富裕層が暮らすピルトーヴァーで盗みを働いた孤児の姉妹ヴァイとパウダー。それが、2人が暮らす地下都市ゾウンに厄介なトラブルを呼び寄せることに。

科学を使った魔法の実現を夢見る発明家ジェイスは、師の忠告に逆らい、理想を追い続ける。悪名高い犯罪者のシルコは、危険な物質の実験を行う。

深い因縁をもつ2人が繰り広げる死闘。その先には、ゾウンの未来を決める運命の瞬間が待ち受けていた。すべてを賭けて研究を続けるジェイスとビクター。

"進歩の日"を祝うピルトーヴァーの街で、これからどうすべきかを考えるジェイスとビクター。ゾウンの住民が再びピルトーヴァーに現れ大暴れする。

執行官のケイトリンは、シルコの情報を得るため地下の街に潜入する。ピルトーヴァーの根深い腐敗を一掃するため、行動を起こすジェイス。

魔法のような発明が急速に進化を遂げる中、強力な後ろ盾を受けた若き議員は評議会で公然と恩師に歯向かう。追われるヴァイは、自らの過去に向き合う。

ゾウンの裏通りで思わぬ味方を得たケイトリンとヴァイ。その行く手に共通の敵が立ちはだかる。追い詰められたビクターは、危険な決断を下す。

自分を追放した実母と再会したメルは、武器を造ることについて意見を戦わせる。意外な人物と手を組むヴァイ。ジンクスの体に大きな変化が起こる。

戦争を回避するため、最終的な和平交渉を行うピルトーヴァーとゾウン。だが緊迫の時間が招いた事態が、2つの都市の運命を大きく変えることになる。