世界初のキャンプの参加者に選ばれ、5人の少年少女とともにイスラ・ヌブラルを訪れたダリウス。生きた恐竜と過ごす、夢のようなキャンプが幕を開ける。

他のメンバーが遺伝子ラボを見学している間に、ケンジに連れられて秘密のトンネルに入りこんだダリウス。その先には、思わぬ危険が待ち受けていた。

島の反対側に移動する恐竜たちの群れについていくことになったダリウスたち。ジャイロスフィアに乗りこむまではよかったが、雲行きがあやしくなり...。

勝手にキャンプを抜け出した6人は、逃げ出した恐竜に追いかけられてしまう。大ピンチの中、ダリウスは父と交わした約束のことを思いだす。

インドミナスに追われて逃げ込んだ遺伝子ラボで、あやしい科学者に出会ったダリウスたちは、そこでウー博士にまつわるおどろきの事実を聞かされる。

サミーの秘密に大きなショックを受ける仲間たちの前に現れたのは、逃げ出したプテラノドンの大群。その攻撃を逃れるため、島の地下を目指すことに。

ラグーンからモノレールに乗りこむために必死に走るダリウスたち。さらなるトラブルが発生し、ベンは恐怖心を乗り越えるチャンスを与えられる。

最終フェリーの出航時間まであとわずかとなり、ダリウスたちは必死にメインドックを目指す。間に合わなければ、島に取り残されることになるが...。