北極での緊急任務から戻った研究医と親友は、感染症の検疫を受ける。異常は見られず帰宅を許可されるが、その後、恐ろしい異変が起こり始める。

マイケルが生き血を求めて逃走を続ける中、ルーサーは、非難の目と大きな損失のトラウマに苦しむ。特ダネをねらうケイリーが事件を追う。

犠牲者が増え続ける中、政府はウイルス感染の真の脅威を把握できず、対応に戸惑う。ダニカは姉を訪ねる。ケイリーはルーサーの先妻をインタビュー。

マイケルを生きたまま連行するよう、ルーサーは国家安全保障省と交渉。危険の中逃走を続けるマイケルにルーサーが接近。ダニカの衝動が高まっていく。

マイケル率いるグループは新たな本拠地に落ち着く。国家安全保障省にタフな将軍が就任。そんな中、ルーサーは地獄絵のような蛮行を目の当たりにする。

デズモンドの症状が悪化し、ルーサーは危険な選択を余儀なくされる。窮地に陥ったルーサーは思わぬオファーを受ける。マイケルがリーダーとして君臨。

デズモンドは自らの意思で母親に助けを求める。ダニカはマイケルに、より大きなスケールで考えるようアドバイス。ミラは単独で闇と闘う。

ルーサーは、社会を崩壊から救う計画に取り組もうとしている政府内部の人間と接触。エヴァは、DNSが運営する強制収容所の情報を収集する。

ルーサーの証言が世間を騒然とさせる。デズモンドとアメリーは、気味の悪い音を調べるため地下室へ。ダニカとマイケルは夜の街にくり出す。

政府は公式に停戦を宣言。だが一時の平穏も束の間、深刻な問題が勃発。人類とブラッド双方の存亡を脅かす新たな局面へと展開していく。