。このままでは、ブウを消滅させられる元気玉は作れない・・・。

ベジータの説得も地球人たちには通じず、元気玉はまったく大きくならない。元気玉に気付いたブウが悟空に迫る！たまらず悟空も叫ぶが、ほんの少しの元気玉しか集まらない・・・。すべては無駄に終わるのかと思ったその時、あの男が立ち上がった！地球の英雄、格闘技世界チャンピオン、ミスター・サタンその人が！！

ついに地球のみんなの元気を集めた元気玉が完成！だが、ブウと闘って力を使い果たしたベジータは、逃げることができない。自分にかまわずに撃てと言うが、ベジータを巻き添えにはしたくない・・・。だが、タイミングよくブウ（善）とサタンがベジータを救出！ブウに向けて、スーパー元気玉がいよいよ放たれる！！

元気玉によって、魔人ブウは完全に消滅した！！長い闘いは終わった！！ベジータは、残されたブウ（善）を殺そうとするが、サタンは必死でかばう。ブウは、サタンが引き取り、一緒に暮らすこととなった。半年が経ち、神龍により地球の人々からのブウの記憶が取り除かれ、地球には、平和な生活が戻ったのであった。

カプセルコーポレーションで、ブルマがパーティを開く。チチたちは先に行ってしまったが、悟空は恐竜のタマゴが気になり、なかなか出かけようとしない・・・。パーティには共に闘った懐かしい仲間たちが集まるが、主役の悟空がいないので、いまひとつ盛り上がらない・・・。そこに、恐竜の誕生を見届けた悟空が登場！

そして10年の歳月が流れ、悟空は久しぶりに天下一武道会に参加するという。悟空と決着をつけるためベジータも出場。会場には、たくさんの懐かしい仲間が集まった。今回は悟飯とビーデルの娘パンも、参加するのだ！予選が始まり、悟空にベジータ、悟天、トランクス、パンは、楽々と予選を突破するのだった。

天下一武道会決勝トーナメント出場者が、ついに出そろった。くじ引きをする悟空は、ブウに頼んで細工をし、ある少年と1回戦で対戦できるようにしてもらう。その少年の名はウーブ。彼こそ、魔人ブウの生まれ変わりであると悟空が感じていた。彼の力はどれほどのものなのか！？いよいよ、注目の一戦が始まる！

気の使い方も、空の飛び方も、何も知らないウーブだったが、悟空との試合で急速に闘い方を学び、なんと互角の試合をし始める！驚く観客、そして悟空の仲間たち・・・！悟空は途中で闘いを止め、ウーブに手を差しのべる。「オラが闘い方を教えてやるよ。」そしてウーブを背に乗せ、会場を飛び立つのだった・・・。