トムとジェリーがドロシーと一緒に竜巻に巻き込まれて迷い込んだのは、おとぎ話の「オズの魔法使」の世界！ いつもはケンカばかりの2匹だけれど、力を合わせて元の世界に戻ることができるのか？

魔法の国・オズの都からカンザスの農場に帰って来て安心していたドロシー、トム、ジェリー。すると、オズの仲間のかかし、ブリキ男、ライオンが「ノーム王がオズを支配しようとしているので助けてほしい…

カンザスの農場でエムおばさんとヘンリーおじさん、そして愛犬のトトと共に暮らす少女・ドロシー。ある日農場を巨大な竜巻が襲い、気を失ったドロシーは家もろともオズの国へと運ばれていく。再び彼女が…