学校で居場所が無かった、地味な女子・小春（白石聖）の、唯一の趣味はプラモデルを作ること。こっそり生徒に隠れてプラモデルを作る保健の先生・守山薫（和田雅成）と熱く語っていると、生徒会長の松子（石井杏奈）が居合わせ、「くだらない」と一蹴されてしまう…。そしてある日、小春は学校帰りに立ち寄った不思議な骨董屋で、店長（濱田岳）から“人生を変える”というプラモデルを購入する。夢中で組み立てたその夜…、気づけば不思議なパラレルワールドに召喚されていて――!?　目の前には、小春が組み立てたプラモデルの「アリス」（大原優乃）!?　夢か現実か分からないまま、脱出不能のサバイバルゲーム「ガールガンファイト」が幕を開ける―。

突如パラレルワールドに召喚され、「ガールガンファイト」に参加することになった小春（白石聖）。翌日、現実世界の学校で、小春はチームメイトの夏菜（伊藤萌々香）や秋帆（出口夏希）からガールガンファイトの仕組みを教わり、打ち解けていく。そしてこれまでは無縁だった〝友情〟に触れ始める小春だが、夏菜と秋帆は小春にある大きな隠し事を抱えていた…。 一方、小春が保健室で守山（和田雅成）と話していると、そこには松子（石井杏奈）の姿が。依然としてプラモデルに対し、抵抗がある様子で…。また、無情にも今夜もパラレルワールドに召喚され、現実を噛み締める小春。各チームのコマンダー、アリス（大原優乃）、ビアンカ（寺本莉緒）、シャーロット（石田桃香）、デイジー（安藤咲桜）の指令の下、今宵も血みどろなサバイバルゲーム「ガールガンファイト」が始まり…。

「ラスイチ」だった水野（井頭愛海）がパラレルワールドで撃たれて絶命し、現実世界から存在が消えたことを受け、これはゲームではなく人殺しだと思った小春（白石聖）は銃を持つことが怖くなっていた。一方、ブラボータンゴには、水野に代わって新たに生徒会長の松子（石井杏奈）が、プレイヤーとして参加することになり、コマンダーのビアンカ（寺本莉緒）を差し置いて、指示を出し始め…!? また、小春は夏菜（伊藤萌々香）も「ラスイチ」だということを知り、夏菜を死なせないため、アリス（大原優乃）に、より強力な銃である「ブラストガールガン」を取りに行く作戦を提案。一方で各チームの思惑は重なり、熾烈な争奪戦が始まって―!?

「殺し合いをやめないか」と松子（石井杏奈）に提案した小春（白石聖）。コマンダーのアリス（大原優乃）の指示にも従わないと約束し、ある条件付きで了解を得ることに。そして、チャーリータンゴの一華（大原梓）と二葉（神南里奈）、三津恵（Hina）やデルタタンゴの北本（見上愛）、南（葵うたの）、東野（田辺桃子）にも現実世界で話を持ちかけた小春は、「ガールガンファイト」で殺し合いはしないとお互いに約束することに成功する。いざガールガンファイトが始まると、プレイヤー達の外れる光弾と異様な雰囲気に、アリスが気付き…!? 一方、プレイヤー達はファイト中にも関わらず教室に集い「誰も死なない記念のパーティ」を始めて…!?

松子（石井杏奈）から「ガールガンレディを信用するな」と言われた小春（白石聖）だったが、アリス（大原優乃）から過去にアルファタンゴのプレイヤーだった、まさみ（十味）の話を聞かされる。アルバムにあった当時の写真には、何やら見慣れない『プラモード』という戦闘方法が写っていて、ガールガンレディとプレイヤーの心が一つになった時にそれが発動すると夏菜（伊藤萌々香）と秋帆（出口夏希）から聞く小春だが…。 一方、敵チームであるデルタタンゴの東野（田辺桃子）から「ラスイチ」だと相談され、戸惑いを覚える小春。そして迎えた「ガールガンファイト」では、「ラスイチ」の夏菜をカバーしながら、フラッグを取りに行く作戦のアルファタンゴに、デルタタンゴの北本（見上愛）や東野が追い打ちをかけて絶体絶命の状況に―!?

保健の先生・守山（和田雅成）から不思議な骨董屋の奥に、倉庫があることを聞いた小春（白石聖）。秋帆（出口夏希）に相談し、陸上の全国大会を控える夏菜（伊藤萌々香）には内緒でこっそり潜入することに…。忍び足で店内に入る2人だったが、案の定、店長（濱田岳）にバレてしまい、担任の星宮（朝比奈彩）にも報告されて謝る仕舞いに…。ガールガンレディの秘密が倉庫にあると考えた2人は、「ガールガンファイト中に侵入しよう」と夏菜にも提案。そして、パラレルワールドでアリス（大原優乃）に話すが、学校を囲む“ビリビリ壁”を開ける方法がなかなか見つからず…。一方、松子（石井杏奈）は、ブラボータンゴのコマンダー・ビアンカ（寺本莉緒）ではなく、何故かアリスにある相談を持ち掛け―!?

不思議な店長（濱田岳）が営む骨董屋の倉庫に、ついに潜入した小春（白石聖）と秋帆（出口夏希）。その中は、まるで宇宙船のように広く、「ガールガンファイト」で絶命したプレイヤー達の姿が剥製のように並んだ異様な空間になっていた…。怒りがこみ上げる小春と秋帆の背後から、光弾が放たれ、そこには松子（石井杏奈）の姿が―。そして、アリス（大原優乃）はある決心をする…。また、現実世界では夏菜（伊藤萌々香）の存在が消され、悲しい現実が待ち構えていた。小春は、秋帆と共に倉庫を確認すべく、店長に会いに行くが、店の倉庫はただの物置になっており、謎は深まるばかり。 一方、パラレルワールドでは、アルファタンゴに夏菜に代わって新たなプレイヤーが追加されることになり―!?

新たにプレイヤーに加わった、夏菜の妹・冬美（伊藤萌々香）に「ガールガンファイト」について教える小春（白石聖）と秋帆（出口夏希）。アリス（大原優乃）を人間にし、チーム全員が生き残るためには、残りのファイトを全て勝ち、優勝することが必至になっていた。小春は「ラスイチ」になっていたが、アリスのためにも、全身全霊で戦うことを決める。そして、運命の最終決戦がついに幕を開ける――。 血みどろの戦いが行われる中、松子（石井杏奈）は2丁のブラストガールガンを連射し、小春を追い詰めていき…!?そして、銃を怖がっていた冬美にもある変化が―。

松子（石井杏奈）は、ガールガンレディだった…。過去の「ガールガンファイト」で優勝し、晴れてコマンダーから人間になれた松子だったが、新たな世界では、全く知らない記憶が作られていた。全てを告白した松子が、「最後の式典」の前に、生き残ったプレイヤー達にガールガンシステムを破壊できるという、プラモデル「ガールアーマー」を探そうと申し出る。小春らは、守山先生（和田雅成）が「ガールアーマー」を作ったM太郎だと疑い、星宮先生（朝比奈彩）にも協力を得て、聞き出そうとするが…？

全てが明らかになった。伝説のモデラ―M太郎が作り出した「ガールガンレディ」を買いそろえ、「ガールガンシステム」世界を作り出した、店長（濱田岳）。ついに、アリス（大原優乃）が人間になる儀式が始まるが、小春（白石聖）や秋帆（出口夏希）、冬美（伊藤萌々香）も不思議な力で拘束されて動けなくなってしまい…!? アリスは人間になれるのか、そして小春たちは生きて元の世界に戻れるのか―。 衝撃のラストが明らかに…。