1st STAGEを制したジャイロだったが、武器による走行妨害と判定され、順位降格のペナルティを課せられてしまう。気を取り直して2nd STAGEでの勝利を目指すジャイロは、ジョニィに協力関係を持ちかける。一方、レースの裏では異常な殺人事件が起きていた。その捜査のため、レース参加者であり伝説のカウボーイ、マウンテン・ティムに白羽の矢が立った。不穏な空気を孕んで開幕する2nd STAGE。レースの先で2人に新たな脅威が待ち受ける。

砂漠での野営中、ジョニィはジャイロが抱える過去を垣間見る。そこへ現れたブンブーン一家に2人は包囲され、人智を超越した攻撃を受ける。機転で窮地を脱するも、それは巧妙な罠の入り口に過ぎず...。

ブンブーン一家の罠により、ジョニィとジャイロはマウンテン・ティムとともに、謎の磁力によって体を引き裂かれる危機に陥る。逃れられぬ状況で"スタンド"の存在が明かされ、ジョニィの体にも異変が。

中継地点に到着したジョニィたちの前に現れたのは、ジャイロの過去を知る男オエコモバだった。触れたものを爆弾に変える能力により、2人は逃げ場のない攻撃に追い詰められていく。