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走高跳の選手・佐野泉に憧れて、性別を偽り、アメリカから全寮制の男子校である桜咲学園に転入した少女・芦屋瑞稀。 同じクラス、さらには寮でも同室になった佐野と仲良くなろうと奮闘するが、彼がすでに走高跳をやめたことを知り、ショックを受ける。 翌日、体育の授業をきっかけに、学園一の俊足・中津にサッカー勝負を挑まれてしまった瑞稀は、勝負の最中に中津とぶつかって失神してしまい──。

保健室に運び込まれ、保健医の梅田に「女」であることがバレてしまった瑞稀。 梅田から男子校に転入した理由を聞かれるが、答えられないまま保健室をあとにする。 一方、瑞稀を抱き上げた際に「女」だと気が付いた佐野は、瑞稀を避けるようになる。 梅田の存在に不安になるうえ、佐野に避けられて落ち込む瑞稀だったが、佐野が女の子と口論しているのを見てしまい……⁉

佐野の幼なじみの理香から「泉にこれ以上近づかないでほしい」と言われてしまった瑞稀は、佐野が高跳びで優勝することにこだわる理香と口論になってしまう。 叩かれそうになったところを佐野にかばわれた瑞稀だったが、理香をどなりつけた佐野を責めて、喧嘩になってしまう。 佐野との関係がうまくいかず落ち込む瑞稀は、ジュリアに励まされ、なんとか佐野と仲直りしようと奮闘するが……。

もう一度跳ぶことを決意して陸上部に入部した佐野を、瑞稀は「練習中は見ない」という約束を守りながら応援し始める。 ある日、中津が出場するサッカー部の対抗試合の応援に行った瑞稀たちは、会場の桃郷学院で佐野の中学時代のライバル・神楽坂に呼び止められる。 神楽坂の挑発を気にする佐野だったが、瑞稀が裕次郎に「佐野を追いかけてきた理由」を話しているところを偶然聞いてしまい──。

突然キスをしてきた佐野をはねのけて部屋を飛び出した瑞稀は、予想外の出来事についていけず、涙が止まらなくなってしまう。 翌朝、何も覚えていない様子の佐野を避けてしまう瑞稀だったが、難波の話を聞いて、佐野が事故でお酒を飲んでしまったかもしれないことを知る。 そんな中、瑞稀は陰湿な嫌がらせを受ける。 気にしないよう努める瑞稀だったが、翌日も嫌がらせは続き……。

急遽、兄・静稀が来日することになり焦った瑞稀は、梅田に相談して女装用の服を手に入れ、静稀と再会する。 何とかその場を取り繕った瑞稀だったが、静稀が桜咲学園を訪れ、男子校に通っていることがバレてしまう。 静稀は、アメリカへの帰国を嫌がる瑞稀を見て、彼女が日本に残ることを認めるための条件を出す。

第2寮棟が改修工事をすることになり、夏休み中の2週間、寮を出なければならなくなってしまった瑞稀。 中津と佐野に実家に来るよう誘われるが、「女」であることがバレるのを恐れて躊躇してしまう。 行く当てがなく、梅田に頼ろうと保健室を訪れたところ、梅田の姉で難波の母・伊緒が経営する葉山のペンションで住み込みのバイトをすることに。事情を聞いた佐野と中津も同行することになり──。

神楽坂の妹・珠美が佐野にアプローチする様子を見て複雑な思いを抱く瑞稀は、きついベストを無理に着ていたせいでバイト中に倒れてしまう。 目覚めた後、従業員専用のお風呂でシャワーを浴びていたところ、鍵をかけ忘れた脱衣所に中津が入ってきてしまい──⁉ 一方で、佐野は瑞稀を「女」だと思って近づく大学生の蒔田を警戒し、瑞稀に忠告するが、蒔田をいい人だと思っている瑞稀と口論になってしまう。

珠美が佐野に告白しようとしていると知った瑞稀は、佐野が彼女のことをどう思っているのかが気になってしまう。 一方佐野は、蒔田が毎年女を替えていて、今年は瑞稀を狙っていることを耳にする。 そんな中、瑞稀は伊緒に着替えを見られ、「女」であることがバレてしまう。 事情を知った伊緒から忠告されたのもつかの間、瑞稀は一緒に買い出しに出た蒔田に告白され──⁉

学園祭の時期を迎えた桜咲学園。 学園祭は三寮の対抗戦で、優勝した寮には特別待遇が用意されると知って盛り上がる第2寮に、難波をライバル視する第1寮の天王寺たちが乗り込み、宣戦布告する。 寮の優勝をかけて、瑞稀は中央とともにミスコンに出場することに。さらに、天王寺にバカにされたことに腹を立てた瑞稀は、騎馬戦での勝負も受けて立ってしまう。 学園中が盛り上がる中、瑞稀は真剣な顔で悩む難波を見かけ──。

佐野・中津とともに騎馬戦で天王寺に挑む瑞稀だったが、第1寮生の肘打ちを受けて落馬させられる。 第1寮に目をつけられている様子の瑞稀を「見ておいてやらないと」と思った佐野は、自分の気持ちに戸惑いを覚えていた。 学園祭2日目を迎え、ミスコン参加者へのアンケートを取りに来た実行委員会から逃げ出した瑞稀は、難波が女性と言い争う様子を見てしまう。どうやら女性は難波の初恋の相手のようで──。

自分の背後に鉢植えを落としたのは九条ではないかと不安になり、眠れなくなってしまった瑞稀だったが、寝ぼけた佐野に引っ張られ、同じ布団で眠ることに。 学園祭3日目。中津は、第1寮の門真が他の誰かに「鉢植えを落として瑞稀を脅した」と話しているのを聞いてしまう。 危険が迫っていることを知り、佐野と中津は瑞稀を探すが、門真に呼び出された瑞稀は空手部員に捕まってしまい──⁉