古代文字に詳しいトレジャーハンター・炎のシャウト（楢原聖）は、古文書を読み解いては探検に飛び出し、古代遺物を発掘する日々を過ごしている。ある日そんなシャウトは、古代遺跡で《角醒器 オメガホーン》と《エゴルギア》を見つける。現代のハンターたちが使う角醒器とは違うオメガホーンに戸惑いながらも、エゴルギアをセットしてみると、角をもった巨大な角獣・炎角が現れた！ 炎角は、シャウトのエゴ（＝揺るがず己の道を貫く心）に“王”の資質を見出し、《キャプテン・オメガホーン》を名乗って自分とともに戦えと言いだして…!?

双子のハンター・剛胆のエイル（三浦舞華）と剛直のアル（加藤憲史郎）は、とある町で助けを求められる。なんと町の人々が、詐欺ハンターに宝をだまし取られているというのだ。エイルとアルは宝を取り返すため、詐欺ハンターにハンターバトルを挑むが、絶体絶命のピンチに。そこへ、シャウト（楢原聖）と炎角（国上将大）が駆け付け…。 そのころ絶暴のイバル（田鶴翔吾）率いるイバル連合は、暴れまわる武装ハンター集団を討伐するため、西の領地へ向かっていた…。

これまでのシャウト達の戦いを見ていたという波斬のギリコ（糸瀬七葉）がハンターバトルを挑んできた！しかし突然現れたイバル連合のハンターたちによってバトルは中断されてしまう。捕らえられたシャウト（楢原聖）とギリコは、「エゴルギア採掘場」へ連行されてしまう……。 採掘場では、多くの住民たちが苦しそうに採掘を強いられていた。シャウトはギリコと即席タッグを組み、イバル連合のハンターたちと2対2のバトルをすることになり……！

スコヴィラの住民たちを救ったことで、イバル連合と敵対することになりそうなシャウト（楢原聖）。大好きなトレジャーハントを邪魔するなら、ぶっとばすだけだと言い切る。そんな中、シャウトは、ギリコ（糸瀬七葉）と再びハンターバトルへ。このバトルに負けたら、炎角（国上将大）との“契約”は終わり!? そしてギリコには策があるようで… 一方、レイジ（長田光平）も、イバルに命じられハンターバトルをすることに――！！

シャウト（楢原聖）は、エイル（三浦舞華）＆アル（加藤憲史郎）と再会し、空を飛ぶ謎の角獣「謎角」についてたずねられる。謎角は角獣図鑑に載ってなく、炎角（国上将大）も知らないらしい。みんなで謎角を探そうとするが、アルだけはどこか浮かない顔で…。 やがて一行は、炎角が謎の匂いを嗅ぎつけた洞窟の中へ。そこにはイバル連合のハンターたちがおり、攻撃を受けたシャウトたちは動けなくなってしまう。大ピンチのなか、1人だけ無事なアルがハンターバトルに挑むが…!?

古代遺物を買い取ってもらうため、コウハの町にやってきたシャウト（楢原聖）。そこで、母親とはぐれたという少年・セーユ（眞野陸）と出会う。シャウトは、困っているセーユを放っておけず母親探しを始めるが、炎角（国上将大）とケンカになってしまい…!? やがて奇妙な洋館にたどり着いたシャウトは、町の領主でハンターの奇食のトウナ（松城凜）と出会うが、炎角不在のままハンターバトルに挑み大ピンチに…！

イバル領の温泉町を訪れたシャウト（楢原聖）と炎角（国上将大）。イバル（田鶴翔吾）に苦しめられている人がいないか探る中、炎角が不穏な気配を察知する。湯煙の向こうに姿を現したのは絶炎角（小西詠斗）。そのひと言から、炎角と絶炎角の衝撃的な事実が明らかになり…。 絶炎角についていったシャウトたちは、ついにイバルと対面。ハンターバトルに挑むが…!?

イバル（田鶴翔吾）とのハンターバトルに敗れ、気を失ったシャウト（楢原聖）。目覚めると、シャウトに興味を持ったという砕厄のゲンノウ（桜庭大翔）にハンターバトルを挑まれる。ゲンノウの強烈なハンマー攻撃に、シャウトは防戦一方で…。 そのころイバルは、ドクター・テクノ（永山たかし）が復活させた“古の発掘兵器”で実験を開始。レイジ（長田光平）に兵器を操縦させ、炎角（国上将大）と強制的に戦わせ…!?

ゲンノウ（桜庭大翔）とのバトルに敗れ、後がないシャウト（楢原聖）。しかし何かを掴んだ様子で、ギリコ（糸瀬七葉）たちと特訓。炎角（国上将大）を取り戻すため、イバル（田鶴翔吾）に再びハンターバトルを挑む。するとイバルは炎角に、シャウトと戦うように命令して…。シャウトはバトルに勝って炎角を取り戻すことができるのか!?

イバル（田鶴翔吾）を打ち破ったことから、立ち寄った村で歓迎されるシャウト（楢原聖）たち。そこへ、エイル（三浦舞華）とアル（加藤憲史郎）の幼馴染チャツミ（冨永実里）が助けを求めにきた。チャツミの父をはじめ村の男たちは、ハンター闘焜のズ・シン（佐藤祐吾）にさらわれ、強制労働させられているという。 チャツミたちを助けたいエイルは、キャプテン・エイルとなり、ズ・シンと“ヘル・ハンターバトル”に挑む！

長い間イバル連合と争っている、祝福の町インボカにやってきたシャウト（楢原聖）たち。住民たちをおどすイバル連合のハンターを倒したことで、町名主のウォーラン（松田賢二）から豪華な食事でもてなされる。さらには、町の用心棒としてスカウトされ…!? やがてシャウトは、レイジ（長田光平）に遭遇。偶然手に入れた“あるもの”を賭けて、ハンターバトルを繰り広げる！

絶炎角（小西詠斗）によって、バギンズ（喜矢武豊）がとんでもない姿にされてしまった。とある町で暴れまわるバギンズから人々を守るため、シャウト（楢原聖）たちが戦っていると、そこにギリコ（糸瀬七葉）が現れる。実はこの町は、ギリコが探している“明導のカンナ”の故郷・スノウだった。 さらにはスノウに、バギンズを取り締まろうと飛導のバーサー（光宗薫）も現れて…。“カンナを消した”というバーサーと、ギリコは因縁のハンターバトルに挑む。