まだ人とポケモンの間に隔たりがあった、遠い昔のおはなし。 「人とポケモンは、共には生きられない」 父にそう教えられていたアキオが、深い雪に覆われた森で出会ったのは、1匹のヒスイのすがたのゾロアだった……。

雪深い森で偶然出会った、アキオとヒスイゾロア。 ふたりの関係には、変化が起こり始めるが……。 「人とポケモンは、共には生きられない」 父の言葉の意味を、アキオは知ることになる。

幼少期に訪れたヒスイ地方に、再び足を踏み入れたアキオ。 その矢先、ヒスイ地方に異変が起こる。 傷ついたポケモンを目の当たりにし、助けたいと思うアキオだが……。 「人とポケモンは、共には生きられない」 これは、未来へと続く物語。