王女ユリアンをアブソリューティアンに奪われた宇宙警備隊は、ギャラクシーレスキューフォースとともに、奪還作戦の準備を始める。ウルトラリーグの面々は来るべき決戦に備え、特訓に励むことに。その頃、ニュージェネレーションヒーローズの戦士たちは新たな使命を帯び、宇宙各地で戦っていた・・・一方、ザ・キングダムでは、アブソリュートタルタロスがギナ・スペクターを復活させ、新たなる陰謀を企てていた。

ウルトラマンジョーニアスの助言に従い、己の本能を呼び覚ますべく、父・セブンと師・レオの激しい特訓に耐えるウルトラマンゼロ。メビウスのもとで、宇宙警備隊の訓練を積む中でウルトラマンナイス・ゼアス・ボーイたちと仲良くなったグリージョは、ボーイの誘いで、きれいな石のある場所へと向かうが、そこには・・・！

タルタロスの策略で、怪獣墓場で自らのダークネスを生み出されてしまったグリージョたちは窮地に陥る。絶体絶命のピンチに駆けつけたのは、トライスクワッドの呼びかけでザ・キングダムに立ち向かうべく行動をともにしたニュージェネレーションの戦士たちだった！彼らとともに、ゼアス&ナイスも勇気の心を燃え上がらせる！

卑劣なタルタロスの陰謀で、グア・スペクターに合体させられてしまったギナ。この強大な敵を前に、ニュージェネレーションヒーローズとウルトラマンゼットは最強の力を、再び解放する！激突する最強vs最凶！だが、まだこれは序章に過ぎなかった・・・タルタロスの陰謀の裏で、密命を帯びたアブソリューティアンの剣士・ティターンが暗躍する！

ティターンを阻止すべく、ウルトラフォースの3人が息の合ったコンビネーションで挑みかかる！だが、ティターンは1対多数をものともしない奮戦で互角の勝負を繰り広げる。その時、思いもよらぬ救援が・・・？！一方、厳しい修行を乗り越え、ついにウルトラマンゼロが、己の原初を覚醒させる時を迎えようとしていた・・・

惑星バベルに現れたウルトラマンネクサスは、ウルトラマンリブットとアブソリュートティターンを特殊空間メタフィールドに飲み込んで消えてしまった。さらにタルタロスも惑星バベルに向かい、ネクサスの力を巡る乱戦が激化する！急げ、ゼロ！己の野生を解放した紅蓮の姿(ワイルドバースト)で、この戦いに決着をつけるのだ！

ワイルドバーストの姿を会得し、ウルティメイトシャイニングの力を制御することに成功したウルトラマンゼロは、タルタロスたちを退けた。だがウルトラリーグが受けたダメージも深く、メタフィールドの戦いで消耗したリブットは、戦線を離脱してしまった。だがついに、ザ・キングダムの手がかりを掴んだウルトラリーグは、ユリアン王女レスキュー隊を危険な潜入ミッションへと派遣した！

ザ・キングダムに突入したレスキュー隊の前に、アブソリューティアンたちが立ちはだかる！ヒカリはツルギとなって、トレギアの正義の心を取り戻そうとするが…風雲急を告げる救出作戦！ユリアンの身に迫る危機を前に、目覚めよ・・・ウルトラマンレグロス！

激突する2つのコスモ幻獣拳！ウルトラマンレグロスの活躍でユリアンをザ・キングダムから取り戻すことに成功したウルトラリーグ。ランデブーポイントの惑星ブリザードで、究極vs絶対、史上最大の衝突が繰り広げられる！

激闘の中で、ベリアロクと共に新たな力に目覚めたウルトラマンゼット、ジードとの戦いに何かを見出したベリアル、タイガの魂の叫びを聞き、去っていくトレギア…時空を超えて運命は再び動き出した。種の存続を賭けて、渦巻く運命を背負ったアブソリュートタルタロスは、決意の一撃を放つ。